Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,152,779 | A→G | 5.2% | D168G (GAT→GGT) | PP_1907 → | haloacid dehalogenase‑like family hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,152,779 | 0 | A | G | 5.2% | 230.5 / 2.2 | 76 | D168G (GAT→GGT) | PP_1907 | haloacid dehalogenase‑like family hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/35); new base G (2/2); total (39/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 |
TCGGGTGCTCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAGTGGCTGGGT > NC_002947/2152633‑2152924 | tCGGGTGCTCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGAtt > 6:78312/1‑149 (MQ=255) tCGGGTGCTCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGAtt < 3:281681/149‑1 (MQ=255) gggTGCTCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTc < 5:78312/148‑1 (MQ=255) tCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTc > 3:272678/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCAACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGGTTCGGCATTc > 2:171076/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCAACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGGTTCGGCATTc > 2:165576/1‑149 (MQ=255) aGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGAc < 3:102732/149‑1 (MQ=255) ggCTAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACt < 4:156727/149‑1 (MQ=255) gCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGAt < 2:67795/148‑1 (MQ=255) cTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATgg > 1:19617/1‑149 (MQ=255) cTGGGAGAGGTTCTTCGACATCACCCCCGCCGCTGCCGAGACACGTGGCAACCAACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTGGGCATTCTACATGGAGATgg > 4:301789/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACC‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGc > 2:320443/1‑147 (MQ=255) ggAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCa < 4:272678/149‑1 (MQ=255) ggAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCAGTCGACTTGCAGATGGccc > 6:43666/1‑148 (MQ=255) gTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATg > 6:236826/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATg > 6:242254/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATg > 4:31496/1‑149 (MQ=255) ctaCATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGGTTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCgg < 1:171076/145‑1 (MQ=255) cGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGGTTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCgg < 1:165576/147‑1 (MQ=255) cGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGAtt > 8:220136/1‑113 (MQ=255) aCATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTc < 8:327142/119‑1 (MQ=255) aCATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTc > 7:327142/1‑119 (MQ=255) aTCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGgcatgca > 1:354932/1‑149 (MQ=255) cccGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGGTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTcc > 5:48564/1‑148 (MQ=255) cccGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCg > 1:147766/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTg < 2:354932/149‑1 (MQ=255) gccgcTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGc < 4:5739/149‑1 (MQ=255) gcTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGGACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGt > 3:220321/1‑149 (MQ=255) aCGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGACGAAATCCTCTGGCATTTTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGTTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTgg < 8:351784/148‑1 (MQ=255) agaCCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTAt < 5:242254/149‑1 (MQ=255) agaCCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTAt < 5:236826/149‑1 (MQ=255) gaCCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATg < 1:271929/149‑1 (MQ=255) gggtgTGGCTTGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATgg > 6:175912/5‑149 (MQ=255) cccGTGTCAATCCCCATCCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑TAGATTCGGCNTTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATg < 1:316566/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTg > 5:236082/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTg > 2:253104/1‑149 (MQ=255) gTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGGACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGcc < 4:220321/149‑1 (MQ=255) gTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGc > 4:223863/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGgcat < 5:213930/119‑1 (MQ=255) ggCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGgcat > 6:213930/1‑119 (MQ=255) gCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATg > 1:159719/1‑149 (MQ=255) ccACA‑GCCGCTGATGCTTGAGGAATTCCTCGGGCATTGTGGGGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGcc < 8:142985/141‑1 (MQ=255) ccACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGcc > 7:142985/1‑141 (MQ=255) caca‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTg > 7:316965/1‑149 (MQ=255) aca‑cCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTg > 3:270679/1‑148 (MQ=255) gCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGc > 3:172679/1‑140 (MQ=255) gCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGc < 4:172679/140‑1 (MQ=255) gATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTgg > 1:342568/1‑149 (MQ=255) tGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCTAACCGGCGCGTGCGCGGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGcc < 6:48564/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTgg > 4:301635/1‑146 (MQ=255) gCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTgg < 3:301635/146‑1 (MQ=255) tGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGt > 3:128452/1‑149 (MQ=255) ggAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTg < 6:236082/149‑1 (MQ=255) ggAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTg > 4:16390/1‑149 (MQ=255) gAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCg > 4:277316/1‑57 (MQ=255) gAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCg < 3:277316/57‑1 (MQ=255) gAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGttt < 1:320443/147‑1 (MQ=255) tCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCg < 4:128452/149‑1 (MQ=255) tCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAg > 1:229450/1‑149 (MQ=255) tCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAg > 2:232062/1‑149 (MQ=255) tCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGAAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAg > 4:340932/1‑149 (MQ=255) gggCATTGTGGCGTCGAACCGGCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAg < 3:301789/147‑1 (MQ=255) ggCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCGCCCGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGt < 1:125766/149‑1 (MQ=255) gCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTAt < 4:270679/149‑1 (MQ=255) gtgGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCAt < 2:229450/148‑1 (MQ=255) gCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGAt < 3:16390/149‑1 (MQ=255) gTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCa < 1:253104/149‑1 (MQ=255) cGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCAtt > 7:271941/1‑69 (MQ=255) cGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCAtt < 8:271941/69‑1 (MQ=255) gcgTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAg < 3:223863/148‑1 (MQ=255) tGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGAGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTgc < 3:31496/149‑1 (MQ=255) gcgcTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTgcg < 8:316965/149‑1 (MQ=255) tGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGACGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAg > 2:296072/1‑149 (MQ=255) gttCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGACGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAGTGGc > 1:113954/3‑149 (MQ=255) ggTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAGTGGc > 8:145008/1‑149 (MQ=255) cG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAGTGGCTgg < 2:342568/149‑1 (MQ=255) gagaTTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAGTGGCTGggt < 2:159719/149‑1 (MQ=255) | TCGGGTGCTCAAGGCCAATGGCTGGGAGCGGTTCTTCGACATCACCCGCGCCGCTGACGAGACCCGTGGCAAGCCACA‑CCCGCTGATGCTTGAGGAAATCCTCGGGCATTGTGGCGTCGAACCGTCGCGTGCGCTGATGGTCG‑GAGATTCGGCATTCGACTTGCAGATGGCCAGCAATGCCGGCATGCATTCGGTGGCGGTTGGCTATGGTGCCATGTCGCTGCAGGCGCTGGCCGAGTTTGGCCCGCAGGTATGCATCGATCACTTTTCCCAGTTGCGCGAGTGGCTGGGT > NC_002947/2152633‑2152924 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |