Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,114,340 | C→T | 5.8% | G156D (GGC→GAC) | rlmF ← | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,114,340 | 0 | C | T | 5.8% | 204.9 / 2.4 | 70 | G156D (GGC→GAC) | rlmF | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/32); new base T (2/2); total (35/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.73e-01 |
CGCTGGCTGCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCA > NC_002947/1114199‑1114475 | cgcTGGCTGCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGc < 6:191332/148‑1 (MQ=255) ctggctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCTATCGTCCAGGcc > 5:32099/1‑148 (MQ=255) tggctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGc > 8:276434/1‑139 (MQ=255) tggctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGc < 7:276434/139‑1 (MQ=255) tggctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCAtt < 2:352509/149‑1 (MQ=255) gctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCAtt < 2:255022/147‑1 (MQ=255) gctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTgg > 7:257827/1‑149 (MQ=255) ctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGc < 1:207696/149‑1 (MQ=255) tgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGcc > 8:255721/1‑149 (MQ=255) gcgGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑a < 5:276406/149‑1 (MQ=255) gcgGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑a < 6:288203/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCTGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATa < 4:75062/149‑1 (MQ=255) gCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCTATCGTCCAGGCCAATGGCCTgggcaaagc < 6:32099/149‑8 (MQ=255) ttCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCt > 1:37381/1‑149 (MQ=255) cgtcgCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCTCAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCTGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCtt < 7:127480/148‑1 (MQ=255) tcgCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGc < 3:198842/149‑1 (MQ=255) aGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGTCCAGGCCAATGGCCTgggcaaag < 8:198831/134‑7 (MQ=255) aGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGTCCAGGCCAATGGCCTgggcaaag > 7:198831/1‑128 (MQ=255) aGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGc > 6:177270/1‑148 (MQ=255) gCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGCTAGCCTTGGCCGAGGCCAg > 7:187374/1‑149 (MQ=255) aTGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAgcg > 5:227391/1‑149 (MQ=255) aTGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAgcg > 8:317728/1‑149 (MQ=255) ggAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGcc > 3:200033/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCggg > 4:349401/1‑149 (MQ=255) cGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGt < 6:227391/149‑1 (MQ=255) ttGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGAt < 3:315051/149‑1 (MQ=255) ttGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGAt > 6:129662/1‑149 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCg < 7:331990/138‑1 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCg > 8:331990/1‑138 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 8:159858/1‑149 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 4:153891/1‑149 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 3:57964/1‑149 (MQ=255) aGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 7:4164/1‑147 (MQ=255) aGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑ATGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgc > 3:203993/1‑148 (MQ=255) gtcaggtcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagcc > 5:18677/1‑149 (MQ=255) tcaggtcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGC‑‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccga < 4:159226/149‑1 (MQ=255) aggtcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccga < 8:257827/148‑1 (MQ=255) tcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCTGCATGCGGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGGT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGaa < 2:286616/149‑1 (MQ=255) caAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAg > 6:258578/1‑149 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccga < 1:145869/143‑1 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccga > 2:145869/1‑143 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGaa > 1:286616/1‑147 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAgc < 6:129749/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAg < 7:317728/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAg < 7:255721/149‑1 (MQ=255) cctcctGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAg > 2:361165/1‑149 (MQ=255) agcagGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTg > 7:139131/1‑147 (MQ=255) agcagGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTg > 6:259960/1‑147 (MQ=255) agGCCGCTGTGGATGTGCGCGGGGTTGGCCGGCGGGCGCTGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCGTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGGCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGcc < 6:18677/149‑1 (MQ=255) cGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCGGAGCCGAGGAAGCGCCTGCGGTAGTCACTGTAGCCcag > 6:313429/1‑148 (MQ=255) cGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCcag > 1:180949/1‑148 (MQ=255) cGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCcag > 7:228073/1‑148 (MQ=255) gCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGaa > 1:35041/1‑120 (MQ=255) gCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGaa < 2:35041/120‑1 (MQ=255) gCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCcagca < 1:361165/149‑1 (MQ=255) aGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGt < 7:159858/147‑1 (MQ=255) gATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGAt < 5:177270/149‑1 (MQ=255) tgCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGAt < 3:153891/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGAt < 5:258578/148‑1 (MQ=255) cTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAg < 3:349401/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTg < 5:259960/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGc < 7:147710/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGc < 5:129662/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGGAACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCGGCAGTGGATAGATGCAGTTGGccc > 1:269679/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGcccc < 8:228073/149‑1 (MQ=255) gctgGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACg > 4:77291/1‑149 (MQ=255) ctgGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGc > 7:43085/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGTAATGGCT‑TTGGCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGAt < 2:37381/149‑1 (MQ=255) gcAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATg > 3:114827/1‑149 (MQ=255) aGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTc > 5:190935/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGCGGGCAGCGCCAGCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCGGTGGATAGATGCAGTGGGCCCCCACGCCGATGTc > 7:254403/1‑147 (MQ=255) ggTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCa < 3:77291/149‑1 (MQ=255) | CGCTGGCTGCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCA > NC_002947/1114199‑1114475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |