| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,982,226 | T→C | 5.7% | D957D (GAT→GAC) | PP_5242 → | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,982,226 | 0 | T | C | 5.7% | 206.8 / 2.2 | 71 | D957D (GAT→GAC) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base C (2/2); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
GCTACTGCACGGCGTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGG > NC_002947/5982079‑5982371 | gCTACTGCACGGCGTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATc > 1:12180/1‑149 (MQ=255) cACGGCGTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGAc < 8:186866/146‑1 (MQ=255) cACGGCGTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGAc > 7:186866/1‑146 (MQ=255) aCGGCGTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAgc < 8:48279/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCa > 6:172214/1‑142 (MQ=255) gTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCa < 5:172214/142‑1 (MQ=255) gTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCgct < 5:382447/149‑1 (MQ=255) cccTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTACCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGACCTGACCAGCGCGctgctg > 1:247415/1‑148 (MQ=255) cccTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTACCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGACCTGACCAGCGCGctgctg < 6:174358/148‑1 (MQ=255) cccTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTACCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGACCTGACCAGCGCGctgctg < 2:247415/148‑1 (MQ=255) cccTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTACCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGACCTGACCAGCGCGctgctg > 5:174358/1‑148 (MQ=255) gcagcaCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGccc < 7:340047/147‑1 (MQ=255) gcagcaCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCt < 7:107258/148‑1 (MQ=255) gcagcaCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTg < 1:112798/149‑1 (MQ=255) cagcaCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTgg < 3:333704/149‑1 (MQ=255) gcaCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGAt > 7:319369/1‑149 (MQ=255) aCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGAt > 3:255552/1‑147 (MQ=255) aCCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGAt > 5:47669/1‑147 (MQ=255) ccTACTGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGTCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAg < 5:43610/149‑1 (MQ=255) ccTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAg < 3:197837/149‑1 (MQ=255) cTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAgg > 7:266811/1‑149 (MQ=255) tACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGt > 3:173374/1‑149 (MQ=255) gCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAgc > 5:299172/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCt < 3:224537/148‑1 (MQ=255) gTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCt < 5:225610/126‑1 (MQ=255) gTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCt > 6:225610/1‑126 (MQ=255) cGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGc < 7:194847/149‑1 (MQ=255) gatgatTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATg > 5:221392/1‑148 (MQ=255) gatTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGACAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAAt > 6:241310/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGccc > 7:298011/1‑148 (MQ=255) gAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGccc > 1:343144/1‑148 (MQ=255) gCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGAc < 8:319369/149‑1 (MQ=255) cgcTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCgcgc < 5:113606/149‑1 (MQ=255) ttACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTg > 2:4187/1‑148 (MQ=255) tagcATGTTGGCCATGCCTGTTGCCTGGCAGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTgg < 4:255552/145‑1 (MQ=255) ccATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAc < 8:298011/148‑1 (MQ=255) atgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAcgcg > 1:9710/1‑149 (MQ=255) atgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAcgcg > 6:89016/1‑149 (MQ=255) tgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAcgcg > 5:130706/1‑148 (MQ=255) tgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAcgcg < 6:130706/148‑1 (MQ=255) atgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGACAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGt < 5:241310/148‑1 (MQ=255) atgGCCATGCCTGTGGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGt < 8:290689/148‑1 (MQ=255) tgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTc < 6:47669/148‑1 (MQ=255) gCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGAc > 6:357804/1‑149 (MQ=255) aTGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGAGCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCg < 7:161612/149‑1 (MQ=255) tGCCTGTTGCCTGGCCGCGCCCACGCTGAGCGACG‑GGCACGGTTTCGACGCTTATCTGACCAGCGCGCTGCGGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCAGGCAATGCGCCCTACGTCCCGCGCTGGCCGCGGTCGACTCgg < 4:173374/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGgc > 7:87225/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCt > 1:179601/1‑147 (MQ=255) cTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACACGCCGCCCCtca > 1:16335/1‑147 (MQ=255) cTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAg > 3:73061/1‑149 (MQ=255) gcTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGCCTCGGCGCGCCTGAGCGGTGAcc > 7:248384/1‑149 (MQ=255) tCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCt < 5:232715/112‑1 (MQ=255) tCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCt > 6:232715/1‑112 (MQ=255) tCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTg > 1:104927/1‑149 (MQ=255) aaGCTGATCTAAC‑GGCACGGTTTCGACGCGGTTCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTg < 4:125118/147‑1 (MQ=255) aaGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTgg < 6:348257/148‑1 (MQ=255) aaGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGc > 3:96031/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGGTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGAt < 6:299172/149‑1 (MQ=255) gATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGAt > 1:172701/1‑147 (MQ=255) atcgatc‑gGCACGGTTTGGACGCTGATCTGACCCGCGCGCTGCTGGCGCTGGATCAGGTCTGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGa < 7:354113/148‑1 (MQ=255) gAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGCgctg > 2:111538/1‑149 (MQ=255) aaC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAgctgc < 4:96031/149‑1 (MQ=255) ggCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTAt > 4:259574/1‑149 (MQ=255) cACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGc > 5:174840/1‑149 (MQ=255) cACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGc < 2:9710/149‑1 (MQ=255) aCGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGc > 8:122108/1‑122 (MQ=255) aCGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGc < 7:122108/122‑1 (MQ=255) gTTTCTACGCTGAGCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGc < 6:222915/149‑1 (MQ=255) tCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCaa < 2:104927/148‑1 (MQ=255) gACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGTTATGCCTGCAacca > 7:262642/1‑149 (MQ=255) tGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTgg > 6:307581/1‑149 (MQ=255) | GCTACTGCACGGCGTTGCCCCTGGCAGCACCTACGGCATGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAAC‑GGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGG > NC_002947/5982079‑5982371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |