Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,168,191 | G→C | 5.5% | intergenic (+91/+597) | PP_1921 → / ← PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,168,191 | 0 | G | C | 5.5% | 228.9 / 3.6 | 73 | intergenic (+91/+597) | PP_1921/PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/39); new base C (2/2); total (32/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.17e-01 |
GGATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCT > NC_002947/2168043‑2168336 | ggATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCCACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCag < 1:250327/149‑1 (MQ=255) agagGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCa < 2:98034/149‑1 (MQ=255) gtgACAAAACGACTAGCATCTATTTTTGTGTGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCTCTGCTAGCAcc < 8:157210/146‑1 (MQ=255) gggACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCg > 5:250463/1‑149 (MQ=255) aaaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCtttt < 3:152671/149‑1 (MQ=255) aaaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCtttt < 4:134157/149‑1 (MQ=255) aaaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCtttt < 5:367101/149‑1 (MQ=255) aaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTg < 3:266653/149‑1 (MQ=255) aaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTTGCACCGCTTTTg > 1:360000/1‑148 (MQ=255) cGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCa < 2:116972/149‑1 (MQ=255) tAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATtgt < 7:142840/149‑1 (MQ=255) aTCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGtct < 1:55278/149‑1 (MQ=255) tCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCTCTGCTAGCACCGcatc > 6:71327/1‑132 (MQ=255) tCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCTCTGCTAGCACCGcatc < 5:71327/135‑4 (MQ=255) tttttGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCgg < 5:76152/147‑1 (MQ=255) tttttGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCg < 8:211690/146‑1 (MQ=255) tttttGGGGGCTCTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCggg > 4:188086/1‑148 (MQ=255) tGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCggg > 4:340757/1‑144 (MQ=255) tGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCggg < 3:340757/144‑1 (MQ=255) ggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGc < 7:17500/127‑1 (MQ=255) ggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGc > 8:17500/1‑127 (MQ=255) ggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgctgct < 5:96277/149‑1 (MQ=255) tttATGCTGCGTGACTACGCGGGATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATGTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCCCCGCTTTTGGAATtgt > 7:236033/1‑129 (MQ=255) tttATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGt > 4:38059/1‑149 (MQ=255) tATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgct < 7:238471/141‑1 (MQ=255) tATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgct > 8:238471/1‑141 (MQ=255) tgctgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTg < 3:188086/146‑1 (MQ=255) gctgcGTGACTACGCGCCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGAGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGCCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCAGGAGAcc > 4:144031/1‑148 (MQ=255) cGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCtata < 7:198074/148‑1 (MQ=255) gTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAgc < 8:49291/149‑1 (MQ=255) gACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAgcgc > 2:123062/1‑149 (MQ=255) tACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGctgctg < 6:362570/132‑1 (MQ=255) tACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGctgctg > 5:362570/1‑132 (MQ=255) cgcgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaaa < 3:91047/149‑1 (MQ=255) cgcgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaa < 3:223768/148‑1 (MQ=255) cATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 6:121002/149‑1 (MQ=255) aTAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCTTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGAGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCTGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTggg < 7:322553/149‑1 (MQ=255) aTAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTggg > 1:335996/1‑149 (MQ=255) agagCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTg > 2:255436/1‑149 (MQ=255) gagCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGc > 3:7061/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGt < 7:84821/149‑1 (MQ=255) aaaaGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGTACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTc > 8:299230/1‑149 (MQ=255) aTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAAt < 3:88358/149‑1 (MQ=255) aTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAAt < 1:123062/149‑1 (MQ=255) aTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAAt < 6:250463/149‑1 (MQ=255) aTTAAGTAATATATTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAAt < 3:83105/149‑1 (MQ=255) aaGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGt > 5:46457/1‑148 (MQ=255) aaGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGt > 5:239608/1‑148 (MQ=255) aGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGt < 8:164038/100‑1 (MQ=255) aGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGt > 7:164038/1‑100 (MQ=255) atatCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTacaa > 2:279460/1‑147 (MQ=255) atCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 1:374491/124‑1 (MQ=255) atCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg > 2:374491/1‑124 (MQ=255) tCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGtt > 3:248669/1‑149 (MQ=255) tCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGt < 3:38059/148‑1 (MQ=255) cTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTg > 3:303464/1‑149 (MQ=255) tttGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGGTCTCGAATGTACACCAGTTGGCAc > 4:74697/1‑149 (MQ=255) ggggCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCg < 6:46457/148‑1 (MQ=255) gggCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTc < 2:316109/119‑1 (MQ=255) gCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCtctc < 3:330367/114‑1 (MQ=255) gCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCtctc > 4:330367/1‑114 (MQ=255) gCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGc < 6:239608/149‑1 (MQ=255) cTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCt < 5:213206/149‑1 (MQ=255) tttGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCt > 8:221419/1‑148 (MQ=255) gAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACt > 6:55785/1‑149 (MQ=255) aaaGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACtt > 4:279668/1‑149 (MQ=255) aGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCCCCGCTGCTCACAAGGCTGACtt > 7:293869/1‑147 (MQ=255) tCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGt > 4:154185/1‑149 (MQ=255) ggTGCTAGCTCTGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTcc > 7:119334/1‑149 (MQ=255) tGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGTCCTATAGCGCCGAAAGCTTGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCg < 5:211049/148‑1 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACtt < 5:103812/130‑1 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACtt > 6:103812/1‑130 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAtct < 1:255436/149‑1 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAt < 2:335996/147‑1 (MQ=255) | GGATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCT > NC_002947/2168043‑2168336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |