| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,714 | A→C | 5.9% | L36R (CTG→CGG) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,714 | 0 | A | C | 5.9% | 270.4 / 5.4 | 85 | L36R (CTG→CGG) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/32); new base C (3/2); total (50/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 | |||||||||||
GCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCAGTATCAG > NC_002947/1568‑1862 | gcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGATTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGCTGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATcag < 1:39273/149‑1 (MQ=255)gcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAAAGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATcag > 6:343608/1‑148 (MQ=255) tGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGa > 6:326281/1‑148 (MQ=255) tGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGa > 7:144996/1‑148 (MQ=255) cTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGc > 8:239685/1‑149 (MQ=255) tCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCt > 1:172488/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGAGGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGAGCAGCAGGACACGACGCTTg < 5:331168/149‑1 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCg > 8:331189/1‑148 (MQ=255) tGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcagccagc > 3:136381/1‑147 (MQ=255) aTAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAgg‑c > 5:192178/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTTTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAgg‑c‑ggc < 8:144996/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAgg‑c‑ggc > 1:355251/1‑148 (MQ=255) cTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCTAGCTCGTTTTTTTCTTAATCTTTGGGCTTTG‑TGGGTTTGCTTTTC‑TTATAGTGTTTGTTTTTCAGTACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCga < 2:134643/149‑1 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTg < 6:274385/149‑1 (MQ=255) cAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTc > 8:119562/1‑124 (MQ=255) cAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTc < 7:119562/124‑1 (MQ=255) cAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGa > 3:163762/1‑149 (MQ=255) aGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATa < 5:325078/149‑1 (MQ=255) gCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGCCCCAATGCTCGAGCTCGTGCTTGGCCACACCGCTGCCCATGC‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGAGCAGCAGGACCCGACGCTAGGTCGCAGCCAGCGTCG‑C‑GGCGAGATAGCTACAgg > 4:315273/1‑149 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCAAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAggtg > 3:72583/1‑149 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 4:220270/148‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGtt > 3:220270/1‑148 (MQ=255) ccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGa > 4:368173/1‑122 (MQ=255) ccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGa < 3:368173/122‑1 (MQ=255) tcAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAggtg < 1:314132/136‑1 (MQ=255) ggcggTCGTAGAGCGAATGCTGGAGCTCGTGCTTGTCCACTCCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGGAGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGccc < 8:74203/146‑1 (MQ=255) gCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAggtg > 2:314132/1‑137 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCAcaccac > 7:13457/1‑149 (MQ=255) aGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGtt > 6:194890/1‑131 (MQ=255) aGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 5:194890/131‑1 (MQ=255) gACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCt < 4:136381/148‑1 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCt > 1:325213/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTc < 4:72583/148‑1 (MQ=255) tCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGCACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcgc > 6:50439/1‑149 (MQ=255) tCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATATAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGc > 4:172238/1‑149 (MQ=255) tCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACaccacc < 3:137760/131‑1 (MQ=255) tCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACaccacc > 4:137760/1‑131 (MQ=255) tCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGc > 3:187397/1‑149 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCg > 6:83715/1‑148 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCg < 5:343608/148‑1 (MQ=255) gCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGaa > 8:292004/1‑148 (MQ=255) gCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGaa > 6:61828/1‑148 (MQ=255) ttGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGtt > 6:89923/1‑134 (MQ=255) ttGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGtt < 5:89923/134‑1 (MQ=255) gTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATAc < 7:239685/147‑1 (MQ=255) cacaCCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAg > 6:272194/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGCGGGATCGAGGTCGAACACCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAg > 1:229246/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 3:1440/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt > 2:150947/1‑149 (MQ=255) gcggCCCATGG‑GGGCGTTGCCCTGC‑GGAGCGAGGGCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttg < 8:314963/146‑1 (MQ=255) cTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca < 6:98218/63‑1 (MQ=255) cTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca > 5:98218/1‑63 (MQ=255) cccATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 1:175435/1‑149 (MQ=255) cATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGTCGGGCGAGATTGATACAGGTGTTTGTATTCCCCACACCACCTTTATGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 1:116125/1‑149 (MQ=255) cATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 2:355251/149‑1 (MQ=255) cATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 2:325213/149‑1 (MQ=255) tgg‑tggCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAgt < 5:326281/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTcc > 6:295384/1‑147 (MQ=255) ttGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAg > 3:167626/1‑149 (MQ=255) gtccTGC‑TGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATAc > 8:63202/3‑120 (MQ=38) gtccTGC‑TGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATAc < 7:63202/118‑1 (MQ=38) gtccTGC‑TGATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGt > 2:250027/3‑148 (MQ=255) tccTGC‑TGATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 3:305764/2‑149 (MQ=255) cccTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa < 7:292004/149‑1 (MQ=255) cccTGC‑GGATCGAGGTCGATAAGAAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 5:198526/1‑149 (MQ=255) cTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 3:340915/1‑149 (MQ=255) cTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 3:346367/1‑149 (MQ=255) tGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcg > 1:362584/1‑103 (MQ=255) tGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcg < 2:362584/103‑1 (MQ=255) tGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGc > 3:182861/1‑149 (MQ=255) c‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGcc < 2:172488/148‑1 (MQ=255) tcgacctCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg < 4:305764/143‑1 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg > 5:286826/1‑149 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg < 2:116125/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg < 1:150947/149‑1 (MQ=255) cGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGc > 4:361614/1‑103 (MQ=255) cGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGc < 3:361614/103‑1 (MQ=255) aGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCTCAGCCAGCGAGG‑C‑GTCGAGATTGATACAGGTGGGTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTGCCCAGTCATGCCTTgcggc < 6:198526/148‑1 (MQ=255) aGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcggcg > 7:328363/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcggcg > 7:142828/1‑147 (MQ=255) gTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcggcg > 5:363886/1‑147 (MQ=255) gTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCa < 8:13457/149‑1 (MQ=255) gTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCa < 4:167626/149‑1 (MQ=255) gATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCa < 2:86208/146‑1 (MQ=255) gATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCa > 1:86208/1‑146 (MQ=255) gATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCAGt < 6:286826/148‑1 (MQ=255) tCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTTCGGCGCAGTAt > 7:165955/1‑148 (MQ=255) agcagGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCAGTATcag > 3:293925/1‑149 (MQ=255) | GCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGG‑TGGCGTTGCCCTGC‑GGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGG‑C‑GGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGCAGTATCAG > NC_002947/1568‑1862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |