Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,098,681 | G→A | 6.8% | H295H (CAC→CAT) | kdsD ← | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,098,681 | 0 | G | A | 6.8% | 172.9 / 2.4 | 59 | H295H (CAC→CAT) | kdsD | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/27); new base A (2/2); total (30/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 |
CCAGCTTGATGCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCACCGTCGGTGAAGATCC > NC_002947/1098536‑1098829 | ccAGCTTGATGCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTgg > 6:353997/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTcc < 8:5140/148‑1 (MQ=255) tGCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCAtt < 5:353997/149‑1 (MQ=255) tGCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCAtt < 6:14571/149‑1 (MQ=255) gCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTa > 4:164523/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGT‑‑‑CCACCACCAGGGCGTTGATCTtgtg > 1:319204/1‑135 (MQ=255) gCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGT‑‑‑CCACCACCAGGGCGTTGATCTtgtg < 2:319204/135‑1 (MQ=255) tttGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCt > 6:198896/1‑149 (MQ=255) tttGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCt > 1:115036/1‑149 (MQ=255) ccGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAg < 3:164523/149‑1 (MQ=255) gCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTcg > 3:105138/1‑149 (MQ=255) tGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTcggcg < 8:72836/149‑1 (MQ=255) tGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTACATTATCTTCAGGGCTTcggcg > 8:113509/1‑149 (MQ=255) aGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCggcggc < 8:195850/149‑1 (MQ=255) cTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCa > 3:252970/1‑149 (MQ=255) gTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGt > 5:189884/1‑149 (MQ=255) gTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGt > 6:75667/1‑149 (MQ=255) gTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTATGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGt > 2:175294/1‑149 (MQ=255) gTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTATGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGt > 2:169601/1‑149 (MQ=255) ttCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAgg < 8:307894/125‑1 (MQ=255) ttCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAgg > 7:307894/1‑125 (MQ=255) ccATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCAcg > 5:48859/1‑149 (MQ=255) cATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGCGAGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCAcg > 1:218537/1‑149 (MQ=255) aTCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCAcgcg < 4:252970/149‑1 (MQ=255) cTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCg < 1:235015/138‑1 (MQ=255) cTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCg > 2:235015/1‑138 (MQ=255) cTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGt > 2:274360/1‑149 (MQ=255) ccTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCt > 8:318766/1‑149 (MQ=255) cTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCtt > 1:281084/1‑149 (MQ=255) cTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCtt < 7:24782/149‑1 (MQ=255) cTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCtt < 1:274360/149‑1 (MQ=255) tACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTg < 2:218537/147‑1 (MQ=255) cATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCAt < 4:121652/149‑1 (MQ=255) cATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCAt < 4:105138/149‑1 (MQ=255) aTTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCAt > 2:72881/1‑148 (MQ=255) cGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGACCGGt > 7:169264/1‑148 (MQ=255) cGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTc < 7:318766/149‑1 (MQ=255) ggCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCa > 5:136124/1‑149 (MQ=255) gcagGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTgg < 6:48859/149‑1 (MQ=255) cagGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGt < 5:198896/149‑1 (MQ=255) ggTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTc > 8:6258/1‑148 (MQ=255) tCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCCCGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGAt > 8:206932/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGgtgt < 7:206932/148‑1 (MQ=255) gcgcCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACATGGTCGATCAGGGTGGTGTGca > 8:4413/1‑148 (MQ=255) gcgcCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTGGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGcac < 4:135335/149‑1 (MQ=255) gggCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATAtt < 6:89268/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGTGCTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATAtt > 1:76982/1‑149 (MQ=255) cGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCg < 7:113509/149‑1 (MQ=255) cGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCg < 5:75667/149‑1 (MQ=255) tCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTc > 6:274834/1‑149 (MQ=255) cACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTg > 1:35911/1‑140 (MQ=255) cACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTg < 2:35911/140‑1 (MQ=255) cACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTATGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCa < 1:169601/147‑1 (MQ=255) cACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTATGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCa < 1:175294/147‑1 (MQ=255) accaccaccaGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTgcggcg > 2:155235/1‑149 (MQ=255) ccaccaccaGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATAGATATTGCGGTCCAGGCTGCGgcgc < 6:136124/149‑1 (MQ=255) caccaccaGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCa < 7:6258/149‑1 (MQ=255) agcaccaGGGCGTTGAGCTTGGTGG‑CATCCATTATCTTCAGGGGTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGGCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATGAGTGTGGGGTGCACAGCGTTATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAg < 4:93148/147‑1 (MQ=255) ccaccaGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGAACAGGGTGGTGGGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAgg > 4:279389/1‑149 (MQ=255) aGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGGCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCAcc > 4:284668/1‑149 (MQ=255) aTCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCACCGTCGGTGa < 7:339135/148‑1 (MQ=255) gtgGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCACCGTCGGTGAAg < 5:274834/145‑1 (MQ=255) gtgGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCACCGTCGGTGAAGATcc > 6:252425/1‑149 (MQ=255) gtgGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCACCGTCGGTGAAGATcc > 1:281655/1‑149 (MQ=255) | CCAGCTTGATGCCTTTGCCGCGTTGCATGAGGTCCTGGTTCATTCCATCGCTCCTTTACATTACGCCGGCGCGC‑AGCAGGTCATGCATGTTCAGGGCGCCGGTCGGGCGGTCTTCACGGTCCACCACCACCAGGGCGTTGATCTTGTGGT‑CTTCCATTATCTTCAGGGCTTCGGCGGCGAGCATGTCGGCACGCGCAGTCTTGCCATGAACGGTCATGACCTGGTCGATCAGGGTGGTGTGCACATCGATATTGCGGTCCAGGCTGCGGCGCAGGTCACCGTCGGTGAAGATCC > NC_002947/1098536‑1098829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |