| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 693,590 | C→G | 8.2% | G151A (GGC→GCC) | PP_0595 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 693,590 | 0 | C | G | 8.2% | 200.0 / 9.8 | 73 | G151A (GGC→GCC) | PP_0595 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/32); new base G (3/3); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.49e-01 | |||||||||||
TGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCCGCG > NC_002947/693449‑693735 | tgctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTc > 1:198626/1‑149 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGa < 3:341300/149‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGGGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGTTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGCGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTg < 1:279376/145‑1 (MQ=255) gtcgtcGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGAc < 6:336580/147‑1 (MQ=255) ggcgtcgGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGAc < 3:275931/145‑1 (MQ=255) cgtcgGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACctgg > 7:224620/1‑149 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGa > 2:207795/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGTCCTGGCTGGGGGc > 6:197237/1‑146 (MQ=255) aaCAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACctgg > 8:188766/1‑138 (MQ=255) aaCAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACctgg < 7:188766/138‑1 (MQ=255) aCAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGAt > 1:84842/1‑148 (MQ=255) cGGGTGGCCAACGGCGCATTACAGCAGCTAGCGTTCGCTGTACAAGGGTTGATACTCATGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGc < 6:51731/149‑1 (MQ=255) cGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGc < 1:207795/149‑1 (MQ=255) gggTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCg > 7:117245/1‑149 (MQ=255) gCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCt < 4:57003/149‑1 (MQ=255) cAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGAcc < 1:184565/122‑1 (MQ=255) cAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAAAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTg > 3:244690/1‑148 (MQ=255) aaCCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGa < 8:200640/119‑1 (MQ=255) aaCCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGa > 7:200640/1‑119 (MQ=255) aCCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGAt < 6:181332/149‑1 (MQ=255) cgcAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGACAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATgcgc < 3:98771/149‑1 (MQ=255) gcAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGca < 6:73345/149‑1 (MQ=255) gTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACAt < 5:299234/149‑1 (MQ=255) cagcagCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAg > 6:29477/1‑149 (MQ=255) agcagcGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGa > 7:249548/1‑121 (MQ=255) agcagcGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGa < 8:249548/121‑1 (MQ=255) cagcGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTCCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGc > 5:5331/1‑149 (MQ=255) gcgagcgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGccc < 8:224620/149‑1 (MQ=255) gagcgTTCGCTGTACAACGGTTGATAATCAAGCCCCGATAACGG‑GGTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCg < 1:147386/149‑1 (MQ=255) gagcgTTCGCTGTAAAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGCGCACGCCGTGCGCGACCTGGCTGGGGGAGCTCATGCGGATCTGGATGCGCCCCTAAGGGcccc > 4:340446/1‑148 (MQ=255) cgTGCGCTGAACAACGGTTTATACTCACCCCCCGATACGGG‑GGGGGTCTGGGGTACGCCGCCAAGGTGCCGGGGGCCGTCGAGCACGCGGGGCTCCACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATc < 6:248869/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATcc < 6:316585/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCTATACCGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCt < 3:340446/149‑1 (MQ=255) cTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAg > 2:354000/1‑149 (MQ=255) gTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGtt > 2:231135/1‑149 (MQ=255) aaCGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGAcc < 5:43203/87‑1 (MQ=255) gTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATGTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAgg > 5:159413/1‑149 (MQ=255) tGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGTCCTGGCTGGGGGCCATCATGCGGATCTGGATGCGCACAACAggg > 5:109528/1‑123 (MQ=255) tGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAggg < 6:109528/123‑1 (MQ=255) aTACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGCTCCTTGAGTTCCGCCAGGGCAt > 7:10827/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGGGATCATGCGGTTCTGGTTGGGCACCTCCGGGCCCCGGTGCTTGAGTTCCGCCAGGGCATggg > 4:11652/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCCCGCCGGGGGAGACCTGGCGGGGGGGGGTCATTCGGGTGTTGGTGGGCACCTAAGGGGCCCGGTCCGGGAGTTGCGCCGCGGCAGGGGt > 8:301607/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATg < 3:228830/146‑1 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATg > 4:228830/1‑146 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGt > 5:228807/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGt > 6:296604/1‑149 (MQ=255) aaGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGa > 6:170208/1‑149 (MQ=255) cccGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCCCGCCGTGCGCGACCGGGCTGGGGGCGATCATGCGGCTCGGGCTGCGCACATCAGGGCCCCAATCCTTGACTTCCGCCCGGGCAAGGGGGATACg > 3:208712/1‑149 (MQ=255) gATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCAt > 2:144198/1‑149 (MQ=255) aaCGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCAtgtg < 5:29477/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCa < 1:231135/149‑1 (MQ=255) tGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAg > 4:104805/1‑112 (MQ=255) tGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAg < 3:104805/112‑1 (MQ=255) tGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAgg < 3:82688/149‑1 (MQ=255) tGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAgg < 2:84842/149‑1 (MQ=255) gTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAggg < 2:198626/148‑1 (MQ=255) gTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAgg < 1:354000/147‑1 (MQ=255) tgtgGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGAt < 4:362993/128‑1 (MQ=255) tgtgGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATAATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGAt > 3:362993/1‑128 (MQ=255) cgacgCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCAGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTg > 4:109535/1‑149 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cGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc > 7:99009/1‑149 (MQ=255) cGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc > 4:173777/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCACGGCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCt > 8:287276/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCt > 7:329300/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCGTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCt > 2:237266/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGATGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCCGCt > 8:234953/1‑149 (MQ=255) tCGAGCACGGCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGCTGTTCAGCTc > 6:17100/1‑149 (MQ=255) cGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCcgcg > 1:82737/1‑148 (MQ=255) | TGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGG‑GCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCCGCG > NC_002947/693449‑693735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |