Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,902,351 | A→G | 6.2% | Y478C (TAT→TGT) | quiC → | 3‑dehydroshikimate dehydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,902,351 | 0 | A | G | 6.2% | 191.6 / 2.6 | 64 | Y478C (TAT→TGT) | quiC | 3‑dehydroshikimate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/32); new base G (2/2); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 |
ACAACAACGCAACCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATT > NC_002947/2902204‑2902494 | acaacaACGCAACCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTAt < 3:328925/149‑1 (MQ=255) aacaacGCAACCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATgg > 2:140967/1‑149 (MQ=255) aacaacGCAACCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCAGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTACTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATgg > 5:77093/1‑149 (MQ=255) aacaacGCAACCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGACGGCCGAGTCGATGGACAGCTGGGTGCAGATCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGCGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATgg > 6:247777/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCa < 1:140967/149‑1 (MQ=255) acggCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCaa < 7:44726/146‑1 (MQ=255) cGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCaa > 7:219516/1‑147 (MQ=255) cGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAaga < 5:126986/149‑1 (MQ=255) ggcggcCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCgcgc > 5:177314/1‑149 (MQ=255) ggcggcCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCgcgc < 1:22483/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGcc < 3:249158/149‑1 (MQ=255) cggcCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCt < 7:234974/149‑1 (MQ=255) ggcCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCtt < 4:61385/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGt > 6:380033/1‑131 (MQ=255) cTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGt < 5:380033/131‑1 (MQ=255) cTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTgcg < 6:218650/149‑1 (MQ=255) ccgcATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGcc < 3:347991/149‑1 (MQ=255) aTCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCGGTTCTACAAGAGCTTGTTAGACTTAGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTg > 2:373151/1‑149 (MQ=255) tCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTg > 7:302673/1‑148 (MQ=255) tCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTg < 8:302673/148‑1 (MQ=255) acaTGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACt < 8:153021/149‑1 (MQ=255) aTGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACttt > 2:227164/1‑149 (MQ=255) ccTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGcc > 5:241867/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTg < 8:1022/147‑1 (MQ=255) ccggccgAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGa < 8:219516/148‑1 (MQ=255) gAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtctc < 6:241867/149‑1 (MQ=255) gACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAGCATCTCGGAAAACCg > 8:75175/1‑149 (MQ=255) gACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCg > 6:216432/1‑149 (MQ=255) aCAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTTCCCGACCCGTATGTCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTTCCGCTGAACATCTCGGAAAACCg > 7:343084/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCg < 6:252682/124‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCg > 5:252682/1‑124 (MQ=255) gCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTGTGGCCTGGTTAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtc < 1:102183/127‑1 (MQ=255) gCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTGTGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtc < 1:97174/127‑1 (MQ=255) gCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTGTGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtc > 2:102183/1‑127 (MQ=255) gCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTGTGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtc > 2:97174/1‑127 (MQ=255) tGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATc > 3:194538/1‑149 (MQ=255) ttCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGTCGCGGACGACGAGGTGGTGCTGCAAGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCGGCGACTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTAGGAAAACCGCAACACCGCCATCg < 8:343084/148‑1 (MQ=255) cAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATg > 3:161025/1‑149 (MQ=255) aaGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGccg > 8:264518/1‑103 (MQ=255) gagCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCGTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATgcgc < 5:247777/149‑1 (MQ=255) gagCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtc < 4:182376/115‑1 (MQ=255) gagCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtc > 3:182376/1‑115 (MQ=255) gCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGaaa > 4:112229/1‑120 (MQ=255) gCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGaaa < 3:112229/120‑1 (MQ=255) ttGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGt > 4:145420/1‑148 (MQ=255) ttCGACTTCGCCGCCTACGACGAGGTGGTGCTGCCCCACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGAGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAg > 6:379285/1‑149 (MQ=255) ttCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAg < 5:216432/149‑1 (MQ=255) aCTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTAc > 7:313025/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCCTCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCg > 8:65393/1‑149 (MQ=255) gccgccGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTgg < 4:194538/149‑1 (MQ=255) cgacgacgaGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCgg < 4:189211/149‑1 (MQ=255) acgccgaCGGGGTGCTGCCCGACCCGAATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGGCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAACCCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGc < 6:77093/149‑1 (MQ=255) gacgaGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGt < 1:373151/149‑1 (MQ=255) acgaGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTg < 6:177314/149‑1 (MQ=255) gtgCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATcaca < 1:227164/148‑1 (MQ=255) tgctgcCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTCTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATc > 5:47932/1‑149 (MQ=255) gctgcCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCg > 5:170076/1‑149 (MQ=255) gcCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGc < 5:291139/102‑1 (MQ=255) gcCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGc > 6:291139/1‑102 (MQ=255) cccGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCttt > 4:218878/1‑149 (MQ=255) gACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTCTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGa < 6:47932/149‑1 (MQ=255) aCCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGAt > 1:93780/1‑149 (MQ=255) cccGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGAtt < 8:313025/149‑1 (MQ=255) cccGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGAtt < 3:145420/149‑1 (MQ=255) | ACAACAACGCAACCGCTACCGGCGGCCTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATGCGCTGTCAAGCTACCGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATT > NC_002947/2902204‑2902494 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |