Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,127,163 | A→T | 6.1% | V241E (GTG→GAG) ‡ | PP_5375 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,127,163 | 0 | A | T | 6.1% | 245.9 / 3.1 | 88 | V241E (GTG→GAG) ‡ | PP_5375 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/41); new base T (3/3); total (44/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.50e-01 |
AGCCGCACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAAGCCAGAGC > NC_002947/6127019‑6127309 | aGCCGCACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGcc < 5:68989/149‑1 (MQ=255) ccGCACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCt > 3:176385/1‑149 (MQ=255) ccGCACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCt < 6:161538/149‑1 (MQ=255) cACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGTCGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCGTGGCCCTGGc < 8:327395/149‑1 (MQ=255) cACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGACCCAGGCCAGGGCCACGCCCTgg > 5:74055/1‑148 (MQ=255) cTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCGTGGCCCTGGcctg < 3:138805/148‑3 (MQ=255) cTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCGTGGCCCTGGcctg > 4:138805/1‑146 (MQ=255) tttCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGCCCAGCGCACCGGTGCTCAACGCCTCGTCCCCCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCCCGCCCTGGCCC‑Ct > 4:304220/1‑148 (MQ=255) tttCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑Ct > 1:278699/1‑148 (MQ=255) aCGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATc < 4:275228/148‑1 (MQ=255) gACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGAc > 3:87735/1‑149 (MQ=255) cACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCTGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGTCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTgg < 1:147193/149‑1 (MQ=255) cACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTgg < 5:189157/149‑1 (MQ=255) cACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTg > 2:97881/1‑148 (MQ=255) cTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACAAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCa < 1:97881/149‑1 (MQ=255) ggTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACAAAACATCCACAAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCa > 1:306977/1‑149 (MQ=255) gTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCACCAGGCCAGGGCCACGCCCAGGCCA‑CTGATCGACGACTGGATCAGCa > 7:18971/1‑148 (MQ=255) gacgacTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATAc < 1:30917/148‑1 (MQ=255) 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cagcagGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTg < 8:119247/148‑1 (MQ=255) cagcagGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGt < 7:115574/149‑1 (MQ=255) cagcagGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGt > 6:274573/1‑149 (MQ=255) agcagGCAGAACTTGGCGTTGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGATTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGtt < 8:230738/149‑1 (MQ=255) gcagAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGatat > 1:969/1‑149 (MQ=255) gcagAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGa < 8:274433/146‑1 (MQ=255) gcagAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGa > 7:274433/1‑146 (MQ=255) gcagAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACCCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGAAGCTGTTGatat > 2:219398/1‑149 (MQ=255) cagAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATAtt < 5:274573/149‑1 (MQ=255) agAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATAtt > 3:206680/1‑148 (MQ=255) agAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATAtt > 4:202957/1‑148 (MQ=255) agAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGATGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGAAGCTGTTGATAtt > 2:295150/1‑148 (MQ=255) cTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGAcgc < 4:176385/149‑1 (MQ=255) gTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCt > 7:355851/1‑149 (MQ=255) ggT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTg < 2:374737/148‑1 (MQ=255) ggT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTg < 2:278699/148‑1 (MQ=255) t‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTgggg > 2:75274/1‑149 (MQ=255) tccgcaGTACCACATCGCTCCGCTGCACCACCGCACCGGTCCCCCCCGCATCGTCCACCAGGTTCCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTgggg < 4:285600/144‑1 (MQ=255) gAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCa > 2:6433/1‑149 (MQ=255) gTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATg < 6:105519/149‑1 (MQ=255) caTCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCg > 4:216289/1‑149 (MQ=255) aTCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCg > 1:200922/1‑148 (MQ=255) gTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATc > 7:258494/1‑149 (MQ=255) gggCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATcc > 6:147051/1‑147 (MQ=255) gggCGTGACCAGCGCCCCGGTTCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCTACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACTCGATGCTTGGGGGTCATCGGCTCGTATccc < 6:74055/148‑1 (MQ=255) ggCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCa < 3:26311/148‑1 (MQ=255) ggCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAg < 5:147051/149‑1 (MQ=255) cTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGAATCGGCCACCAGGTTGCCCCAGGCCATGGCCACGCCCTTGCCA‑CTGATCGCCGAGTGGATCAGCATACCGTTGCTGTTGATATTGACGCGATTCTTGGGGGTCATGGGCTCGTTTCCCAGgc < 8:18971/149‑1 (MQ=255) tGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGgcgc > 4:365663/1‑149 (MQ=255) tGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGgcgc > 2:172330/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCtt > 3:330163/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCAACGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCCGGCCAGGGCCACCCCCTGGCCA‑CTGATAGCCGAATGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGTGCTCGTATCACATgcga > 8:156224/1‑145 (MQ=255) cAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTg > 3:90566/1‑148 (MQ=255) cgcACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAAc > 6:105802/1‑148 (MQ=255) ggTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCgg < 8:258494/149‑1 (MQ=255) tGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGc < 1:75274/149‑1 (MQ=255) tGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGc < 5:105802/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGc > 5:10161/1‑148 (MQ=255) tCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCaa > 6:242044/1‑149 (MQ=255) aaCGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATAGCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAAc < 7:118877/148‑1 (MQ=255) aaCGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCaa < 7:156224/147‑1 (MQ=255) aaCGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCaa < 1:172330/147‑1 (MQ=255) aaCGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCaa < 3:365663/147‑1 (MQ=255) cGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGgcgc > 7:294878/1‑122 (MQ=255) cGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGgcgc < 8:294878/122‑1 (MQ=255) gTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGt > 7:211788/1‑149 (MQ=255) accaGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCAGACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGGTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGCCGCTTGAACCATACGGGCCAACCTACCCAGCcgag > 2:304241/1‑147 (MQ=255) caGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGTCGCGATGCTTGGGGGTCATGGGGTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCt < 2:306977/149‑1 (MQ=255) caGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGCATCAGCAAACCGTAGCTCTTGATATTGACGCGATGCTAGGGGGTCATGGGCTCGTATCACAGGGGCTTGAACCATTCGGGCCAACCGACGCAGACGCGCt > 2:332923/1‑149 (MQ=255) ggTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTgg < 4:330163/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGa < 2:200922/149‑1 (MQ=255) 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cccAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCt < 3:304220/149‑1 (MQ=255) ccaggccaggGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCtt > 6:287336/1‑149 (MQ=255) ccaggccaggGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCtt < 3:216289/149‑1 (MQ=255) gccaggGCGTGGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAag > 3:11475/1‑149 (MQ=255) ccaggGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAagc < 1:295150/149‑1 (MQ=255) aggGCCATTCCCTGCACA‑CTGATCGCAGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGTCGCTTTAACCATTCGGGCCAACCTAACCAGTCGCGCTGGGAGTCTTAAaggct > 8:328552/1‑146 (MQ=255) ggCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAagccaga < 3:202957/149‑1 (MQ=255) ggCCACGCCCTGGCCA‑CAGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAagccaga < 3:326451/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAagccagagc > 7:104911/1‑149 (MQ=255) | AGCCGCACGCTTTCACGAGGACCACGCTCGGTGGACGACTCCAGCAGGCAGAACTTGGCGTCGGT‑CTGGAGTACCACATCGTTGGGCTTGACCAGCGCACCGGTGCTCAACGCATCGTCCACCAGGTTGCCCCAGGCCAGGGCCACGCCCTGGCCA‑CTGATCGCCGACTGGATCAGCATACCGTAGCTGTTGATATTGACGCGATGCTTGGGGGTCATGGGCTCGTATCCCAGGCGCTTGAACCATTCGGGCCAACCTACCCAGTCGCGCTGGGAGTCTTCAAGCCAGAGC > NC_002947/6127019‑6127309 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |