Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,586,720 | G→A | 6.0% | A229V (GCG→GTG) | PP_1391 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,586,720 | 0 | G | A | 6.0% | 199.8 / 2.1 | 66 | A229V (GCG→GTG) | PP_1391 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/33); new base A (2/2); total (31/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.22e-01 |
ATGTGTTTGCGCGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTTGTGCAGGCTCAGTTCCTCAACCC > NC_002947/1586579‑1586867 | aTGTGTTTGCGCGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCt > 2:102744/1‑149 (MQ=255) tgtgTTTGCGCGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCtt < 7:127874/149‑1 (MQ=255) tttGCGCGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCACAGCCCTTTg > 3:145608/1‑147 (MQ=255) tttGCGCGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCACAGCCCTTTg > 3:151198/1‑147 (MQ=255) gcgcGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAgg < 2:109821/148‑1 (MQ=255) cgcgACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAggg < 8:12195/148‑1 (MQ=255) cgcgACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGt < 4:145069/149‑1 (MQ=255) gcgACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGtc < 8:231150/149‑1 (MQ=255) gcgACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGt > 4:367532/1‑148 (MQ=255) taCACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCGCCTc > 3:142783/1‑149 (MQ=255) taCACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTc > 6:71382/1‑149 (MQ=255) cacCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGt > 8:272320/1‑149 (MQ=255) acCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt < 5:71382/149‑1 (MQ=255) acCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt > 6:146201/1‑149 (MQ=255) cATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCa < 5:326289/149‑1 (MQ=255) tCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCTGGCTGGCGCAggtatc > 1:201283/1‑117 (MQ=255) tCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCTGGCTGGCGCAggtatc < 2:201283/122‑6 (MQ=255) aCGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATa > 8:163191/1‑149 (MQ=255) gcgGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCTCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCGTTTGCAGGGTCTTCACCTCGTTGGGTCTGATGT‑TTCCGGATACg > 6:54032/1‑149 (MQ=255) gCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACgg < 7:353642/148‑1 (MQ=255) cTCAGGCAGCAGAAGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGa > 2:133592/1‑149 (MQ=255) aGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGAc < 7:272320/147‑1 (MQ=255) aGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGAc < 5:54032/147‑1 (MQ=255) ggCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGGTGGCACTGATGT‑TTACGGATACGGGCACGGCGACctc > 3:232756/1‑148 (MQ=255) cagACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGc < 7:273911/149‑1 (MQ=255) gACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCg < 5:146201/149‑1 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTAc > 6:29335/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTAc > 4:318989/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTAc > 5:115783/1‑149 (MQ=255) aGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACcgc < 2:300143/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGc > 4:46547/1‑149 (MQ=255) cccGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGGCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGc < 8:131519/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGcc > 4:263857/1‑149 (MQ=255) cGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCTGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCca > 3:118710/1‑149 (MQ=255) cGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCca > 8:32475/1‑149 (MQ=255) ggCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCcac < 5:314720/149‑1 (MQ=255) cGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACaa < 7:32475/149‑1 (MQ=255) gTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCACAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAg < 4:151198/149‑1 (MQ=255) gTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCACAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAg < 4:145608/149‑1 (MQ=255) aTGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCAAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGAGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCt > 6:251095/1‑149 (MQ=255) tGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCTGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCt < 4:118710/148‑1 (MQ=255) tGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCt < 1:88152/148‑1 (MQ=255) ggcggcTGCGGCCTGGTAGGTTGGCATGATGGTGATAACTGCGCCATCCATGGCATCCCTTTGCATGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTCTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCt < 1:102744/148‑1 (MQ=255) gTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTc < 3:258806/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTATGTTGGCAGCAGTGTGATACGTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGGCATCACCTCGTTGGCACGGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCg < 4:232756/146‑1 (MQ=255) ggCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCGCTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACctgctg > 4:173152/1‑111 (MQ=255) ggCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCGCTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACctgctg < 3:173152/111‑1 (MQ=255) ggCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCg > 5:319408/1‑115 (MQ=255) ggCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCg < 6:319408/115‑1 (MQ=255) gCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTTATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCATAAGCAGGGTCAGCACCTCGTTGGCACTGATGT‑GTCCGGATACGGGCACGGCGACATGCAGGCCGGCTACCGCGAAAACCCAAAAGATGTGTCCGAAg > 7:57814/1‑147 (MQ=255) gCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGa < 8:338514/103‑1 (MQ=255) gCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGa > 7:338514/1‑103 (MQ=255) ccTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAg > 6:138714/1‑149 (MQ=255) ccTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAg > 4:313559/1‑149 (MQ=255) gTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCAt < 5:29335/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCAGCATGGTGATACGTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGTTACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATgg < 2:207694/148‑1 (MQ=255) ggCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCa < 3:46547/148‑1 (MQ=255) gcaTGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAg < 8:57814/149‑1 (MQ=255) gcaTGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAg < 3:367532/149‑1 (MQ=255) aTGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGtt < 6:115783/149‑1 (MQ=255) ggTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTtgt > 8:16986/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGaaa < 5:282903/100‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTTGTGCAGGc > 5:220129/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑ATCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCCGCTACAGCGaaa > 6:282903/1‑100 (MQ=255) gccagccaGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTTGTGCAGGCTCAGtt > 6:79214/1‑149 (MQ=255) gccagcGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCGCCTCGTCGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGTGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTTGTGCAGGCTCAGTTCCTc < 4:142783/149‑1 (MQ=255) gcAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTTGTGCAGGCTCAGTTCCTCAAccc < 7:163191/148‑1 (MQ=255) | ATGTGTTTGCGCGACGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGT‑TTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGGCATGGGTCAGGCAGTTGTGCAGGCTCAGTTCCTCAACCC > NC_002947/1586579‑1586867 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |