Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,686,628 | C→T | 5.5% | G365D (GGC→GAC) | PP_2354 ← | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,686,628 | 0 | C | T | 5.5% | 221.2 / 2.4 | 73 | G365D (GGC→GAC) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base T (2/2); total (37/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
CGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGTGAGAAGCCCAG > NC_002947/2686481‑2686776 | cgctcgcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGgc < 5:24259/148‑1 (MQ=255) tcgcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGgccgcc > 3:169245/1‑149 (MQ=255) gcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑gg < 4:272251/149‑1 (MQ=255) gcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑gg > 8:31987/1‑149 (MQ=255) gcgctcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑gg > 4:47449/1‑149 (MQ=255) tcgTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATg > 7:129432/1‑149 (MQ=255) gTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATg > 2:353376/1‑147 (MQ=255) gTTGATCTGTTCGCGCAGCAGCGCGTTGGCGTCTGACAGGCTCAGGGCGGATTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGACACCACGTAAAGAAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCGGTTGTACGCC‑GGCATg > 2:358963/1‑147 (MQ=255) cTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGTCGCC‑GGCATGCAGGATGc > 3:234440/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGTCGCC‑GGCATGCAGGATGc > 3:239149/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCg > 7:25948/1‑149 (MQ=255) gTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGGCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCgg < 8:330976/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCg < 7:31987/147‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGGGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCgg < 2:325668/148‑1 (MQ=255) agcgcAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGcc < 6:315301/147‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGACGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACaaa < 2:98013/149‑1 (MQ=255) gcgcgTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGGGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAgcgc < 6:5190/149‑1 (MQ=255) gCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGGGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGt < 4:254466/149‑1 (MQ=255) gTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGACCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGGC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGc < 2:216448/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCgg < 1:314517/146‑1 (MQ=255) aGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATg > 2:242484/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGc > 4:205243/1‑148 (MQ=255) gggCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAgg < 3:170432/149‑1 (MQ=255) ggcTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGggcgg < 3:205243/149‑1 (MQ=255) gcTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGggcggc > 4:273121/1‑149 (MQ=255) cgcgCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAg < 3:47449/148‑1 (MQ=255) ctcgctGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCCCCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGGGGCCAGTTCgg > 6:313535/1‑149 (MQ=255) tcgctGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGt < 8:129432/149‑1 (MQ=255) tcgctGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGt < 4:202544/149‑1 (MQ=255) gctGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGt < 5:173210/147‑1 (MQ=255) gctGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGt < 3:273121/147‑1 (MQ=255) gctGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTg < 3:14592/148‑1 (MQ=255) gTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGt < 8:197306/147‑1 (MQ=255) gTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTaa > 2:372447/1‑149 (MQ=255) gTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTaa > 6:160658/1‑149 (MQ=255) cgTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGTCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTg < 4:239149/149‑1 (MQ=255) cgTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGTCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTg < 4:234440/149‑1 (MQ=255) gCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCACGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTc < 1:289955/149‑1 (MQ=255) ccacGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAACGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGc > 2:346294/1‑149 (MQ=255) gTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAg < 1:372447/149‑1 (MQ=255) gTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAg > 1:254228/1‑149 (MQ=255) gTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATACGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGGGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTCACTGTTCCTGGTCGTGCTGAg > 8:263287/1‑149 (MQ=255) tACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAgg > 1:215292/1‑149 (MQ=255) tACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGCTCCTGGTCGTGCTCAgg < 4:46770/149‑1 (MQ=255) aGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCAGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGGTCGGTGAGTAACTGATCCAGGTCGTGCTCAGgcag > 4:364885/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGgcag > 2:309216/1‑148 (MQ=255) cAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGgcag > 1:36193/1‑147 (MQ=255) cAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGgcag < 2:36193/147‑1 (MQ=255) gtgtCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCCGGGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGt > 1:275485/1‑149 (MQ=255) gtCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTg > 6:287491/1‑147 (MQ=255) ctccGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTgcagc > 6:172302/1‑148 (MQ=255) ccGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAag > 8:306237/1‑149 (MQ=255) cGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAag > 5:14858/1‑148 (MQ=255) ggCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAagga < 4:169245/149‑1 (MQ=255) ggCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAagga < 6:218104/149‑1 (MQ=255) ggCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAag > 8:190427/1‑147 (MQ=255) gCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAaggag < 2:254228/149‑1 (MQ=255) gCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAaggag < 1:353376/149‑1 (MQ=255) gCACCACCAACCACGACAGACAGCGCTGTTGGCCGCC‑TGCATGCAGTATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAaggag < 1:358963/149‑1 (MQ=255) ccaccaccCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGAc > 1:191485/1‑149 (MQ=255) accaccCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGTATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTg < 1:309216/149‑1 (MQ=255) cacccacGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGc > 4:205162/1‑149 (MQ=255) ccacGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCt > 2:154232/1‑147 (MQ=255) ccacGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCt > 6:83808/1‑147 (MQ=255) cacGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAg < 5:160658/149‑1 (MQ=255) cGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGc < 6:176609/149‑1 (MQ=255) aCAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGt > 8:314716/1‑149 (MQ=255) gccagcGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGttag > 4:59768/1‑147 (MQ=255) ccagcGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTaa > 6:96966/1‑90 (MQ=255) ccagcGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTaa < 5:96966/90‑1 (MQ=255) ccagcGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTcgc < 7:348031/149‑1 (MQ=255) ccagcGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTcgc > 5:171850/1‑149 (MQ=255) agcGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGt > 2:24246/1‑149 (MQ=255) cgcTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGTga < 5:83808/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGTGAGAAGc > 2:277679/1‑149 (MQ=255) gccgcc‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGTGAGAAGccc < 1:277679/148‑1 (MQ=255) ccgcc‑gGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGTGAGAAGCCCAg < 6:14858/149‑1 (MQ=255) | CGCTCGCGCTCGTTGATCTGTTCGCGCAGCCGCGCGTTGGCGTCTGCCAGGCTCAGGGCGGCTTCGCGCTCGCTGGTGATGTCGCGTGCCACCACGTACAGCAAGGTGTCCTCCGGCACCACCACCCACGACAGCCAGCGCTGTTGGCCGCC‑GGCATGCAGGATGCGGCCGACAAAGCGCGCGCTGGTGCGGCCATGGGCGAGGGCGGCCAGTTCGGTGAGTAACTGTTCCTGGTCGTGCTCAGGCAGCAGGTGCAGCAAGGAGGACTGGCTCAGGCGTTCGCGTGAGAAGCCCAG > NC_002947/2686481‑2686776 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |