Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,921,550 | T→A | 11.4% | intergenic (+25/+36) | PP_1720 → / ← PP_1721 | alcohol dehydrogenase/phosphoserine phosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,921,550 | 0 | T | A | 11.4% | 163.9 / 6.5 | 68 | intergenic (+25/+36) | PP_1720/PP_1721 | alcohol dehydrogenase/phosphoserine phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/28); new base A (3/5); total (35/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCAACAACAACGGCAA > NC_002947/1921405‑1921690 | gTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTAcc > 3:212686/1‑149 (MQ=255) gccgcAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGaa < 1:363204/149‑1 (MQ=255) gccgcAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCcgcg > 3:20175/1‑147 (MQ=255) gccgcAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGaa < 4:20175/149‑1 (MQ=255) gcAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAggg > 2:281575/1‑149 (MQ=255) gcAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGAAggg < 3:263103/149‑1 (MQ=255) tGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑gg < 7:192540/149‑1 (MQ=255) aTCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCCAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATa > 8:127409/1‑148 (MQ=255) cGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATaaaaa < 5:144449/149‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAgg < 5:212165/127‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAgg > 6:212165/1‑127 (MQ=255) gTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTAGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCCCAGCCCATAAAAAcc > 1:182577/1‑149 (MQ=255) ggAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCtt < 4:210441/149‑1 (MQ=255) gtttttGCCCTGGGGGGGTATGCCGAGGTGGATACCAACCTGGTGTGGGGAAAGTTGGTGATGGTTATCTACCTTAGCCTGGTTTATGGGGGGCTGGCCCTTTCGCGGTTTTACCCGCTAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTc < 6:7992/146‑1 (MQ=255) gAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTTATGGACCCTCGCCTGGTGTACGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCTAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTc < 4:100548/149‑1 (MQ=255) gcggcgTATGCCGAGCTGGAGACCAACGAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCa < 4:71330/149‑1 (MQ=255) gcggcgTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCa < 3:248257/149‑1 (MQ=255) gcggcgTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCa < 5:339246/149‑1 (MQ=255) tGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCgg < 1:43925/148‑1 (MQ=255) gagaCAAACCTGGTGGCGGGCAAGCTGGTTATGGTGATCGCCCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCAtt < 8:154093/147‑1 (MQ=255) caaccaGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTcagctccagc < 5:331756/123‑1 (MQ=255) caaccaGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTcagctccagc > 6:331756/1‑123 (MQ=255) caaccaGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATATCg > 3:38927/1‑149 (MQ=255) aaccaGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCgg > 1:208876/1‑149 (MQ=255) aGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCAATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATg > 2:64105/1‑149 (MQ=255) gtCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTcg > 6:182706/1‑149 (MQ=255) cGGGCAAGGGGGGGATGGGGAGCGCCCCTCGCCGGGTGTACGCGGGGCGGCCCCCTTCGCGGGTTACCCCGCTAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTcgcg < 2:210808/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCgcgc > 3:293484/1‑148 (MQ=255) gCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCaa < 7:96529/149‑1 (MQ=255) aaGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑CGCACAGCCCATAAAAACCTTCACCACCACCTCAGAGTGGGCCCCCCAATTAAATCGGCATTCTCCCGCAaca > 2:198645/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTg > 1:50559/1‑149 (MQ=255) tggtgatggtgaTCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGc > 5:115594/1‑149 (MQ=255) tggtgatggtgaTCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCAATTCTCGGGTTTACAAGCGAATGGGCC‑GGCACAGACCATAAAAACCTTCAGCTCCAGGTCAGAGTCGGCCCACCATTTATCTAGGCATTCTCGCACAACACTGc > 5:349666/1‑149 (MQ=255) gtgatggtgatCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTACAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGt > 4:271966/1‑149 (MQ=255) tggtgatCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCgg < 5:182706/149‑1 (MQ=255) ggtgatCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCggg > 7:354568/1‑149 (MQ=255) gtgatCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTAGCGGGTTTAACCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAAACTTAAGCAACAGCTCAGAGTAGGCCACCCATTTATATCGGCAAGCTCGCGCAACACATCGTCCCGGt > 4:366241/1‑149 (MQ=255) cGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTcac > 1:109697/1‑148 (MQ=255) gACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAACAACCTTCAGCTCCCGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATCCTCGCCCCACACTGCGTCCGGGTTcacca > 8:96609/1‑149 (MQ=255) aCCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTcacca > 7:5209/1‑148 (MQ=255) ccTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCCTTGATCTCGGCATTCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACAt > 7:89656/1‑149 (MQ=255) ccTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACAt < 1:281575/149‑1 (MQ=255) ccTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTAAGCTCCAGCTCAGCGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCACCCCTGCGTCCGGGTTCACCCCAt > 4:73961/1‑149 (MQ=255) cTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATg < 6:115594/149‑1 (MQ=255) cTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATg > 6:280864/1‑149 (MQ=255) tAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGc > 6:1487/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTGAACGCGGGGGGGCCCCCTTCGCGGGTTTCCCCGCTACGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGc < 2:182577/147‑1 (MQ=255) ccTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTca > 1:256307/1‑138 (MQ=255) ccTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTca < 2:256307/138‑1 (MQ=255) ccTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCggg < 4:293484/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCggg < 2:208876/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCggg < 2:109697/149‑1 (MQ=255) gtgtAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGa < 5:1487/148‑1 (MQ=255) aaGCGGGGCTGCCCCCTTCGCGGGTTAACCCGCGATGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCa < 7:127409/148‑1 (MQ=255) aGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCAct < 1:1419/149‑1 (MQ=255) aGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCAct > 2:1419/1‑149 (MQ=255) aGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCAc > 1:267489/1‑148 (MQ=255) aGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCAc < 2:267489/148‑1 (MQ=255) gCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCActc < 5:280864/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCAATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTcaa < 1:64105/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTcaacaa > 1:233776/1‑148 (MQ=255) gCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGtt > 1:358376/1‑117 (MQ=255) cccTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCaacaacaac < 1:49255/149‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGTAAACCCGCGAAGGGGCCGGGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCaacaacaac > 1:27977/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCAACAACAACgg > 2:7602/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTAAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACAACATGCGGGTGCTCCACTCTCACCAACAACgg > 2:150975/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCAACAACAACgg > 6:244833/1‑148 (MQ=255) gcgGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCAACAACAACGGCaa < 8:5209/148‑1 (MQ=255) | GTTGTCGCCGCAGCTGGTCGACACCTATCCGGTGGAGTTTGCCCAGGCGGCGTATGCCGAGCTGGAGACCAACCAGGTGTCGGGCAAGCTGGTGATGGTGATCGACCCTAGCCTGGTGTAAGCGGGGCTGGCCCCTTCGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCC‑GGCACAGCCCATAAAAACCTTCAGCTCCAGCTCAGAGTCGGCCACCCATTGATCTCGGCATGCTCGCGCAACACTGCGTCCGGGTTCACCACATGCGGGTGATCCACTCTCAACAACAACGGCAA > NC_002947/1921405‑1921690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |