| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,622,192 | T→C | 7.0% | L369S (TTG→TCG) | PP_1421 → | sensor histidine kinase TctE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,622,192 | 0 | T | C | 7.0% | 207.3 / 3.6 | 71 | L369S (TTG→TCG) | PP_1421 | sensor histidine kinase TctE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base C (2/3); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCG > NC_002947/1622045‑1622336 | gCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttg > 6:79647/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt < 6:223188/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt < 5:79647/149‑1 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGttgttg < 7:96746/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGGGTCTGGACTTGAGTCTGTTTGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:269107/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 6:19552/149‑1 (MQ=255) cgcAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGGGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAg < 4:155338/148‑1 (MQ=255) aGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAAc > 4:75451/1‑149 (MQ=255) cTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggt > 2:358017/1‑149 (MQ=255) tGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggtg > 6:27253/1‑149 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggt < 3:214448/146‑1 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGa < 2:368533/149‑1 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGa > 3:146029/1‑149 (MQ=255) cTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGc > 5:273891/1‑136 (MQ=255) cTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGc < 6:273891/136‑1 (MQ=255) ttGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACaa > 4:83600/1‑149 (MQ=255) gAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAAt < 1:67239/148‑1 (MQ=255) gAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCa < 1:221494/134‑1 (MQ=255) gAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCa > 2:221494/1‑134 (MQ=255) gTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACaa > 2:56815/1‑145 (MQ=255) gTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACaa < 1:56815/145‑1 (MQ=255) aGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTg < 3:331186/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCaatg < 3:179326/131‑3 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATa < 4:325776/149‑1 (MQ=255) cgcgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATAc > 3:23735/1‑149 (MQ=255) gcgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACg > 1:104561/1‑149 (MQ=255) cgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGc < 5:27253/149‑1 (MQ=255) aGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCa < 2:330300/149‑1 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCgg < 3:351449/148‑1 (MQ=255) gCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GCGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt > 6:254158/1‑149 (MQ=255) gCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt > 6:314653/1‑149 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg > 6:255507/1‑149 (MQ=255) atggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTgg < 3:83600/149‑1 (MQ=255) atggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTgg < 2:104561/149‑1 (MQ=255) atggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgt < 8:33511/149‑1 (MQ=255) gcCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAttt < 8:184164/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGCGGCC‑GAGTCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCACCGAGTTGTGGCGCAACCTGGTGGCCAATGACGTGGCGCATACGCAAGCGGGGGGCAATGTGAttttt > 7:351272/1‑148 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTg < 4:313675/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTg > 2:129043/1‑149 (MQ=255) tttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAGGTGATTTTGc > 5:220713/1‑149 (MQ=255) gcgcACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAt < 4:265418/135‑1 (MQ=255) gcgcACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAt > 3:265418/1‑135 (MQ=255) gcACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTaa > 6:177692/1‑149 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAAt > 4:91531/1‑149 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAAt < 4:146029/149‑1 (MQ=255) caAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATgg < 8:240791/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCTTACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGgcg > 1:22435/1‑149 (MQ=255) tggcgctggcgcTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTg < 3:75451/149‑1 (MQ=255) gctggcgctggAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtgg < 3:220755/149‑1 (MQ=255) ctggcgctggAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtgga < 8:8937/149‑1 (MQ=255) gcgctggAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagt < 2:182070/149‑1 (MQ=255) cgctggAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtg < 4:23735/149‑1 (MQ=255) ctggAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGTATAATACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTTGTGGACAATGCCTTTGAGCATACGCAAGAGGGTGGAAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgtt < 4:304494/149‑3 (MQ=255) gAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 3:91531/147‑1 (MQ=255) gAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAga > 2:78024/1‑149 (MQ=255) gAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAga < 8:206869/149‑1 (MQ=255) gCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACTAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacga > 6:273647/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg > 3:276417/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg < 5:254158/149‑1 (MQ=255) cGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAgg > 7:134959/1‑148 (MQ=255) ggTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTa > 6:364160/1‑149 (MQ=255) gAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcg > 6:82628/1‑149 (MQ=255) aGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcgc > 6:284140/1‑149 (MQ=255) gCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcgc > 2:130479/1‑148 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCGGTGGCCGAGCGCGAAc > 7:128358/1‑149 (MQ=255) cATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg < 5:364160/149‑1 (MQ=255) cATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTCGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg > 3:260558/1‑149 (MQ=255) ttGCTCAACAACTCGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgt > 6:335602/1‑149 (MQ=255) gCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgtgt > 7:108137/1‑149 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt > 4:355538/1‑54 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt < 3:355538/54‑1 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGACCGGGTGTTc > 6:328703/1‑147 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc < 1:358017/147‑1 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc > 3:306842/1‑147 (MQ=255) gAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCg > 8:192177/1‑149 (MQ=255) | GCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCC‑GAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCG > NC_002947/1622045‑1622336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |