Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,249,690 | A→G | 6.2% | D196G (GAC→GGC) | bvgA → | virulence factors transcription regulator BvgA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,249,690 | 0 | A | G | 6.2% | 189.6 / 2.4 | 64 | D196G (GAC→GGC) | bvgA | virulence factors transcription regulator BvgA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/32); new base G (2/2); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.65e-01 |
CTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCT > NC_002947/1249542‑1249829 | cTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGa < 6:314617/149‑1 (MQ=255) cgcgAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGa < 7:10879/147‑1 (MQ=255) gcgAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATc > 4:187135/1‑148 (MQ=255) cgAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATc > 3:293479/1‑147 (MQ=255) agaAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGc < 5:204719/149‑1 (MQ=255) aaTGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGTCGTTCGAACAAGGAGATTTCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCTGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTg < 1:154882/148‑1 (MQ=255) aTGACGGTGCTGCAACAACTGGTGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGgc > 4:367557/1‑149 (MQ=255) aTGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGgc > 5:28059/1‑149 (MQ=255) aTGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGgc > 7:20558/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCaa > 6:353535/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCAATTACCTCAGTTTCAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAAc < 1:307235/149‑1 (MQ=255) gcAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAg > 1:247567/1‑149 (MQ=255) gcAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAg > 1:242261/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGaa < 5:353535/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGaa < 4:293479/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCGAGCGCGGTCGAACCAGGATAAATCCGACAGAATGTACCTCACTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGaa < 8:241225/149‑1 (MQ=255) tGGCTCGAGGTCGTTCGAACAAGGAGATGGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAATCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCTACGGCAAGGTCTGAAc < 3:218424/149‑1 (MQ=255) gCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCaa < 1:119780/149‑1 (MQ=255) gAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCtt > 2:264939/1‑148 (MQ=255) aaCAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTg > 1:127770/1‑148 (MQ=255) aaCAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGa < 2:204957/149‑1 (MQ=255) aCAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGaa < 7:106611/149‑1 (MQ=255) aCAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGaa < 3:153593/149‑1 (MQ=255) ggAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCt < 2:247567/149‑1 (MQ=255) ggAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCt < 2:242261/149‑1 (MQ=255) agaTTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTc < 8:20558/148‑1 (MQ=255) gaTTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTcca > 8:92875/1‑149 (MQ=255) gaTTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTc > 8:160006/1‑147 (MQ=255) ccGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTccagccag < 7:92875/149‑1 (MQ=255) ccGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTccagccag > 1:296305/1‑149 (MQ=255) cGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCagg < 5:145438/149‑1 (MQ=255) gCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCt < 2:127770/149‑1 (MQ=255) tACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTTAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCTGGCTGGAGGCttcaa < 2:263441/148‑4 (MQ=255) aCCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGGCCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑c > 1:373835/1‑147 (MQ=255) cTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTc > 6:339255/1‑100 (MQ=255) cTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTc < 5:339255/100‑1 (MQ=255) aGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAggg < 3:214780/147‑1 (MQ=255) aaGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGGCCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGt < 2:373835/149‑1 (MQ=255) aaGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGt > 6:209587/1‑149 (MQ=255) tCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGAc > 3:67277/1‑149 (MQ=255) aGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCTGGCTGGAGGCttcaa < 3:128845/127‑4 (MQ=255) aGTACCTACAAGTCACGGCTACTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCTGGCTGGAGGCttcaa > 4:128845/1‑124 (MQ=255) gTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTAc < 2:296305/149‑1 (MQ=255) tACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACg > 5:140563/1‑149 (MQ=255) cTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGGCCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGa > 8:56372/1‑149 (MQ=255) cTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGa > 7:304674/1‑149 (MQ=255) tACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGAc > 1:256565/1‑149 (MQ=255) cAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGGCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTcca < 2:129148/104‑1 (MQ=255) aaGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCg > 1:246717/1‑149 (MQ=255) aGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCg > 2:274852/1‑148 (MQ=255) tCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCAc < 3:367557/149‑1 (MQ=255) aCGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTa > 2:237962/1‑149 (MQ=255) gctgctgctCAAGCTCAATGCTCGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCGATCGGGCCATGACTACGGGACCCGCACTGCAg < 6:144595/149‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGGCCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTc < 7:56372/148‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTc < 8:304674/148‑1 (MQ=255) gctcaagctcaaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCttt > 7:198954/1‑102 (MQ=255) gctcaagctcaaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCttt < 8:198954/102‑1 (MQ=255) ctcaagctcaaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTaa > 2:343395/1‑149 (MQ=255) aagctcaaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTaa < 1:264939/147‑1 (MQ=255) aaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTGCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCg > 5:325740/1‑149 (MQ=255) aTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCgg < 1:343395/149‑1 (MQ=255) aTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCgg < 1:237962/149‑1 (MQ=255) cACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAAATGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGca > 2:99128/1‑147 (MQ=255) aCGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCa > 3:281286/1‑148 (MQ=255) aTTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCt < 6:27761/148‑1 (MQ=255) | CTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTG‑CCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCT > NC_002947/1249542‑1249829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |