Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 726,622 | G→C | 9.4% | F44L (TTC→TTG) ‡ | PP_0620 ← | GntR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 726,622 | 0 | G | C | 9.4% | 194.6 / 9.5 | 64 | F44L (TTC→TTG) ‡ | PP_0620 | GntR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/36); new base C (3/3); total (25/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 |
AGTGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGCTATTTTTCATAT > NC_002947/726474‑726770 | aGTGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTGCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCg < 3:104661/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAAt < 7:65910/149‑1 (MQ=255) tAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTc < 2:122344/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTTCGAATGCTCCaa < 2:325652/149‑2 (MQ=255) tGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATc < 8:13473/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATc < 8:21167/148‑1 (MQ=255) cgcAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCa < 8:296305/148‑1 (MQ=255) cgcAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCa < 4:259914/148‑1 (MQ=255) gcAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGc > 4:142261/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCg > 5:88336/1‑149 (MQ=255) ggctggctGGGTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCg < 7:122700/149‑1 (MQ=255) ctggctggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGt < 7:291322/149‑1 (MQ=255) gctggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTagg > 8:55617/1‑149 (MQ=255) ctggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTaggc < 4:66542/149‑1 (MQ=255) tggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCAt < 3:28096/129‑1 (MQ=255) tggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCAt > 4:28096/1‑129 (MQ=255) ttCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGc < 6:188380/121‑1 (MQ=255) ggTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGt > 1:122708/1‑149 (MQ=255) gTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAACTGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTc > 4:286990/1‑149 (MQ=255) ccACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGACGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTaggcag < 3:233191/139‑1 (MQ=255) ccACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGACGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTaggcag > 4:233191/1‑139 (MQ=255) cACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCgg > 7:78889/1‑149 (MQ=255) cACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCgg > 6:286277/1‑149 (MQ=255) aCTTCGTTCAGGTAGGCGTCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCggg < 2:311532/149‑1 (MQ=255) cGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTg < 4:71223/148‑1 (MQ=255) gTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCa < 3:260668/149‑1 (MQ=255) ttCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAg > 8:216846/1‑149 (MQ=255) tCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGG‑‑GGTGCCCTTGGAGCATTCg < 4:199757/96‑1 (MQ=255) tCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGG‑‑GGTGCCCTTGGAGCATTCg > 3:199757/1‑96 (MQ=255) cAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAgc < 1:58034/148‑1 (MQ=255) gTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCtt > 4:271828/1‑149 (MQ=255) tAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTc < 7:81173/149‑1 (MQ=255) ccccGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGAc > 1:163653/1‑148 (MQ=255) ccGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGAt < 5:286277/149‑1 (MQ=255) gTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGa < 6:34493/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAgcgc < 7:165676/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCtt < 6:88336/149‑1 (MQ=255) cGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTg < 5:17125/149‑1 (MQ=255) gggTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAt < 8:78889/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt < 2:163653/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt < 7:55617/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt > 3:320968/1‑149 (MQ=255) gTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTTCGAATGCTCCaag < 5:271012/78‑3 (MQ=38) gTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTTCGAATGCTCCaag > 6:271012/1‑76 (MQ=38) gCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTcga < 8:81067/149‑1 (MQ=255) cTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTcga < 4:320968/148‑1 (MQ=255) aCCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGAt > 3:26129/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATca > 5:161366/1‑149 (MQ=255) ttcgaGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCt > 5:272165/1‑149 (MQ=255) ttcgaGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCt > 3:247573/1‑149 (MQ=255) ttcgaGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGAGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACa > 7:161669/1‑146 (MQ=255) ttcgaGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGAGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACa < 8:161669/146‑1 (MQ=255) aGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCTCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTg < 4:158019/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGgcgc < 3:271828/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTgg > 2:44866/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTgg < 2:314729/147‑1 (MQ=255) gcgggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGtt < 7:331130/149‑1 (MQ=255) ggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGa < 2:122708/149‑1 (MQ=255) ggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGa < 7:216846/149‑1 (MQ=255) tGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCAtt > 4:216118/1‑149 (MQ=255) cccTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCAttt < 3:216118/148‑1 (MQ=255) tgatGGAGCATTTCGAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCg > 2:179025/4‑149 (MQ=255) ggAGCATTTCGAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCAttt < 8:120012/143‑1 (MQ=255) ggAGCATTTCGAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCAttt > 7:120012/1‑143 (MQ=255) ttCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTTACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGCTATTTTTCa < 3:142261/149‑1 (MQ=255) ttCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTCACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGCTATTTTTCa > 7:244464/1‑149 (MQ=255) tCGTAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGCTATTTTTCa > 6:248160/1‑148 (MQ=255) gAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGa > 6:264732/1‑99 (MQ=255) gAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGa < 5:264732/99‑1 (MQ=255) gAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGCTATTTTTCatat > 5:373824/1‑149 (MQ=255) | AGTGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGCTATTTTTCATAT > NC_002947/726474‑726770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |