| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,144,372 | C→A | 6.0% | L241M (CTG→ATG) | lpxK → | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,144,372 | 0 | C | A | 6.0% | 262.2 / 5.3 | 83 | L241M (CTG→ATG) | lpxK | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/41); new base A (3/2); total (40/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 | |||||||||||
GCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGT > NC_002947/2144226‑2144517 | gCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTg > 5:87952/1‑149 (MQ=255) cTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGc < 4:82221/149‑1 (MQ=255) ttGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATg > 7:97426/1‑147 (MQ=255) gTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCg > 4:69113/1‑149 (MQ=255) aGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCTGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTg > 5:231516/1‑149 (MQ=255) gCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGc < 8:97426/149‑1 (MQ=255) cTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCTGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGcc < 6:231516/149‑1 (MQ=255) aCGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCg < 4:173778/147‑1 (MQ=255) aCGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCCACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCgg > 5:324382/1‑148 (MQ=255) cgcgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCggcg < 2:262294/149‑3 (MQ=255) cgcgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTa < 4:220769/149‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCACCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCggcgg < 2:76514/149‑4 (MQ=255) cgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATc < 6:87406/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCg > 4:275628/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCg < 4:112207/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCTCCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGGGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCgg < 4:103492/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCgg > 4:317346/1‑148 (MQ=255) gCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGc > 5:148167/1‑148 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAccc < 6:87952/149‑1 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAccc < 3:69113/149‑1 (MQ=255) ttCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCAGCAGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAccc > 8:356255/1‑149 (MQ=255) cAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCg > 6:221557/1‑148 (MQ=255) aaCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTTGCCGATACCGGCCAccgcat < 7:299828/149‑5 (MQ=255) aaCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGc > 1:211582/1‑148 (MQ=255) aCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCaa < 5:221557/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCaa > 2:46344/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTGCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCaa < 8:149662/149‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttc < 7:156483/149‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttc < 2:211582/149‑1 (MQ=255) cAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttct < 7:172095/149‑1 (MQ=255) cgCGAAGACCGCACGGATGGTGTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttctt < 8:308911/148‑1 (MQ=255) aGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttctt < 3:317346/149‑1 (MQ=255) aGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttct > 4:84533/1‑148 (MQ=255) cGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCa < 7:259676/149‑1 (MQ=255) ccGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCctgc > 5:240371/1‑147 (MQ=255) ccGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCctgc < 6:240371/147‑1 (MQ=255) cGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTgg > 3:350722/1‑149 (MQ=255) gtttcggtgtcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCt < 7:256714/148‑1 (MQ=255) tttcggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTa > 3:143326/1‑148 (MQ=255) tttcggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTa > 2:177968/1‑148 (MQ=255) tttcggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTa > 6:193662/1‑148 (MQ=255) ttcggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTaaa > 8:314532/1‑149 (MQ=255) tcggtttcTGCGTTCAGCCGTCGGCCCTGGTCATCGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCGGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCATCGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAAc < 5:205062/149‑1 (MQ=255) tttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGt < 6:170355/93‑1 (MQ=255) tttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGt > 5:170355/1‑93 (MQ=255) tcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCa < 3:84533/148‑1 (MQ=255) cctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGc < 1:91941/146‑1 (MQ=255) cctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCgg > 5:345387/1‑149 (MQ=255) cctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCg < 4:62676/148‑1 (MQ=255) ctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCgg > 1:91584/1‑149 (MQ=255) caaGCGGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGc < 1:65576/147‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGc < 4:350722/148‑1 (MQ=255) aGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCg > 5:40813/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCAt < 3:275628/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTc < 6:324382/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCg > 1:27358/1‑149 (MQ=255) gTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATgc > 4:324323/1‑149 (MQ=255) tGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATgcg < 6:40813/149‑1 (MQ=255) cgcACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCg > 3:356271/1‑126 (MQ=255) cgcACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCg < 4:356271/126‑1 (MQ=255) gCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCa < 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cgc‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTg > 8:303045/1‑149 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGcc > 6:97293/1‑149 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGcc > 1:366584/1‑149 (MQ=255) aTTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGc > 3:32772/1‑149 (MQ=255) tttCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGcc > 4:339902/1‑149 (MQ=255) 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ccgccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCa < 5:57596/149‑1 (MQ=255) ccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTg < 2:366584/149‑1 (MQ=255) ggCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGcc > 1:197406/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCg > 6:358994/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCCTGCATGAGGTGGACGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGTGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCg < 7:356255/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCt < 1:46344/149‑1 (MQ=255) cgcCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACTCCCTGCTGGGGCTAATCTGGCAGGCGTGGCCGCACGCCTTCGCCGACCTTGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGt < 3:315335/149‑1 (MQ=255) | GCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGC‑TCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGT > NC_002947/2144226‑2144517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |