| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,075,747 | G→C | 15.1% | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 ← | phosphate ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,075,747 | 0 | G | C | 15.1% | 183.4 / 24.6 | 73 | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/34); new base C (6/5); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.24e-01 | |||||||||||
CAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAG > NC_002947/6075605‑6075886 | cAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGc > 1:273466/1‑149 (MQ=255) cccccccTTCGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCACCCAGCTGGCCCGTGGCAGTAATTTCGGTGGCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACTGCCGt < 6:220926/149‑1 (MQ=255) cgccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGtt < 3:259171/147‑1 (MQ=255) ccccccTTGTAGTCACCGATGATCATCGAAATTCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGC‑CACGGCCgac < 6:21239/149‑3 (MQ=255) ccccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGtt < 2:140045/149‑1 (MQ=255) cccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTAGGCCGTGG‑CACGGCCGtt > 3:332738/1‑148 (MQ=255) ccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGa < 5:18572/149‑1 (MQ=255) ccccGTGGAGGCACCGTTGATCAGCGAAATGCCGCCAACCCGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGC‑CACGGCCgacgt < 1:376381/149‑5 (MQ=255) ccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATc < 3:172151/149‑1 (MQ=255) ccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATc < 1:64135/149‑1 (MQ=255) ccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATc < 3:166449/149‑1 (MQ=255) cTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGCGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAT‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCGGTGC‑CACGGCCgacgtgtt < 4:133507/149‑8 (MQ=255) ggAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACg < 2:252969/148‑1 (MQ=255) gAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTa < 3:173632/149‑1 (MQ=255) gatgatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGc > 7:335668/1‑145 (MQ=255) gatgatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGc < 8:335668/145‑1 (MQ=255) gatgatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGt > 8:65733/1‑149 (MQ=255) tgatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGTCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTTAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGt < 7:250716/147‑1 (MQ=255) atCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑g < 3:10563/149‑1 (MQ=255) atCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑g < 1:333171/149‑1 (MQ=255) ccgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGAt > 7:324748/1‑149 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGt > 3:166183/1‑140 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGt < 4:166183/140‑1 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATg > 5:154381/1‑148 (MQ=255) cAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAg < 5:168784/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGa < 1:269836/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCa < 8:344166/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGAGCAGGCGGAACACGTCGGCCGTGT‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGGGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCAcc < 6:289215/149‑1 (MQ=255) gCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtctc < 2:28063/149‑1 (MQ=255) cAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCg < 4:125621/149‑1 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGt < 7:241434/122‑1 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGt > 8:241434/1‑122 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCgg > 5:237192/1‑149 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCgg > 3:179734/1‑149 (MQ=255) aGTAATTTCGGAGTCGGCGCTATCAGACAACTAGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCATGTCGCGCAGGCTGAACACGTACGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACCTACAGCCAGTGCT‑‑‑CGCGTGGGTCGATGAACATATTCTTCACCGtcaagg > 7:288758/1‑145 (MQ=255) gTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CCCGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGt > 8:2588/1‑149 (MQ=255) tAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGata > 6:235047/1‑131 (MQ=255) tttCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAtt < 2:351027/149‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAttt < 7:65733/148‑1 (MQ=255) ggTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGc < 6:237192/148‑1 (MQ=255) tCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAg < 2:273466/149‑1 (MQ=255) aGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCgg < 8:324748/148‑1 (MQ=255) aGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGt > 3:90203/1‑149 (MQ=255) aGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGt > 1:192226/1‑149 (MQ=255) gACAACTTGTAACCCGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGGGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCgg < 1:129385/149‑1 (MQ=255) gACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGtt > 5:180326/1‑149 (MQ=255) gACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGtt < 2:192226/149‑1 (MQ=255) gACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGt > 1:137767/1‑148 (MQ=255) aaCTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCgg < 3:339707/144‑1 (MQ=255) aaCTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCgg > 4:339707/1‑144 (MQ=255) ttGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTc > 6:208726/1‑149 (MQ=255) gTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCg < 6:154381/148‑1 (MQ=255) tAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCgg < 4:90203/148‑1 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGgtggtg < 4:179734/149‑1 (MQ=255) ggCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACTCGTCGTCCGTGG‑CTCGGACGTGGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGTGTCGCTGAAGATATTCTTGACCGTCTGGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCTGGTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCg < 8:288758/149‑1 (MQ=255) ggCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGAGGGAGTGTGTCTATGAAGATTATCTTCACAGTCTCGGTCTTTAGCGGGAGATCGATGCGTTTCATCTCTGTTGTGCGctct > 1:298855/1‑149 (MQ=255) gCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCgg > 1:229902/1‑149 (MQ=255) tctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGt > 4:352682/1‑148 (MQ=255) gTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtcatca > 6:155904/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtcatca > 7:22933/1‑149 (MQ=255) cgcAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGtt < 7:2588/149‑1 (MQ=255) tGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTg > 8:194246/1‑149 (MQ=255) acacTTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCTGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCgt < 4:332738/149‑2 (MQ=255) cacGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCggg > 6:76932/1‑149 (MQ=255) tcaacGGCCGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtcatc < 2:40592/128‑1 (MQ=255) tcaacGGCCGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtcatc > 1:40592/5‑132 (MQ=255) tcaacGGCCGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGt > 8:36237/5‑149 (MQ=255) caacGGCCGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGt > 4:220670/4‑148 (MQ=255) gTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGt > 3:174144/1‑147 (MQ=255) acGGCCGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAg > 7:51332/2‑149 (MQ=255) acGGCCGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGGTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTGCGTGCGGGTCAg > 5:343025/2‑149 (MQ=255) ccGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCgg < 5:236655/140‑1 (MQ=255) ccGTGC‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCgg > 6:236655/1‑140 (MQ=255) | CAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAA‑‑CGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGG‑CACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCT‑‑‑GGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAG > NC_002947/6075605‑6075886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |