| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 432,993 | A→T | 8.3% | intergenic (+18/+29) | PP_0355 → / ← glcB | two‑component system response regulator/malate synthase G |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 432,993 | 0 | A | T | 8.3% | 208.3 / 7.8 | 72 | intergenic (+18/+29) | PP_0355/glcB | two‑component system response regulator/malate synthase G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/33); new base T (2/4); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.10e-01 | |||||||||||
GTGTCGGGCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAACGCCACGTT > NC_002947/432847‑433141 | gtgtCGGGCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTaa > 2:76850/1‑148 (MQ=255) tggcGGGCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGGCGGTGGAGCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTaaaa < 1:118204/146‑1 (MQ=255) tCGGGCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACg > 2:158692/1‑149 (MQ=255) ggCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTc < 1:158692/149‑1 (MQ=255) gCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTTTTACGGTcc < 2:163822/149‑1 (MQ=255) cGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGAACCGTTTTACGGTccc < 1:230096/149‑1 (MQ=255) acacCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTTTTACGGTccccc < 4:313678/149‑1 (MQ=255) gtgGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGgcag > 2:158329/1‑147 (MQ=255) ggAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGgcag > 3:352114/1‑145 (MQ=255) gAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGAt > 1:363150/1‑149 (MQ=255) gAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGAGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGTTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGAt > 7:309806/1‑149 (MQ=255) gagGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGATCGATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGAtgc < 1:76850/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGAtgctgc > 2:97249/1‑149 (MQ=255) gCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATgctgct < 2:40877/149‑1 (MQ=255) gATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGGCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACaa < 1:359090/148‑1 (MQ=255) gATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGtt < 4:239048/149‑1 (MQ=255) aTGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTa > 2:39221/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGCAAAGGGGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAAGGGAAATTTGGAT‑GATCCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCATGCCAGCAGATCATGATTACACCCCGTTA‑c > 1:87845/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCg > 7:342247/1‑144 (MQ=255) gCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCg < 8:342247/144‑1 (MQ=255) gCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑cg > 4:264107/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGTGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑cgcg > 1:105098/1‑149 (MQ=255) ggggTGGTTTAGTTCGTGCTCAAGCCGGTTGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGATTTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTTGAT‑GATGCGCGAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCtt < 6:115340/148‑1 (MQ=255) ttCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTTTTACGGTCCCCCTGgc < 5:123565/103‑1 (MQ=255) ttCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTTTTACGGTCCCCCTGgc > 6:123565/1‑103 (MQ=255) ttCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGgcag < 5:167706/105‑1 (MQ=255) ttCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGgcag > 6:167706/1‑105 (MQ=255) ttCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGa > 5:293743/1‑149 (MQ=255) ttCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGa > 6:212678/1‑149 (MQ=255) ccTGCTACAGCCGGTGGATCTGGGC‑AACCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGAc < 6:196247/148‑1 (MQ=255) gCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGAcggcg > 7:186619/1‑149 (MQ=255) aGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTg > 1:372874/1‑147 (MQ=255) gTGGATCTGGGG‑AAGCTGTTGGTTCTGGTTTACAAAGAAGTGATAATTGGAT‑GATGCGCCAGGTGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGGAGATGCTTCTTACATCCTGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGATGTGCAGTAcc < 8:309806/149‑1 (MQ=255) gTGGATCTGGGC‑AAGCTTTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTAcc < 2:374609/149‑1 (MQ=255) gTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTTGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTg < 5:88936/142‑1 (MQ=255) gTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTg > 6:88936/1‑142 (MQ=255) gTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTAcc > 4:168401/1‑149 (MQ=255) gATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTACCGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCg < 1:254647/148‑1 (MQ=255) gggC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCgg > 7:3229/1‑148 (MQ=255) ggC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCgg < 4:112279/147‑1 (MQ=255) ggC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGt < 1:158329/148‑1 (MQ=255) gAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGt > 5:356672/1‑149 (MQ=255) aGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCACCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGtt < 1:97249/149‑1 (MQ=255) tGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTcgcg > 6:256133/1‑105 (MQ=255) tGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTcgcg < 5:256133/105‑1 (MQ=255) gTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttgctt < 2:87845/148‑1 (MQ=255) cAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttgctt > 1:155376/1‑143 (MQ=255) cAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttgctt < 2:155376/143‑1 (MQ=255) aGAACTGAAAATTGGAT‑GATGTGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGGGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTc < 2:105098/149‑1 (MQ=255) gAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTcc < 5:212678/149‑1 (MQ=255) gAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTc > 5:169221/1‑148 (MQ=255) gAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCtt < 6:165458/80‑1 (MQ=255) gAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCtt > 5:165458/1‑80 (MQ=255) gAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttgctt > 5:372943/1‑134 (MQ=255) gAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttgctt < 6:372943/134‑1 (MQ=255) aaTTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATaa > 4:371922/1‑117 (MQ=255) aaTTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATaa < 3:371922/117‑1 (MQ=255) aaTTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAg > 2:245118/1‑149 (MQ=255) aTTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACGACCAGt > 4:279594/1‑149 (MQ=255) ggAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTc > 4:254414/1‑148 (MQ=255) ggAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTc < 8:3229/148‑1 (MQ=255) ggAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTc < 3:279594/148‑1 (MQ=255) ccAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttg > 1:64265/1‑114 (MQ=255) ccAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGttg < 2:64265/114‑1 (MQ=255) ccAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCt < 6:293743/149‑1 (MQ=255) ccAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCt > 3:343706/1‑149 (MQ=255) aGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCt > 3:205519/1‑147 (MQ=255) aGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCt < 4:205519/147‑1 (MQ=255) aGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTgg < 2:114022/149‑1 (MQ=255) ggggACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGaa < 4:343706/149‑1 (MQ=255) gggACCGTTTTACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAAc > 3:131105/1‑149 (MQ=255) gggACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAAc < 2:363150/149‑1 (MQ=255) ccGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAACGCCa < 8:186619/149‑1 (MQ=255) tAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAACGCCACGt > 5:364311/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAACGCCACGtt > 3:148246/1‑149 (MQ=255) | GTGTCGGGCGACACCGATGTGGAAGAGGCAGTGGATGTGATGCACCTGGGGGTGGTGGACTTCCTGCTCAAGCCGGTGGATCTGGGC‑AAGCTGTTGGAGCTGGTGAACAAAGAACTGAAAATTGGAT‑GATGCGCCAGGGGGACCGTAAAACGGTCCCCCTGGCAGCAGATGCTGCTTACAACCCGTTA‑CGCGCCTTGAACTCGCGGCGACGGCGGTGCAGTACCGGCTCGGTATAACCGTTCGGTTGCTTGCCACCTTCCACTACCAGTTCCACAGCCGCCTGGAACGCCACGTT > NC_002947/432847‑433141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |