| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,585,219 | G→A | 5.6% | intergenic (‑206/‑170) | PP_1388 ← / → PP_1389 | EmrB/QacA family drug resistance transporter/oxaloacetate decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,585,219 | 0 | G | A | 5.6% | 212.8 / 2.1 | 71 | intergenic (‑206/‑170) | PP_1388/PP_1389 | EmrB/QacA family drug resistance transporter/oxaloacetate decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/33); new base A (2/2); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
CCTCGGATTGTAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTCGGTAGT > NC_002947/1585073‑1585359 | ccTCGGATTGTAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGt > 6:138950/1‑149 (MQ=255) cTCGGATTGTAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGtt > 6:248955/1‑149 (MQ=255) cTCGGATTGTAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCACCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGtt > 1:272807/1‑149 (MQ=255) ggATTGTAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGt < 6:7957/149‑1 (MQ=255) tAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATGCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTgcagc < 5:341500/148‑1 (MQ=255) tAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAACCTGGTgcaag < 3:41720/148‑3 (MQ=255) aaCCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCACCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTgcagca > 2:159520/1‑148 (MQ=255) cTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATAtt > 7:296096/1‑149 (MQ=255) aGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGcc < 5:91315/149‑1 (MQ=255) ggTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACTGAGGCTGAAATCCGGGGC‑TGCACCAACCTGGTgcaagccc < 5:316659/138‑6 (MQ=255) ggTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACTGAGGCTGAAATCCGGGGC‑TGCACCAACCTGGTgcaagccc > 6:316659/1‑133 (MQ=255) gTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGt > 8:52293/1‑149 (MQ=255) cTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGttttt < 6:138556/149‑1 (MQ=255) ttCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGttttt > 8:334937/1‑148 (MQ=255) ccTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCa < 3:95140/148‑1 (MQ=255) tATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAg > 1:309319/1‑138 (MQ=255) tATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAg < 2:309319/138‑1 (MQ=255) tATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTAAGTc > 2:106578/1‑149 (MQ=255) tGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGCATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCg > 2:5998/1‑149 (MQ=255) tACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCt < 1:6387/149‑1 (MQ=255) tACTATCTGCATACCCTATGCAAGATCGTCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGc < 7:329972/148‑1 (MQ=255) aCTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTg > 3:106039/1‑149 (MQ=255) tCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTg < 5:5555/113‑1 (MQ=255) tCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTg > 6:5555/1‑113 (MQ=255) tCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGtctc > 1:273418/1‑149 (MQ=255) cTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGtctc < 7:261888/148‑1 (MQ=255) tCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCacac < 7:334937/149‑1 (MQ=255) ccTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGttttt > 5:96724/1‑126 (MQ=255) ccTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGttttt < 6:96724/126‑1 (MQ=255) cTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGATGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCttt > 7:284090/1‑149 (MQ=255) tGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTAt < 5:72686/149‑1 (MQ=255) cAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTAtt < 1:150980/148‑1 (MQ=255) gATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCctc < 8:296096/149‑1 (MQ=255) aTCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCctct > 1:36588/1‑149 (MQ=255) gCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTctgcct < 5:248955/149‑1 (MQ=255) cgcATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGt < 7:52293/148‑1 (MQ=255) cgcATTCATCCAGTGCAGCATGGCTGCGTGATATCGTTTGTATGACACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCTCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTc < 8:276777/149‑1 (MQ=255) cATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGttttt > 8:28823/1‑103 (MQ=255) cATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGttttt < 7:28823/103‑1 (MQ=255) cATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGa < 7:285747/149‑1 (MQ=255) cATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGa < 5:138950/149‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTGTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTACTCTGCCTGCATGTCGAGCATg > 2:257441/1‑149 (MQ=255) tCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCCGTCCGCTGGCTCCCACACGTTTTATGCATCTTCCTGCATTTCGAGAATGa > 8:321226/1‑149 (MQ=255) aGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCAAACATTTTATTCCTCTGCATGCAAGTCGAGCATCACCg > 4:89773/1‑149 (MQ=255) ctgcATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGccc < 1:159520/148‑1 (MQ=255) tGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATgg > 2:223297/1‑149 (MQ=255) cGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACgg < 2:36588/149‑1 (MQ=255) gTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGt < 4:106039/149‑1 (MQ=255) gTTCGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCAGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAAcag < 2:289186/149‑1 (MQ=255) gTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAAcaggtc < 6:4592/148‑1 (MQ=255) tATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAAcaggtcag > 7:142430/1‑149 (MQ=255) aTGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGa < 1:184789/116‑1 (MQ=255) aTGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGa > 2:184789/1‑116 (MQ=255) tGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAAcaggtcagg > 4:11250/1‑148 (MQ=255) ccACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAAcaggtcagg > 4:165118/1‑146 (MQ=255) ccACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAAcaggtcagg < 3:165118/146‑1 (MQ=255) acaGAGTCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGAc < 6:342380/149‑1 (MQ=255) acaGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGAc > 2:2365/1‑149 (MQ=255) acaGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTACTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGAc > 3:56653/1‑149 (MQ=255) aaaTCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAg > 5:141633/1‑149 (MQ=255) aaTCCGTGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAg < 3:89773/148‑1 (MQ=255) aaTCCGGGGCTTTCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATATCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAg < 5:366142/148‑1 (MQ=255) aaTCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATATCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAg > 6:366142/1‑148 (MQ=255) ccGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGt > 5:201933/1‑149 (MQ=255) cGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCtttt < 3:279436/69‑1 (MQ=255) cGGCGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCtttt > 4:279436/1‑69 (MQ=255) aatatgctGCACCAACCTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTc > 3:82855/8‑149 (MQ=255) ggggCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTCg > 1:26601/1‑149 (MQ=255) gggCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTCgg < 3:11250/149‑1 (MQ=255) ttGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTCGGTAGt > 3:344268/1‑149 (MQ=255) ttGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTCGGTAGt > 1:206638/1‑149 (MQ=255) | CCTCGGATTGTAACCTGAGTTAGGTAGCTTCCTATGTACTATCTGCATCCCCTATGCAAGATCGGCATTGGCGCATTCATCCAGTGCTGCATGGCTGCGTGATATCGTTGGTATGCCACAGAGGCTGAAATCCGGGGCTTGCACCAGGTTGGTGCAGCATATTGCCGCAGGTTTTTCAGTCCGCTGTCTCCCACACCTTTTATTCCTCTGCCTGCATGTCGAGCATGACCGCCCAGATGGCGACGGTTGGAACAGGTCAGGTAGACCCGATTACAGGGGTCGGTAGT > NC_002947/1585073‑1585359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |