Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 862,834 | A→G | 6.7% | N296S (AAC→AGC) ‡ | yfcH → | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 862,834 | 0 | A | G | 6.7% | 217.6 / 4.1 | 74 | N296S (AAC→AGC) ‡ | yfcH | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/37); new base G (2/3); total (34/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
CGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCGTACGTGATCGACCTGC > NC_002947/862687‑862981 | cgcTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGATGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAAc < 2:298978/149‑1 (MQ=255) cgcTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAAc < 4:74089/149‑1 (MQ=255) cgcTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAAc < 6:74942/149‑1 (MQ=255) tGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTg < 7:305894/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTc > 8:290831/1‑147 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAg > 4:49605/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGc < 6:326167/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCGGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCGACTGGACAGGTTGTCCAgcgc < 6:217359/149‑4 (MQ=255) ccGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGcc < 3:217008/148‑1 (MQ=255) cGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCctc > 5:301961/1‑149 (MQ=255) ggCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCctct > 2:1929/1‑149 (MQ=255) gCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTg < 2:288281/149‑1 (MQ=255) ctgctCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGTACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATa < 6:301961/148‑1 (MQ=255) ctgctCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAg > 6:154734/1‑149 (MQ=255) ctCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAgg < 7:298489/147‑1 (MQ=255) aaGGCCGGGTTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGGTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTTCGCTTGCTGTAAGCCGGTTTCAGCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCTGTCGCCTCTGACATAGGACGCt < 8:127509/149‑1 (MQ=255) aaGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCGGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCt < 2:85313/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGc < 3:49605/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCa > 8:320483/1‑149 (MQ=255) gTCCACCTCGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctg > 4:355483/1‑149 (MQ=255) tCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctg < 7:320483/148‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTg > 3:263456/1‑127 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTg < 4:263456/127‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctg > 2:311224/1‑149 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctg > 5:39887/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctgctg < 1:1929/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctgctg < 5:58178/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTgg > 2:370877/1‑149 (MQ=255) gctgGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTc < 3:307923/93‑1 (MQ=255) gctgGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTc > 4:307923/1‑93 (MQ=255) ctgGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTTGCCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAAc > 1:284563/1‑149 (MQ=255) gggAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTg < 4:227/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGtt < 7:70395/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGtt < 7:65317/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctgct < 5:150433/134‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctgct > 6:150433/1‑134 (MQ=255) gCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctgct > 6:144518/1‑134 (MQ=255) gCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCctgctgct < 5:144518/134‑1 (MQ=255) cAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCCACCTGGGTTccc > 4:363633/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTccc > 3:124480/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGcc < 2:284563/149‑1 (MQ=255) gcggCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCC‑CTGGACAACCTGTCCAGGCGCCTCTGACATAGGCCCCTGCATGACCGCTCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGGTCCCCGGCCTcc < 1:709/149‑1 (MQ=255) cGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCTCCGGCCTCCACCTCGGTg < 7:290831/148‑1 (MQ=255) cGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTg < 4:208120/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAATGCGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGcc > 1:71168/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTc > 6:5497/1‑132 (MQ=255) cTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTc < 5:5497/132‑1 (MQ=255) cTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGAtg < 4:124480/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGAc < 4:95068/89‑1 (MQ=255) tGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGAtgt > 7:81474/1‑149 (MQ=255) ggCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCt < 4:262242/108‑1 (MQ=255) ggCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCt > 3:262242/1‑108 (MQ=255) cTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTAc < 3:355483/149‑1 (MQ=255) ttCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTAcc > 1:167534/1‑149 (MQ=255) aCCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTc > 6:54007/1‑148 (MQ=255) cTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAAc > 8:323982/1‑149 (MQ=255) gCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGtt > 8:407/1‑149 (MQ=255) aaCGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTc < 2:71168/148‑1 (MQ=255) aCGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCAt < 2:167534/149‑1 (MQ=255) aCGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCAt < 1:370877/149‑1 (MQ=255) cGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATTGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATg < 1:311224/149‑1 (MQ=255) gATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATgg > 7:249722/1‑149 (MQ=255) tGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCACCCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGAGGTCCGCCGCGACCTCAACCAGATCCTCATggcc > 8:260747/1‑145 (MQ=255) tGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGAccc > 2:16983/1‑149 (MQ=255) tGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGAccc > 1:330525/1‑149 (MQ=255) tGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGAccc > 5:183760/1‑149 (MQ=255) gCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCg > 8:5223/1‑149 (MQ=255) cAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGAccc < 6:39887/147‑1 (MQ=255) cAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGAc < 8:249722/145‑1 (MQ=255) cgacTGGACAGGTTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCGTACGTGa > 5:187056/4‑149 (MQ=255) gacTGGACAGGTTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGa < 2:189539/135‑1 (MQ=255) gacTGGACAGGTTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGa > 1:189539/3‑137 (MQ=255) acTGGACAGGTTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCGTACGTGATc < 6:187056/148‑1 (MQ=255) cAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCGTACGTGATCGACCTg > 2:15456/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCGTACGTGATCGACCTGc > 3:248426/1‑149 (MQ=255) | CGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGCCGGCTTCACCTT‑CCGCTTCAACGATCTGCAAT‑CGGCG‑CTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACATAGGACGCTGCATGACCGATCACGCCCTGCTGCTGGTCAACCTGGGTTCCCCGGCCTCCACCTCGGTGGCCGATGTGCGCCGCTACCTCAACCAGTTCCTCATGGACCCGTACGTGATCGACCTGC > NC_002947/862687‑862981 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |