Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,600,070 | A→T | 6.6% | Y372N (TAC→AAC) | bglX ← | beta‑D‑glucoside glucohydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,600,070 | 0 | A | T | 6.6% | 177.3 / 2.8 | 61 | Y372N (TAC→AAC) | bglX | beta‑D‑glucoside glucohydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/34); new base T (2/2); total (25/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.78e-01 |
TCGATCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAG > NC_002947/1599925‑1600205 | tCGATCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGTGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCgtagta < 1:245001/149‑1 (MQ=255) cGATCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGTTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCgtagta < 5:119282/148‑1 (MQ=255) gATCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTagtagt > 3:325872/1‑149 (MQ=255) gATCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTagtagt > 3:320620/1‑149 (MQ=255) tCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTcc > 3:169166/1‑149 (MQ=255) ggAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGCTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCACCCCAACCAGGATCCGGCGTGCACCGTCCCGCGCAGATACGCGGTGCGGGCGGTCGTAGCCGAATTAGTCCtt > 8:148611/1‑149 (MQ=255) ggtCGGCCCGCTCGCCGATCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGa < 8:259575/147‑1 (MQ=255) cATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCgtagta > 1:69244/1‑139 (MQ=255) cATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCgtagta < 2:69244/139‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATc < 6:212003/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGTGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCg < 1:275114/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGt > 7:294434/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGtt > 3:138923/1‑149 (MQ=255) ggCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGCTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGcc < 1:263356/149‑1 (MQ=255) ccGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCtt < 6:268816/149‑1 (MQ=255) aCCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGcc > 5:364042/1‑149 (MQ=255) cAAGGCAATGGTGCCGGCCCTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCgta < 1:133060/117‑1 (MQ=255) cAAGGCAATGGTGCCGGCCCTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCgta > 2:133060/1‑117 (MQ=255) aaGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGAt > 5:311831/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACg > 3:274931/1‑148 (MQ=255) gTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGt < 4:320620/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGt < 4:325872/148‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTAc < 4:138923/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACgg < 2:249942/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACgg < 8:287398/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACgg > 4:330768/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCg < 3:237695/125‑1 (MQ=255) cGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCg > 4:237695/1‑125 (MQ=255) cGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACggg > 8:106678/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACggg < 2:206552/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACggg > 5:237429/1‑149 (MQ=255) cTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGGTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGTTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCt < 8:348146/149‑1 (MQ=255) gCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAgg > 6:54653/1‑149 (MQ=255) cGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTAc > 8:305199/1‑133 (MQ=255) cGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTAc < 7:305199/133‑1 (MQ=255) cGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGc < 3:330768/149‑1 (MQ=255) ggCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGcc < 4:169166/149‑1 (MQ=255) gCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGccc < 4:319113/149‑1 (MQ=255) tGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTg < 7:126290/149‑1 (MQ=255) cGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACa > 4:104409/1‑130 (MQ=255) cGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACa < 3:104409/130‑1 (MQ=255) gTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCAc > 3:184748/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTTGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAg > 6:53223/1‑148 (MQ=255) ccAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTTGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGc > 6:58773/1‑149 (MQ=255) cagcagCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCa > 1:91250/1‑149 (MQ=255) gcagcaCCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACt > 4:98085/1‑149 (MQ=255) agcaCCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTTCGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTc < 8:314729/149‑1 (MQ=255) gcaCCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTcc < 6:177900/149‑2 (MQ=255) caCCAGGCTGCGGCGTGCCACGGCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCAc < 7:148611/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTAGCGGTGCAGGCGGTCGTTTCCGTAGTAGTCATTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTAGAACTTGGAACCCCGCACTTCCCGCa > 8:319322/1‑149 (MQ=255) gcggcgTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCt < 4:184748/149‑1 (MQ=255) cggcgTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTg < 6:237429/149‑1 (MQ=255) cggcgTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTg < 7:6369/149‑1 (MQ=255) ggcgTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTgg < 5:54653/149‑1 (MQ=255) ccACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGc > 7:168600/1‑149 (MQ=255) cACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCt > 6:360221/1‑149 (MQ=255) cgcgcgCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCgcgc > 5:200617/1‑149 (MQ=255) gcgcgcAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCt < 8:168600/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTg < 7:106678/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTTGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTgg < 5:53223/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTTGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTgg < 5:58773/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTgg < 6:364042/149‑1 (MQ=255) gcAGCTTCGCGGTGCAGGAGGTCGTGGCGGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCAGCGACTGGTCCAGCTCGCGCTgg < 8:294434/147‑1 (MQ=255) aGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCa > 2:89679/1‑149 (MQ=255) gCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCAc < 4:274931/149‑1 (MQ=255) cTTCGCGGTGGAGGCGGTCGTTGCGGTAGTAGTCCTTCTGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCAc < 2:91250/148‑1 (MQ=255) cgcgGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTc < 6:311831/148‑1 (MQ=255) gTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCg > 1:241101/1‑148 (MQ=255) cGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTcag < 2:241101/149‑1 (MQ=255) | TCGATCGGAGCATCGGCCAGCGGGCCGACCAAGGCAATGGTGCCGGCCTTTTTCAGCGGCAGGGTCTGGTTGCGGTTTTCCAGCAGCACCAGGCTGCGGCGTGCCACGTCGCGCGCAGCTTCGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAG > NC_002947/1599925‑1600205 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |