Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 521,214 | C→T | 8.4% | E28K (GAA→AAA) ‡ | anmK ← | anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 521,214 | 0 | C | T | 8.4% | 238.4 / 8.4 | 83 | E28K (GAA→AAA) ‡ | anmK | anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/39); new base T (4/3); total (41/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 |
TTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGG > NC_002947/521068‑521362 | ttGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCaa < 8:150048/149‑1 (MQ=255) gCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGTTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgc < 3:39976/148‑1 (MQ=255) gCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgc < 3:260383/148‑1 (MQ=255) ccTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGcc < 8:267189/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCt > 4:312101/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCt > 1:186238/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCt > 8:176832/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCt > 5:1624/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGCTTGAACTGCTCGc < 1:65716/147‑1 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGCTTGAACTGCTCGc > 2:65716/1‑147 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGCGCCAGCAGGTCCTGGCGCACGTCCGGGGGCATGGGCAGGAAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCt > 3:133941/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGtt > 5:349714/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGtt < 7:176832/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGGCTAGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGt > 6:304160/1‑148 (MQ=255) ccGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTc > 5:333899/1‑149 (MQ=255) ccGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTc < 4:198891/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGAc < 8:145361/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGCTTGAACTGCTCg < 8:145045/138‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGCTTGAACTGCTCg > 7:145045/1‑138 (MQ=255) gCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAggg > 4:349943/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAggg < 1:105951/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCCTGGTCGAACAAGGc < 4:319799/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCTCGGTCAATCTCGTCTGGGCCGATGCTGCACAGGGGCAGCTGGTTGTGGCGCAGGTCCGTGGGCATGTGCAGGTAGTGGGTGGCTAGAAGTTCTAGCTGCTCGCCTTGTTTGACCAGGGCgtt < 4:133941/149‑3 (MQ=255) gCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCg < 3:312101/147‑1 (MQ=255) cccAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGACCTGGCGCAGGGCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGata > 3:18538/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGatat > 4:116324/1‑149 (MQ=255) aGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATc > 6:244038/1‑148 (MQ=255) cGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAg < 8:217639/149‑1 (MQ=255) ttttCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGCCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCTGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGcc > 6:337560/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAg < 2:186238/149‑1 (MQ=255) cAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGc < 3:349943/149‑1 (MQ=255) aGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCt < 5:304160/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGACCTGGCGCAGGGCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTg < 4:18538/149‑1 (MQ=255) tgctgcACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTgg > 8:46650/1‑149 (MQ=255) gcACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGcc > 8:64470/1‑149 (MQ=255) gcACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGAGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg < 4:275902/120‑1 (MQ=255) gcACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGAGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg > 3:275902/1‑120 (MQ=255) aCGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGAGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCgg > 2:173298/1‑149 (MQ=255) gCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACAt < 2:321675/149‑1 (MQ=255) gCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACAt > 5:35466/1‑149 (MQ=255) ctcGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCAccc > 2:319395/1‑149 (MQ=255) gTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCAccccc > 8:151789/1‑148 (MQ=255) cAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAg < 3:116324/149‑1 (MQ=255) aGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAg > 1:11678/1‑148 (MQ=255) gggCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTa < 5:157726/149‑1 (MQ=255) ctgcACAGGGCCAGCAGGTCCTGGTGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCAt > 6:9238/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGGATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCCCCCCCCAGTAGCGCGCCATGGc > 6:187805/1‑149 (MQ=255) cacaGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATgg < 7:151789/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAgc > 4:208210/1‑149 (MQ=255) gCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAgcg > 1:146614/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAgcgc < 1:319395/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAgcgc < 7:64470/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGACCTCGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGAAGTGGGTGGCGCGAAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCAAGGACGCTCGTCCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCAACGCTAAgcc > 4:15336/1‑147 (MQ=255) gTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCg > 3:224393/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGc > 6:289885/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgc > 4:54392/1‑49 (MQ=255) gcgcAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgc < 3:54392/49‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGc < 6:333899/147‑1 (MQ=255) gcAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAg > 3:330310/1‑148 (MQ=255) gcAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGATCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAg > 5:355798/1‑148 (MQ=255) ggTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAgg < 6:1624/149‑1 (MQ=255) gTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCAACCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAggg > 3:8024/1‑149 (MQ=255) ggggCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGcc < 4:224393/149‑1 (MQ=255) aTGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAgc < 6:45085/118‑1 (MQ=255) aTGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAgc > 5:45085/1‑118 (MQ=255) aTGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTc < 7:297467/149‑1 (MQ=255) aTGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTc < 5:96264/149‑1 (MQ=255) aTGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTc < 5:244038/149‑1 (MQ=255) gCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGa < 7:46650/149‑1 (MQ=255) gCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCGTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGa < 5:63709/149‑1 (MQ=255) tAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCATGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCAt < 3:208210/149‑1 (MQ=255) aGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATa > 6:329243/1‑149 (MQ=255) ggtggCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACggg < 4:330310/149‑1 (MQ=255) ggtggCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACgg < 2:11678/148‑1 (MQ=255) aaggCGAGCAGCTTGAACTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACggg > 7:48733/3‑148 (MQ=255) aggCGAGCAGCTTGAACTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCa < 8:48733/148‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGCTTGAACTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCaa > 2:352504/1‑149 (MQ=255) gCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCa < 7:314155/118‑1 (MQ=255) gCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCa > 8:314155/1‑118 (MQ=255) cAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCg < 5:289885/149‑1 (MQ=255) ttCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCTGACATCACCCCCAAGTAGAGCTCCATGTCTTAGCGCTTGTTCGCTGCTATCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGTCAAt < 3:295913/141‑1 (MQ=255) ttCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCggct > 8:205035/1‑149 (MQ=255) ttCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCACAAGTAGAGAGCCATGGCTTAGAGATTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGTCCTTTTCATGATACATACTGGCAAt > 4:295913/1‑141 (MQ=255) cAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCggctgg > 5:264455/1‑149 (MQ=255) | TTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGG > NC_002947/521068‑521362 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |