| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,063,465 | G→C | 5.2% | L118L (CTG→CTC) | ubiC → | chorismate pyruvate‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,063,465 | 0 | G | C | 5.2% | 246.1 / 3.1 | 77 | L118L (CTG→CTC) | ubiC | chorismate pyruvate‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/39); new base C (2/2); total (36/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
GCATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACCTGCTG > NC_002947/6063320‑6063612 | gCATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGc > 2:273933/1‑149 (MQ=255) cATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGc > 4:193095/1‑148 (MQ=255) gCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAgc < 1:278106/148‑1 (MQ=255) tGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGAATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAgctgc > 1:61850/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGt > 3:31234/1‑149 (MQ=255) cgcCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCt < 1:24022/149‑1 (MQ=255) gcCGAAGGCTGGGTGCGCGGAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTg > 7:326327/1‑149 (MQ=255) gcCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTg < 3:193095/149‑1 (MQ=255) gcCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTg > 4:252787/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCAGCTCGCCCAGCGAGcggctgcccaag < 5:334735/149‑7 (MQ=255) gAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGa > 7:243952/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCAGCTCGCCCAGCGAGcggctgcccaa < 7:282445/146‑6 (MQ=255) gAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCAGCTCGCCCAGCGAGcggctgcccaa > 8:282445/1‑141 (MQ=255) gAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACATTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGACAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGa > 6:59669/1‑149 (MQ=255) aaGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGAc > 7:293814/1‑149 (MQ=255) gCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAg < 4:324186/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAgg > 3:317472/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAgg < 8:137422/149‑1 (MQ=255) ggggcgcGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGc < 5:268761/144‑1 (MQ=255) ggTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGc < 3:282337/147‑1 (MQ=255) ggTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGc < 7:184272/147‑1 (MQ=255) ggTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGt < 5:83762/149‑1 (MQ=255) gtATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATc > 1:89290/1‑149 (MQ=255) gtggggggCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGGCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGGGCCCTGGAACTGGGTGGCGTGGACGTGGAAACCTTGGGCTCCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCAc < 1:284660/142‑1 (MQ=255) tGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTc > 3:145920/1‑149 (MQ=255) cgcgGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCACTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTc < 3:156916/147‑1 (MQ=255) gcgGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCg > 8:25671/1‑147 (MQ=255) gcgGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGaa < 7:115140/149‑1 (MQ=255) gCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCAc < 3:9352/148‑1 (MQ=255) gCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACt > 1:326289/1‑149 (MQ=255) ccAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACt > 2:231121/1‑148 (MQ=255) ccAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCAATCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCCTCATCCACTCGAAGTGTGCACt > 6:139707/1‑148 (MQ=255) aaCCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCa > 7:89083/1‑144 (MQ=255) aaCCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCa < 8:89083/144‑1 (MQ=255) cTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCca > 8:81592/1‑149 (MQ=255) ttGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCca > 2:24637/1‑148 (MQ=255) gggTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCGGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCcaca < 6:274255/148‑1 (MQ=255) ggTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAg < 2:326289/148‑1 (MQ=255) tATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGcc > 7:299539/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCt > 2:44975/1‑149 (MQ=255) ttCGCACGCAGCGTGGCCAGCAGCAGCGCACTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTAGCTGGGAGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGCCGATCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGAACTTATCCACAGGCCTg > 2:168602/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTgg > 3:39089/1‑149 (MQ=255) gCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGc < 5:100688/148‑1 (MQ=255) cccGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTg < 8:180415/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGCCGCTGCGCCCTGGAACGTGGGGGGCTGGACCTGGAAAGCTTGGGCAGGCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCTTCCAGGCGATCATCCGTCATCCACTCGACGTGGGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCg < 5:305740/148‑1 (MQ=255) cGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCg < 3:252787/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGGGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCg > 1:28398/1‑148 (MQ=255) tGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGaa < 1:273933/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCGCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGc < 8:311805/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTg > 8:187422/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTg < 8:326327/149‑1 (MQ=255) aGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTg > 5:174300/1‑148 (MQ=255) aGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGc < 2:89290/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGca < 8:293814/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGcac < 8:299539/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATgcg > 6:328167/1‑149 (MQ=255) cgcCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCTAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATgcgg < 3:283812/149‑1 (MQ=255) gAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCttt < 7:25671/148‑1 (MQ=255) aaCGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTgg < 7:276189/149‑1 (MQ=255) accgggtggCCGGGACCTGCAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGGTCTGCGACCAGGCGTTCAGCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTggg < 4:39046/145‑1 (MQ=255) gtggCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGgccg < 1:44975/148‑1 (MQ=255) gCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGGGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCcgccgc > 2:232590/1‑149 (MQ=255) gacctggaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTggg > 1:376291/1‑136 (MQ=255) gacctggaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTggg < 2:376291/136‑1 (MQ=255) gacctggaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTcgc < 4:31234/148‑1 (MQ=255) acctggaAAGCTTGGGCAGCGGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCgcgc < 1:168602/149‑1 (MQ=255) ggaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCgcgc < 1:353187/145‑1 (MQ=255) ggaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCgcgc > 2:353187/1‑145 (MQ=255) ggaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTACGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTc > 5:262780/1‑148 (MQ=255) gaAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTc < 4:317472/147‑1 (MQ=255) gcagaacagcagCTCGCCCAGCGAGCGGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAgcgc > 8:259214/7‑148 (MQ=255) aacAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACAGGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACgg > 5:322225/3‑149 (MQ=255) ccGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTgg < 5:59669/149‑1 (MQ=255) cgctcgctGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGa > 8:248599/1‑149 (MQ=255) gctcgctGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCTCTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACAAGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGAc < 4:39089/149‑1 (MQ=255) gctGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACctgc < 6:174300/149‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACctgctg > 1:331091/1‑149 (MQ=255) | GCATCGCTGCCGGCGCCGAAGGCTGGGTGCGCGAAGTGTATCTGCGCGGCCATGGCCAACCTTGGGTATTCGCCCGCAGCGTGGCCAGCCGCAGCGCCCTGGAACGTGGTGGCCTGGACCTGGAAACCTTGGGCAGCCGCTCGCTGGGCGAGCTGCTGTTCTGCGACCAGGCGTTCATCCGTCATCCACTCGAAGTGTGCACTTATCCACAGGCCTGGCTGCCGTCCGAAGCTGCACATGCGGCGCTTTGGGGCCGCCGCTCGCGCTTCGAGCGCAACGGCCTGGACCTGCTG > NC_002947/6063320‑6063612 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |