| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 163,034 | A→G | 6.2% | I267T (ATT→ACT) ‡ | scpC ← | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 163,034 | 0 | A | G | 6.2% | 241.6 / 4.4 | 81 | I267T (ATT→ACT) ‡ | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/42); new base G (3/2); total (37/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.62e-01 | |||||||||||
CGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTG > NC_002947/162887‑163179 | cgcgTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAAt < 7:201448/149‑1 (MQ=255) aCAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGcc > 7:121513/1‑148 (MQ=255) aGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCCCCGCATTGGCAATGCTGCCAAt > 5:111959/1‑149 (MQ=255) gggATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAGCATTGCCAATGcg < 2:324417/147‑2 (MQ=255) gTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAGCATTGCCAATGcg < 4:281934/149‑2 (MQ=255) tGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCg < 8:212285/149‑1 (MQ=255) gATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCgg > 3:351939/1‑149 (MQ=255) gATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCgg > 7:276296/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATGCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCgg > 1:254947/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGc > 5:378247/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAg > 4:238356/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGAAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAg > 1:317369/1‑149 (MQ=255) gCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCg > 4:40031/1‑149 (MQ=255) cGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCggg > 6:211435/1‑149 (MQ=255) gATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGcc < 1:126615/149‑1 (MQ=255) cGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAg < 6:378247/148‑1 (MQ=255) cGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAg < 6:79767/148‑1 (MQ=255) gAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGTGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCt > 3:121440/1‑149 (MQ=255) gAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCt < 5:211435/149‑1 (MQ=255) gAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCt > 2:233713/1‑149 (MQ=255) aagctaagctTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCtt < 3:160518/149‑1 (MQ=255) aagctaagctTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCtt > 3:254988/1‑149 (MQ=255) gctaagctTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCttgt < 5:175166/149‑1 (MQ=255) gctaagctTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCttgt < 5:119408/149‑1 (MQ=255) agctTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTgg < 5:93631/148‑1 (MQ=255) agctTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGt > 4:152946/1‑149 (MQ=255) cAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCt < 2:317369/149‑1 (MQ=255) aT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGt < 6:172243/138‑1 (MQ=255) aT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGt > 5:172243/1‑138 (MQ=255) t‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGTGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGc < 4:121440/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCa < 1:249015/148‑1 (MQ=255) tCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGc < 4:254988/145‑1 (MQ=255) cAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCa > 6:239291/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActt > 8:5757/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActt > 4:93086/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcct > 6:160442/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcct > 6:22068/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcc < 3:151582/148‑1 (MQ=255) gAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcc < 5:263943/148‑1 (MQ=255) gTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCcttctt < 3:350386/149‑1 (MQ=255) tGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTg < 8:276296/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGt > 1:179664/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCACTACGGACTACAAGGACAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCCGCATCCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCAAACGGCCAGCATCCAATTCCTACTTGAg > 4:252014/1‑144 (MQ=255) atGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTTCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAg < 3:252014/143‑1 (MQ=255) cagcaCTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGa < 5:48867/149‑1 (MQ=255) gcaCTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATc < 6:111959/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAg < 7:122538/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAg < 1:5047/149‑1 (MQ=255) cTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAgg < 5:119648/149‑1 (MQ=255) ttCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAggt > 5:71082/1‑149 (MQ=255) ttCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCAGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAggt > 5:178669/1‑149 (MQ=255) gTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCCGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCgg > 2:267380/1‑149 (MQ=255) aCATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGc < 3:238356/148‑1 (MQ=255) cATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGa > 1:281509/1‑149 (MQ=255) aTGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGAt < 5:239291/149‑1 (MQ=255) aGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCt < 4:351939/148‑1 (MQ=255) tCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTgtgt < 2:102087/149‑1 (MQ=255) cGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGttt < 3:152946/147‑1 (MQ=255) gAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTtca < 2:179664/148‑1 (MQ=255) aaCGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTtcatc < 4:242017/149‑1 (MQ=255) aaCGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTtcat > 4:148334/1‑148 (MQ=255) ggCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCatcatc < 3:93086/149‑1 (MQ=255) cGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTg < 3:40031/149‑1 (MQ=255) gACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTgg > 8:286373/1‑149 (MQ=255) aCCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGaa < 5:249645/86‑1 (MQ=255) aCCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGaa > 6:249645/1‑86 (MQ=255) aCCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGa < 2:254947/149‑1 (MQ=255) cggCATTGGCAGCATTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAg > 5:33743/3‑149 (MQ=255) cggCATTGGCAGCATTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAg > 3:81926/3‑149 (MQ=255) ccGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGgcagc < 3:354500/134‑1 (MQ=255) ccGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGgcagc > 4:354500/1‑134 (MQ=255) ccGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAg > 7:331379/1‑149 (MQ=255) cGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGActcgccgt > 5:43953/1‑142 (MQ=255) gCATTGGCAGCATTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCGGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGta > 2:279610/1‑148 (MQ=255) gCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTc < 1:164669/149‑1 (MQ=255) cATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTcc < 6:178669/149‑1 (MQ=255) cATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTcc < 7:286373/149‑1 (MQ=255) ttGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCgg > 8:33896/1‑149 (MQ=255) ggCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGc < 5:160442/148‑1 (MQ=255) ggCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCt > 6:289070/1‑149 (MQ=255) gCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTg < 6:71082/149‑1 (MQ=255) | CGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCAT‑CGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTG > NC_002947/162887‑163179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |