| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,061,264 | G→A | 7.4% | A35V (GCC→GTC) | hupA ← | DNA‑binding protein HU‑alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,061,264 | 0 | G | A | 7.4% | 237.2 / 7.1 | 81 | A35V (GCC→GTC) | hupA | DNA‑binding protein HU‑alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/34); new base A (4/2); total (45/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.52e-01 | |||||||||||
TTCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGTGCT > NC_002947/6061120‑6061409 | ttCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTAGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GCCCTGGACAAGGACAcc < 2:335402/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCAGGCTTGACCGCCACGGGAGTGCTGGCCTGGATCTTGACCGGTGCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCg < 4:136662/149‑1 (MQ=255) aGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGc < 8:144004/149‑1 (MQ=255) ttGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCATTGTCAAGGGCACCGGTGATGCTGTc > 8:150031/1‑149 (MQ=255) ccACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATc < 3:155953/149‑1 (MQ=255) cACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATcg > 6:107526/1‑149 (MQ=255) cACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATcg > 2:96448/1‑149 (MQ=255) aCGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATcgc > 1:353767/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCaaaa > 6:161738/1‑149 (MQ=255) gCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGGCCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAAc < 1:265269/147‑1 (MQ=255) gCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCt > 1:332934/1‑148 (MQ=255) cTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGAt > 6:369630/1‑149 (MQ=255) ttGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGAtt > 8:231116/1‑149 (MQ=255) gATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGAtt < 2:353767/147‑1 (MQ=255) cTTGACAGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCt > 5:267282/1‑149 (MQ=255) tGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCttt > 2:12855/1‑149 (MQ=255) gACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCTCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACAGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGcc < 5:233982/145‑1 (MQ=255) gACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCtttt > 3:265346/1‑149 (MQ=255) gACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTAAGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATAGCGTTCAAAACCTGATTGGCCtttt > 5:220403/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTcc < 6:267282/149‑1 (MQ=255) cGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCt < 1:12855/149‑1 (MQ=255) cGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCt < 2:142786/149‑1 (MQ=255) gTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTg < 5:143764/149‑1 (MQ=255) gTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTg < 5:107526/149‑1 (MQ=255) ccccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt < 6:254563/148‑1 (MQ=255) cccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt > 1:86394/1‑147 (MQ=255) cccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt > 5:173479/1‑147 (MQ=255) ccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt > 1:27478/1‑146 (MQ=255) gCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGcc > 3:102685/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGc < 3:142973/148‑1 (MQ=255) gggTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCt > 1:91458/1‑148 (MQ=255) cTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCg < 1:96448/148‑1 (MQ=255) ttGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGc > 6:338283/1‑149 (MQ=255) gCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCgg < 2:346149/146‑1 (MQ=255) gcACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACggcggc > 6:206640/1‑149 (MQ=255) cgcgATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTc > 1:51914/1‑116 (MQ=255) cgcgATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTc < 2:51914/116‑1 (MQ=255) tGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTgg < 5:161738/149‑1 (MQ=255) cGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGttt > 2:205883/1‑149 (MQ=255) gTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTg > 1:144147/1‑149 (MQ=255) tttCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTgcg > 8:242533/1‑148 (MQ=255) tCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCa > 7:251625/1‑148 (MQ=255) tCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCa > 2:253966/1‑148 (MQ=255) gAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAg > 4:194136/1‑149 (MQ=255) tGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAg > 6:86217/1‑149 (MQ=255) cGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACggcggc < 2:192/121‑1 (MQ=255) cGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACggcggc > 1:192/1‑121 (MQ=255) cGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCct > 1:208110/1‑149 (MQ=255) gAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCTGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCctc > 7:165973/1‑149 (MQ=255) aaCCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCtt > 8:255789/1‑149 (MQ=255) cGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGa < 7:231116/149‑1 (MQ=255) gACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGAc > 4:283690/1‑149 (MQ=255) gACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGAc < 5:253372/149‑1 (MQ=255) gACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGAc < 2:27478/149‑1 (MQ=255) aCCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACg > 4:294535/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGTCACAGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACg > 1:319093/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGTCACAGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACg > 1:324169/1‑149 (MQ=255) gggTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAAt > 1:351593/1‑149 (MQ=255) ggTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAAtt > 6:317200/1‑149 (MQ=255) ggTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAAtt < 3:294535/149‑1 (MQ=255) caccGGT‑GCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCt > 5:196162/4‑149 (MQ=255) cACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGt < 6:156724/115‑1 (MQ=255) accGGT‑GCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCtt > 8:152735/3‑149 (MQ=255) ccGGT‑GCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCa > 5:353719/2‑76 (MQ=37) ccGGT‑GCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCa < 6:353719/75‑1 (MQ=37) aCGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCtt < 8:165973/148‑1 (MQ=255) ggT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCttgtt < 5:206640/149‑1 (MQ=255) ggT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCttgtt < 4:265346/149‑1 (MQ=255) ggT‑GCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCTTAGTGAAGCGTCTTTGAGGGAATTCttgtt > 2:267855/1‑149 (MQ=255) tCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCctct > 3:147733/1‑128 (MQ=255) tCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCctct < 4:147733/128‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTAt < 2:324169/148‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTAt < 2:319093/148‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTAt < 2:91458/148‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATg > 4:195391/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGcc < 7:242533/148‑1 (MQ=255) tCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGcctt > 4:22210/1‑147 (MQ=255) aGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCttgtt > 1:218481/1‑136 (MQ=255) aGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCttgtt < 2:218481/136‑1 (MQ=255) aGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGtgct < 4:102685/149‑1 (MQ=255) aGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGtgct < 6:173479/149‑1 (MQ=255) | TTCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGAAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGT‑GTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGTGCT > NC_002947/6061120‑6061409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |