| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,196,530 | C→T | 5.5% | G197G (GGC→GGT) | xcpQ → | type II secretion pathway protein XcpQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,196,530 | 0 | C | T | 5.5% | 215.6 / 2.6 | 73 | G197G (GGC→GGT) | xcpQ | type II secretion pathway protein XcpQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/32); new base T (2/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
ATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCG > NC_002947/1196384‑1196678 | aTCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGggcag < 3:294893/149‑1 (MQ=255) tCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGCCTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGggcagcggc > 8:157723/1‑149 (MQ=255) cGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCAcc > 3:330461/1‑149 (MQ=255) aTCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAg < 2:273063/147‑1 (MQ=255) gACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTg < 3:110638/147‑1 (MQ=255) aGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgc < 3:145041/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgcg < 3:145852/149‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgcgc < 3:167927/149‑1 (MQ=255) ggTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATg > 5:299207/1‑149 (MQ=255) gTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGTAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGc > 7:14035/1‑149 (MQ=255) gTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGTAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGc > 7:19439/1‑149 (MQ=255) gTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGc < 8:344688/149‑1 (MQ=255) ttaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAg < 8:327046/125‑1 (MQ=255) ttaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAg > 7:327046/1‑125 (MQ=255) acacCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGc > 1:368967/1‑149 (MQ=255) cacCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGc < 4:330461/148‑1 (MQ=255) ccGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCgg < 2:368967/149‑1 (MQ=255) cGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGc > 5:111292/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCg > 6:100653/1‑147 (MQ=255) cccGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGaa < 2:109133/148‑1 (MQ=255) ggcggcGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTgg > 1:86242/1‑149 (MQ=255) gcggcgCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGt < 2:86242/149‑1 (MQ=255) gcgcACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTc > 1:90534/1‑147 (MQ=255) gTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGtgctgc > 8:124416/1‑149 (MQ=255) ggtggtGACTGACTGGAGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg > 8:67535/1‑149 (MQ=255) tggtgACTGGCTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAggg > 4:59773/1‑149 (MQ=255) tggtgACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAggg > 7:318552/1‑149 (MQ=255) tggagACTGACAGCCTCTGCAACCTGGAACGCTTCTCCAGCGTGCTTCTGCTTCTCCACCGCCCTCAAGTGGTACCGGGGAGGTGCAGCACCCTGGTTTTCTACTTGCGCCATGCCT‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGGTCTGGGAggg < 2:103646/149‑1 (MQ=255) gtgACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCt < 6:39939/149‑1 (MQ=255) gactgactGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCTGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCa < 7:157723/149‑1 (MQ=255) tgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGc > 6:211590/1‑148 (MQ=255) actgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAg > 7:90418/1‑149 (MQ=255) tgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAgg > 2:239486/1‑148 (MQ=255) tgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAgg > 1:319128/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCACATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGaa < 1:77194/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAg > 1:22177/1‑149 (MQ=255) gcagcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGa > 3:118957/1‑145 (MQ=255) gcagcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGa < 4:118957/145‑1 (MQ=255) cagcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAgggg > 5:178863/1‑149 (MQ=255) cagcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAgggg > 7:155373/1‑149 (MQ=255) agcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGc > 7:224313/1‑149 (MQ=255) gcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCg < 5:211590/149‑1 (MQ=255) caACCTCGAACGCATCGCCAGCCGGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCgg < 7:147611/149‑1 (MQ=255) aaCCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGt < 2:319128/149‑1 (MQ=255) tCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCTAGGGCTCAGCCAGGAAGGCGCGGTGCCg > 2:45822/1‑149 (MQ=255) tCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCg > 4:238933/1‑149 (MQ=255) cGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTTccctggtg < 3:59773/149‑7 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTg > 1:200658/1‑147 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGaa < 2:107702/149‑1 (MQ=255) aTCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGCGCGGTGCCGGTTGAAgg > 6:135190/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGcgcg > 6:45760/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGATGCGCCAGCGCGACCGCCCTCAAGATGTACCGGGCATCGGCAGCACCCAGGTTATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGTGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCgg < 1:45822/149‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACC‑GGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGt > 6:237532/1‑149 (MQ=255) ctgcGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGTAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGc < 8:14035/149‑1 (MQ=255) ctgcGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGTAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGc < 8:19439/149‑1 (MQ=255) gcCTGCTCGACCGCCGTCAAGAGGTACCGGGCAGCGTCAGCACCCATGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑TTGCCGGCGTAGTGGTCAAGGTGCTGGGAGGGCTCAGCCAGGTAGGGGCGGNGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCagag < 1:213800/149‑1 (MQ=255) gcCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCagag < 6:178863/149‑1 (MQ=255) gcCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGGGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCagag < 1:208166/149‑1 (MQ=255) aGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGc < 7:124416/149‑1 (MQ=255) cccTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAccggc > 6:157184/1‑149 (MQ=255) cTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCAt < 4:101034/50‑1 (MQ=255) cTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCAt > 3:101034/1‑50 (MQ=255) tCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAccggccgg > 7:159034/1‑149 (MQ=255) cAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggt > 3:150560/1‑149 (MQ=255) cAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGCGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggt > 1:218331/1‑149 (MQ=255) aaGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtg < 8:90418/149‑1 (MQ=255) aaGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtg > 5:360476/1‑149 (MQ=255) gagGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGc > 1:234873/1‑125 (MQ=255) gagGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGc < 2:234873/125‑1 (MQ=255) gagGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGCGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtggt < 6:299207/149‑1 (MQ=255) gagGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGCGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtggt < 2:218331/149‑1 (MQ=255) agGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGgtggtg > 3:160319/1‑149 (MQ=255) tACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGc > 5:98439/1‑147 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgc < 3:238933/149‑1 (MQ=255) gggCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgccg < 8:159034/149‑1 (MQ=255) cagcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGccgccg < 4:150560/149‑1 (MQ=255) | ATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCA‑ATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCG > NC_002947/1196384‑1196678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |