| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,768,092 | A→G | 5.5% | I711V (ATC→GTC) | PP_1577 → | lambda family tail tape meausure protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,768,092 | 0 | A | G | 5.5% | 220.2 / 2.1 | 73 | I711V (ATC→GTC) | PP_1577 | lambda family tail tape meausure protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/33); new base G (2/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.32e-01 | |||||||||||
GCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTAGAGGTCC > NC_002947/1767948‑1768239 | gCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATccc > 7:283944/1‑149 (MQ=255) cATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCcg < 8:329444/149‑1 (MQ=255) cATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCcg > 8:88609/1‑149 (MQ=255) aTTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCcgc > 2:54315/1‑149 (MQ=255) cgATGATCGGGGTTCCCTTCATGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAggg > 6:217715/1‑148 (MQ=255) ttCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGctgctg < 3:164680/149‑1 (MQ=255) ccTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGa < 6:359103/148‑1 (MQ=255) gTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGATAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATggcg < 1:330730/148‑1 (MQ=255) tGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATggcggc < 4:213123/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagc < 8:223807/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGCGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGGCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagc < 7:277396/149‑1 (MQ=255) ggCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGcgagcgag > 4:72281/1‑149 (MQ=255) cAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTc < 5:51945/149‑1 (MQ=255) aaTTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTcc > 3:206198/1‑149 (MQ=255) cACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGc > 4:109309/1‑149 (MQ=255) cACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAACAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGc > 1:39296/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCt > 8:25644/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCt > 1:52339/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGACCCTATCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCt > 1:71579/1‑149 (MQ=255) gcTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTgcg > 6:198429/1‑147 (MQ=255) aTTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCg > 6:127708/1‑149 (MQ=255) cagccgcagccgCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGa < 7:189563/148‑1 (MQ=255) cagccgcagccgCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGAc < 2:9881/149‑1 (MQ=255) cagccgcagccgCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGAc < 3:72281/149‑1 (MQ=255) cgcagcAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCt < 5:198429/149‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTa > 3:151369/1‑149 (MQ=255) agcagGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTAcc > 3:342007/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTg > 6:329393/1‑147 (MQ=255) cTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGc < 7:88609/149‑1 (MQ=255) tgatgaCTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGc > 5:251252/1‑148 (MQ=255) gggTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGtt < 5:329393/149‑1 (MQ=255) gTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGa < 4:151369/149‑1 (MQ=255) gTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGa < 1:115128/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGAt < 6:30030/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGAt < 2:39296/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGc < 4:204706/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCa > 7:32129/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGATGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCAc > 1:279225/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCAc > 7:6533/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCAc > 6:329102/1‑149 (MQ=255) cccTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTc > 3:324153/1‑148 (MQ=255) ccTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCTGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTcc > 6:212961/1‑148 (MQ=255) ccTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTcc > 5:207542/1‑148 (MQ=255) ccTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTcc > 5:354518/1‑148 (MQ=255) cTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCaa < 6:354518/149‑1 (MQ=255) cTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACATCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTcc > 4:252552/1‑147 (MQ=255) cTTTCTGGCCAGGCTCACGGGGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGGACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCaa < 8:59079/149‑1 (MQ=255) tttCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCAAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAg > 6:184648/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCtggtg < 8:32129/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCACGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAAGCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCtggtg > 6:356045/1‑149 (MQ=255) gCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCtggtggtgg < 4:324153/149‑1 (MQ=255) cACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACCACCAGGCTTGGACGTGgcat < 2:52339/149‑3 (MQ=255) gtttGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACGTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAAGCGGGAGCTCACCGGCTACCTGCAGCTGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAAc < 2:71579/146‑1 (MQ=255) gtATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTcc > 6:106270/1‑125 (MQ=255) gtATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTcc < 5:106270/125‑1 (MQ=255) aTGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACg > 3:234129/1‑148 (MQ=255) tGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACg > 1:207732/1‑147 (MQ=255) tGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGGCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTa < 6:78292/149‑1 (MQ=255) ggAAAACGTCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGAt > 2:95038/1‑112 (MQ=255) ggAAAACGTCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGAt > 2:90058/1‑112 (MQ=255) ggAAAACGTCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGAt < 1:95038/112‑1 (MQ=255) ggAAAACGTCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGAt < 1:90058/112‑1 (MQ=255) gAAAACATGCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGgcgc < 2:44443/137‑1 (MQ=255) gAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTag < 1:54315/148‑1 (MQ=255) gAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTa > 3:343325/1‑147 (MQ=255) gAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTa > 3:337707/1‑147 (MQ=255) gAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGAATCGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATTCCACGACCAAGCCTGGTGGTGgcgc > 1:44443/1‑137 (MQ=255) aaaCATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAAc > 4:337016/1‑142 (MQ=255) aaaCATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAAc < 3:337016/142‑1 (MQ=255) aaCATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGcc < 6:270074/96‑1 (MQ=255) aaCATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGcc > 5:270074/1‑96 (MQ=255) aCATCCCGCGAGAGGGTACCTGCCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCGGCGCACAACCGGGACCTCCCCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCCAGCCTGGTGGCGGCGCCATGAACGTAGAggcc < 4:206198/149‑3 (MQ=255) cATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTAGAGGTcc < 5:127708/149‑1 (MQ=255) | GCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGCAGCGGGCCAACAGCGTTGATGCCACGTCCAAGCCTGGTGGTGGCGCCATGAACGTAGAGGTCC > NC_002947/1767948‑1768239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |