| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,114,349 | T→A | 5.6% | N153I (AAT→ATT) | rlmF ← | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,114,349 | 0 | T | A | 5.6% | 219.7 / 2.6 | 71 | N153I (AAT→ATT) | rlmF | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/32); new base A (2/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
TGGCTGCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTGGGCACCCC > NC_002947/1114202‑1114496 | tggctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCAtt < 2:352509/149‑1 (MQ=255) gctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCAtt < 2:255022/147‑1 (MQ=255) gctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTgg > 7:257827/1‑149 (MQ=255) ctgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGc < 1:207696/149‑1 (MQ=255) tgCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGcc > 8:255721/1‑149 (MQ=255) gcgGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑a < 6:288203/149‑1 (MQ=255) gcgGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑a < 5:276406/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCTGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATa < 4:75062/149‑1 (MQ=255) gCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCTATCGTCCAGGCCAATGGCCTgggcaaagc < 6:32099/149‑8 (MQ=255) ttCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCt > 1:37381/1‑149 (MQ=255) cgtcgCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCTCAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCTGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCtt < 7:127480/148‑1 (MQ=255) tcgCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGc < 3:198842/149‑1 (MQ=255) aGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGTCCAGGCCAATGGCCTgggcaaag < 8:198831/134‑7 (MQ=255) aGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGTCCAGGCCAATGGCCTgggcaaag > 7:198831/1‑128 (MQ=255) aGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGc > 6:177270/1‑148 (MQ=255) gCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGCTAGCCTTGGCCGAGGCCAg > 7:187374/1‑149 (MQ=255) aTGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAgcg > 5:227391/1‑149 (MQ=255) aTGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAgcg > 8:317728/1‑149 (MQ=255) ggAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGcc > 3:200033/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCggg > 4:349401/1‑149 (MQ=255) cGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGt < 6:227391/149‑1 (MQ=255) ttGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGAt > 6:129662/1‑149 (MQ=255) ttGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGAt < 3:315051/149‑1 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCg > 8:331990/1‑138 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCg < 7:331990/138‑1 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 3:57964/1‑149 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 4:153891/1‑149 (MQ=255) acaGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 8:159858/1‑149 (MQ=255) aGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTcc > 7:4164/1‑147 (MQ=255) aGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑ATGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgc > 3:203993/1‑148 (MQ=255) gtcaggtcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagcc > 5:18677/1‑149 (MQ=255) tcaggtcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGC‑‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccg‑a < 4:159226/149‑1 (MQ=255) aggtcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccg‑a < 8:257827/148‑1 (MQ=255) tcaAAGCGTTCGCCCTCCTGCTGCATGCGGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGGT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGaa < 2:286616/149‑1 (MQ=255) caAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAg > 6:258578/1‑149 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccg‑a < 1:145869/143‑1 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTccgagccg‑a > 2:145869/1‑143 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGaa > 1:286616/1‑147 (MQ=255) aaaGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAgc < 6:129749/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAg < 7:317728/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAg < 7:255721/149‑1 (MQ=255) cctcctGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAg > 2:361165/1‑149 (MQ=255) agcagGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTg > 7:139131/1‑147 (MQ=255) agcagGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTg > 6:259960/1‑147 (MQ=255) agGCCGCTGTGGATGTGCGCGGGGTTGGCCGGCGGGCGCTGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCGTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGGCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGcc < 6:18677/149‑1 (MQ=255) cGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCGGAGCCG‑AGGAAGCGCCTGCGGTAGTCACTGTAGCCcag > 6:313429/1‑148 (MQ=255) cGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCcag > 7:228073/1‑148 (MQ=255) cGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCcag > 1:180949/1‑148 (MQ=255) gCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGaa > 1:35041/1‑120 (MQ=255) gCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGaa < 2:35041/120‑1 (MQ=255) gCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCcagca < 1:361165/149‑1 (MQ=255) aGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGt < 7:159858/147‑1 (MQ=255) gATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGAt < 5:177270/149‑1 (MQ=255) tgCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGAt < 3:153891/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGAt < 5:258578/148‑1 (MQ=255) cTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAg < 3:349401/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTg < 5:259960/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGc < 7:147710/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGc < 5:129662/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGGAACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCGGCAGTGGATAGATGCAGTTGGccc > 1:269679/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGcccc < 8:228073/149‑1 (MQ=255) gctgGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACg > 4:77291/1‑149 (MQ=255) ctgGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGc > 7:43085/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGTAATGGCT‑TTGGCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGAt < 2:37381/149‑1 (MQ=255) gcAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATg > 3:114827/1‑149 (MQ=255) aGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTc > 5:190935/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGCGGGCAGCGCCAGCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCGGTGGATAGATGCAGTGGGCCCCCACGCCGATGTc > 7:254403/1‑147 (MQ=255) ggTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCa < 3:77291/149‑1 (MQ=255) tatcgtccAGGCCAATGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAgcgcgcgc > 7:71788/7‑149 (MQ=255) ccAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGAGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACCCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTgg > 2:201611/1‑149 (MQ=255) ccATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCCGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTGGGCAcc < 2:269679/149‑1 (MQ=255) cATTGGCCTGG‑ACGATAGCCGTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGGCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTGGGCAccc < 1:147585/149‑1 (MQ=255) aTTGGCCCGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTGGGCAcccc > 4:20719/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCGTAGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGAAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTGGCCAcccc > 1:101752/1‑149 (MQ=255) | TGGCTGCCGCGGGTGGCTTCGTCGCGTGAGGCATGGAAGGGCGGGTTGCACAGGGTCAGGTCAAAGCGTTCGCCCTCCTGCAGCAGGCCGCTGAGGATGTGCGCTCGGTTGGCCTGCTGGCGCAGGGTAATGGCT‑TTGCCCAGGCCATTGGCCTGG‑ACGATAGCCTTGGCCGAGGCCAGCGCCACCGGGTCGATGTCCGAGCCG‑AGGAAGCGCCAGCGGTAGTCACTGTAGCCCAGCAGTGGATAGATGCAGTTGGCCCCCACGCCGATGTCCAGCGCGCGCACTTGGGCACCCC > NC_002947/1114202‑1114496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |