| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 138,949 | G→A | 6.3% | R519W (CGG→TGG) | kinB ← | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 138,949 | 0 | G | A | 6.3% | 232.3 / 3.4 | 78 | R519W (CGG→TGG) | kinB | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/37); new base A (3/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCTT > NC_002947/138803‑139096 | aaTTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTc > 5:332485/1‑149 (MQ=255) cacaGCGCGAGCCCAAGCCCAGCGCCCCCTTGCTTGCGACCTCCCTGCACGAAAGGCTGGTAGATCCGCGCGTGTGGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGCCGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCAGACGGCATGCa < 8:172327/148‑1 (MQ=255) acaGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATg < 2:132737/145‑1 (MQ=255) acaGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAgg < 2:43965/149‑1 (MQ=255) acaGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAg > 1:132737/1‑148 (MQ=255) cccagcccctGGCCGGCTTTTTTTCGACCTTCCTGCACGTAACGGTGGTAGCTGGGCGCGTTTTGCCCATTCGAAATGGCCTGTGCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCTTGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGcgccc < 6:15266/149‑1 (MQ=255) cccagcccagCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGcgccc > 3:340768/1‑149 (MQ=255) cccagcccagCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGcgccc < 4:214322/149‑1 (MQ=255) cccagcccagCGCCGCCTTTCTAAAGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCAATCCGTTGTCATCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCGGTCTGGCATGCAGGCGGATGcgccc > 7:235239/1‑149 (MQ=255) ccagcccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGcgcccg < 2:274719/149‑1 (MQ=255) ccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGtt > 2:97052/1‑149 (MQ=255) cgccgcCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCg < 8:299554/149‑1 (MQ=255) ccgccTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCGCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGt < 5:235540/149‑1 (MQ=255) ccTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGtt > 4:273477/1‑140 (MQ=255) ccTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGtt < 3:273477/140‑1 (MQ=255) ttGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCATCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGAt > 4:154875/1‑149 (MQ=255) acctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTtgtg > 4:166069/1‑149 (MQ=255) ctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTtgtg > 3:344099/1‑147 (MQ=255) gCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagc < 5:248166/149‑1 (MQ=255) cACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgcagc < 1:319467/148‑1 (MQ=255) aaaGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGtt > 4:303079/1‑149 (MQ=255) cTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCa < 1:75862/149‑1 (MQ=255) tCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgc > 3:170588/1‑135 (MQ=255) tCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTgc < 4:170588/135‑1 (MQ=255) tCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAg > 8:190383/1‑149 (MQ=255) aGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATTATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACt < 3:312525/149‑1 (MQ=255) aGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAACGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACt > 6:8673/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGt > 5:148094/1‑149 (MQ=255) cgcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTc < 4:340768/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTcc < 3:111463/149‑1 (MQ=255) cgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTcc > 6:192304/1‑148 (MQ=255) gcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCaa < 6:332485/149‑1 (MQ=255) cTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAg < 7:241076/136‑1 (MQ=255) ttgttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCATTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTtgt < 7:301849/119‑1 (MQ=255) ttgttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCATTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTtgt > 8:301849/1‑119 (MQ=255) ttgttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCAGTTGTACTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATTCCGTCTGGCATGAAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACt > 1:47679/1‑149 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTgg < 7:46990/148‑1 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTgg < 3:303079/148‑1 (MQ=255) gCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGc < 3:52278/148‑1 (MQ=255) cccATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGa > 5:311207/1‑149 (MQ=255) ccATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGAc > 5:289446/1‑149 (MQ=255) ccATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGAc < 1:186856/149‑1 (MQ=255) tAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTc > 7:273583/1‑149 (MQ=255) gAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGc > 7:290940/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCATCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCAGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCt < 3:154875/149‑1 (MQ=255) ccTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGCATGCGCCCGCCGTTGGCGGAATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCACGTTGTCCAGCCCTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCGGGATa > 8:260384/1‑149 (MQ=255) caccGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATCCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAcgc < 6:217217/147‑1 (MQ=255) ccGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCgg > 1:216516/1‑149 (MQ=255) gTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAgcg > 8:157980/1‑149 (MQ=255) gTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGAAGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAgc < 1:97052/148‑1 (MQ=255) ctCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCACCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTTGATACGCGGTAgcg < 5:51228/148‑1 (MQ=255) cTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCACCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTAGGCCTGGATACGCGGTAgca > 6:51228/1‑145 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGcggcgg > 6:102918/1‑149 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGcggcgg > 7:329940/1‑149 (MQ=255) gACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGcggcgg < 4:88268/147‑1 (MQ=255) gCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCa < 3:127718/149‑1 (MQ=255) tgatgaTCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGGCCAGt > 5:120514/1‑149 (MQ=255) tgatCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTcc < 4:140314/149‑1 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTg < 6:195754/118‑1 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTg > 5:195754/1‑118 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTg < 7:190383/149‑1 (MQ=255) cACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTg < 8:290940/148‑1 (MQ=255) aCCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGGCCAGTTCCTTGAt < 3:284630/149‑1 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGAt > 6:287830/1‑148 (MQ=255) ccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCGGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATc > 3:83031/1‑148 (MQ=255) ccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGa < 4:93394/146‑1 (MQ=255) ccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGa > 3:93394/1‑146 (MQ=255) 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cTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAAc > 4:132629/1‑146 (MQ=255) cATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAAc < 8:108937/143‑1 (MQ=255) cATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAAc > 7:108937/1‑143 (MQ=255) tGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTg > 2:178815/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCtt > 7:268710/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCtt < 5:287830/149‑1 (MQ=255) | AATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCTT > NC_002947/138803‑139096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |