Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 441,558 | C→G | 5.8% | R147G (CGC→GGC) | bioF → | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 441,558 | 0 | C | G | 5.8% | 224.1 / 4.1 | 69 | R147G (CGC→GGC) | bioF | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/30); new base G (2/2); total (37/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 |
GCGCGCCCTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGC > NC_002947/441413‑441706 | gcgcgcCCTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCt < 8:117971/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCCTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCt < 7:74607/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTAc < 5:20894/149‑1 (MQ=255) cccTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTg > 7:100235/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACAGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTg > 5:218453/1‑148 (MQ=255) cTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGca < 4:313840/149‑1 (MQ=255) cTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGca < 3:282751/149‑1 (MQ=255) tgttgtTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGca > 2:203203/1‑148 (MQ=255) cACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTTCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAAGCGCTACCTGCACAACGAccctg < 3:81982/149‑3 (MQ=255) aCCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGc > 3:297309/1‑149 (MQ=255) cTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGcc < 6:149349/149‑1 (MQ=255) atGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACTGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTgg < 3:328199/148‑1 (MQ=255) ggCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGc > 6:291942/1‑147 (MQ=255) ggCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGc > 3:86727/1‑147 (MQ=255) gCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCGGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAg > 3:229813/1‑149 (MQ=255) tGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCGTGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCtt > 4:93709/1‑148 (MQ=255) tGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTg > 8:253265/1‑149 (MQ=255) ggCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTg < 8:100235/147‑1 (MQ=255) gcgcCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTAGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑Ga > 2:374941/1‑148 (MQ=255) cgcCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GAc > 8:263094/1‑148 (MQ=255) ccATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAg < 6:218453/149‑1 (MQ=255) tCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACGGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCg > 3:114267/1‑149 (MQ=255) tCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACGGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCg > 3:109062/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTc > 2:29437/1‑149 (MQ=255) cgcgCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCGTGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTT‑GTCCAGGCggctg < 3:93709/149‑4 (MQ=255) gcgcTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTC‑GACAAGgcgggcgg > 6:262288/1‑149 (MQ=255) gACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGAc < 1:29437/149‑1 (MQ=255) acGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGa > 6:244530/1‑149 (MQ=255) ggTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATg < 4:229813/149‑1 (MQ=255) tATTGCAAGACCGCCTCATCCATGCCTCGTTTCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGc < 8:313943/149‑1 (MQ=255) tATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGc < 4:86727/149‑1 (MQ=255) tATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGc < 7:263094/149‑1 (MQ=255) ttGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCgt < 5:380586/149‑1 (MQ=255) cAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGtt > 2:114495/1‑149 (MQ=255) cAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGtt < 8:301053/149‑1 (MQ=255) aaGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GAc < 1:304858/107‑1 (MQ=255) aaGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GAc > 2:304858/1‑107 (MQ=255) gACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAg < 7:253265/149‑1 (MQ=255) ccTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATg > 2:158068/1‑148 (MQ=255) aaCCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGAc < 4:297309/147‑1 (MQ=255) aaCCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACgg > 8:291446/1‑149 (MQ=255) aaCCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACgg > 1:32917/1‑149 (MQ=255) aaCCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACgg > 2:58362/1‑149 (MQ=255) aaCCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGACAGCCTGGCCAGCCGCCTGCGACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACg < 1:289152/149‑1 (MQ=255) aCCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGt < 5:291942/149‑1 (MQ=255) cATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCCGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGa > 6:268038/1‑149 (MQ=255) aTGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACGGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGAc < 4:109062/149‑1 (MQ=255) aTGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACGGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGAc < 4:114267/149‑1 (MQ=255) gCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCgt > 3:150197/1‑128 (MQ=255) gCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCgt < 4:150197/128‑1 (MQ=255) ccTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCTGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTg < 6:372945/149‑1 (MQ=255) cTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTgg > 6:170931/1‑149 (MQ=255) tCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGc > 4:35381/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGa > 6:219916/1‑149 (MQ=255) tGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTg > 7:304566/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCgg < 1:58362/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAATGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTgg < 6:185611/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTgg > 4:215297/1‑149 (MQ=255) cTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCaa > 6:28773/1‑149 (MQ=255) cTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCaa < 7:291446/149‑1 (MQ=255) gtgCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGcc > 8:164522/1‑149 (MQ=255) gtgCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGcc > 6:20936/1‑149 (MQ=255) gtgCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGcc > 6:205009/1‑149 (MQ=255) cccGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGt > 2:361758/1‑149 (MQ=255) cccGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGt > 6:298128/1‑149 (MQ=255) cGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATg > 3:215731/1‑102 (MQ=255) cGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATg < 4:215731/102‑1 (MQ=255) ttCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGt > 7:28294/1‑137 (MQ=255) ttCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGt < 8:28294/137‑1 (MQ=255) cGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGAGCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGAACTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGACGCCCGTGCCCGCGGTGc > 4:20587/1‑149 (MQ=255) cGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGc > 7:212151/1‑149 (MQ=255) cGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGc > 4:152260/1‑149 (MQ=255) | GCGCGCCCTGTTGTTCTCCACCGGCTATATGGCCAATCTGGGCGCCATCACCGCGCTGGTGGGGCAGGGCGACACGGTATTGCAAGACCGCCTCAACCATGCCTCGTTGCTGGATGGCGGGTTGCTCAGTGGTGCCCGCTTCAACCGCTACCTGCACAACGACCCGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCTG‑GACAAGGCGGTCGGCAATACCCTGGTGGTGACCGATGGCGTGTTCAGCATGGACGGTGACCTGGCCGACCTGCCGGCGCTGGCCAATGTCGCCCGTGCCCGCGGTGC > NC_002947/441413‑441706 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |