Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,305,212 | G→A | 11.6% | L449L (CTG→TTG) | PP_2028 ← | TPR repeat‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,305,212 | 0 | G | A | 11.6% | 184.7 / 12.6 | 70 | L449L (CTG→TTG) | PP_2028 | TPR repeat‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/28); new base A (5/3); total (39/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 |
CGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGT > NC_002947/2305065‑2305355 | cGGGGCTGGACTGTTGGTCGGCGCCGGGGGTGCCGTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTGCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGcagcag < 4:219156/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTTCCTTGGGCCGGGGTGCTGGCGGAGCTGCTGTTGGCTTCGGTTTCGCTGGCGGGGGTGTCTTGGGCTTCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgct < 5:18844/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAc > 6:145231/1‑149 (MQ=255) gCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGACTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgctgc < 3:133034/147‑1 (MQ=255) ccTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTACCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAc > 4:166958/1‑148 (MQ=255) ccTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGCGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAc > 1:208813/1‑148 (MQ=255) cTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAc > 3:25898/1‑147 (MQ=255) ggTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgctg < 5:328391/139‑1 (MQ=255) ggTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgctg > 6:328391/1‑139 (MQ=255) gtcgtcGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCt > 7:141475/1‑149 (MQ=255) cgtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAACTGCTGCAACAacgtgaag < 3:144742/149‑6 (MQ=255) cGGGGGGGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGGTGCTGGTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTcc < 1:141280/149‑1 (MQ=255) gggTGTGGCTTGGGCCGGGCTGCTGGCGGAGGTGGTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTGACGTTGTTGCTGCAGTTGCTGCACCTGCGCCTGGTTGTCCa < 5:176162/149‑1 (MQ=255) gtgCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAcc < 6:83806/129‑1 (MQ=255) gtgCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAcc > 5:83806/1‑129 (MQ=255) cTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGTGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGcc > 4:357535/1‑149 (MQ=255) ttGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCt > 7:63050/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCggg > 5:137034/1‑149 (MQ=255) tgctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGc > 5:213227/1‑149 (MQ=255) gctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCt > 8:30904/1‑149 (MQ=255) ccggCCGAGCGGCGGGTGCCGTCGGCCTCGCTGCCGGGCGTGGCTTGGGCAGCGCTGCCGGGCGGTTGTCCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTCGTTGTCCAGCCCGACCTGCAGGCCgcgc < 4:25898/145‑1 (MQ=255) tgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGa > 6:337946/1‑149 (MQ=255) ggCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGATGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGAc > 6:265211/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACg > 8:79392/1‑149 (MQ=255) gctgTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGa < 2:171618/139‑1 (MQ=255) gctgTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGa > 1:171618/1‑139 (MQ=255) ctgTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGc < 7:154232/149‑1 (MQ=255) ttGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCtt < 2:6097/148‑1 (MQ=255) gCCTTCGTTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGGGGTTGTTCCTCGGCCGTGGCTTCTCGTTGTTGGAGCTGTTGCTGGACGAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGc < 7:120117/148‑1 (MQ=255) ccTTCGGTTTCGCTGCCGGGGGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTc < 8:141475/149‑1 (MQ=255) ccTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCGGACGCTCCAGGGCTTGATc > 6:191235/1‑149 (MQ=255) cTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCg > 3:14567/1‑149 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCg > 3:221418/1‑148 (MQ=255) cGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGt < 5:337946/147‑1 (MQ=255) cGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa < 7:303627/148‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTGCCTGGCGGGGCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTGCCTCGGCCTTGGCTTCAGGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAGCAGCGCCGGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAg < 6:243110/148‑1 (MQ=255) ggTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAgg > 4:211199/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAgg > 6:101768/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAg < 4:221418/148‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATc > 4:152719/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGATCCTCGGCCTTGTCTTCACGTTGTTGCAGCACTTGATGCACCAGCGCCTGGATGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATc > 7:250906/1‑148 (MQ=255) ggCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGggcggc < 6:213227/149‑1 (MQ=255) gtgtCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTc > 3:266636/1‑149 (MQ=255) gggCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGCTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCt < 5:265211/147‑1 (MQ=255) tGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCgg < 4:14567/149‑1 (MQ=255) gCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAgg < 6:137034/149‑1 (MQ=255) cGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAggg > 3:23405/1‑149 (MQ=255) gttgttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCa > 8:98347/1‑149 (MQ=255) gttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTg > 3:76359/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAg < 3:40549/123‑1 (MQ=255) ttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAg > 4:40549/1‑123 (MQ=255) ggCTTCACGTTGTGGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTa < 5:145231/147‑1 (MQ=255) gCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGt < 7:30904/148‑1 (MQ=255) gCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTg < 2:208813/149‑1 (MQ=255) gCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTg < 3:357535/149‑1 (MQ=255) gCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTg < 3:166958/149‑1 (MQ=255) cTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTgg > 4:191271/1‑149 (MQ=255) ttCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTggg > 2:89955/1‑149 (MQ=255) cACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgc < 4:76359/148‑1 (MQ=255) aCGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgctg > 3:127082/1‑149 (MQ=255) gttgttGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgctgct > 6:23385/1‑149 (MQ=255) gctggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGt > 8:114965/6‑141 (MQ=255) gctggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGt < 7:114965/136‑1 (MQ=255) gctggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgctgct > 2:273282/6‑149 (MQ=255) tggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg > 6:183956/4‑148 (MQ=255) tggtgCAGCAACTGCTGCAACAACGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg > 6:65599/4‑148 (MQ=255) gttgCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCGTCGATTGTAGTGGGctgctg > 2:90615/1‑147 (MQ=255) gtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAg > 6:135171/2‑149 (MQ=255) tgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGGTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgt < 5:135171/149‑1 (MQ=255) gcagcaGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTcc < 7:92089/62‑1 (MQ=255) gcagcaGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTcc > 8:92089/1‑62 (MQ=255) cagcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgtgt > 3:366523/1‑149 (MQ=255) cagcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgtgt > 1:340663/1‑149 (MQ=255) cagcagTTGCTGCACAAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgtgt > 1:335997/1‑149 (MQ=255) | CGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGT > NC_002947/2305065‑2305355 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |