| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,299,392 | C→T | 6.2% | Q537* (CAG→TAG) | pvdQ → | acyl‑homoserine lactone acylase PvdQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,299,392 | 0 | C | T | 6.2% | 193.0 / 2.0 | 64 | Q537* (CAG→TAG) | pvdQ | acyl‑homoserine lactone acylase PvdQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/32); new base T (2/2); total (30/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACCCGGCCTGGATGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACAGTGGT > NC_002947/3299248‑3299538 | gACCCGGCCTGGATGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAgcg > 2:33163/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCCTGGATGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGAGCCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAgcg > 1:61006/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGATGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCTACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCAt < 3:33998/149‑1 (MQ=255) gCCTGGATGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGt < 3:285645/149‑1 (MQ=255) tGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGAt < 1:353074/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACTGATGAAGAGgt < 8:129874/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGgt > 1:210756/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGgt > 7:215562/1‑149 (MQ=255) gcAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTAcc > 2:102993/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTgg < 8:212578/149‑1 (MQ=255) ccGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGc > 1:94836/1‑149 (MQ=255) cGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTAc < 4:284955/136‑1 (MQ=255) cGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTAc > 3:284955/1‑136 (MQ=255) cTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGc < 1:102993/149‑1 (MQ=255) gCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGGCAGCCTGGTGTTGc > 8:303774/1‑146 (MQ=255) cTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACct < 6:206897/149‑1 (MQ=255) tGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACctg > 3:156428/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCAATGACAAACCACTGGGCATGCGAGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGCCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACctgctg > 8:290462/1‑148 (MQ=255) aGCCGCAATGACCAACCTCTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCtgctgc < 2:210852/148‑1 (MQ=255) ccGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAAt < 1:9058/149‑1 (MQ=255) cGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGgt < 6:251275/110‑1 (MQ=255) cGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGgt > 5:251275/1‑110 (MQ=255) cAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGt < 2:276226/149‑1 (MQ=255) cAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGt < 2:376140/149‑1 (MQ=255) aaccaCGGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGgc < 7:39794/149‑1 (MQ=255) accaCTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGgcg > 7:295761/1‑149 (MQ=255) caCTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGgcgc > 3:101885/1‑148 (MQ=255) tGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAgc > 4:28946/1‑149 (MQ=255) aTGCGTGGCCGCTTTGCCATGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGAATGGTCACCGATGAAGAGGTGAACCTGCCCAGCCTAGTGTTGCCAGACCTGCTCCAATGATTAAAGGGAGCCAgag > 3:300460/1‑143 (MQ=255) cGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGAtg < 2:94836/148‑1 (MQ=255) cGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGc < 5:265140/149‑1 (MQ=255) gCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGcc > 4:288283/1‑149 (MQ=255) tGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCgt < 7:303774/147‑1 (MQ=255) gCCTTGCAACGCCTGCATGGCATAGCCCGGTTATGTGTAGTTGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAATAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGGCAGACCTGGTGCAATGGTGCAAGGTCGCCAGCGCTGATGTGCAGGCCgtgt < 8:295761/148‑1 (MQ=255) gCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCgtgt < 2:61006/148‑1 (MQ=255) gCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCgtgt < 4:101885/148‑1 (MQ=255) ccTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGTAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGtgtg > 4:99571/1‑148 (MQ=255) ccTTGCAACGCATGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGTAGCGCATGGTCACAGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGATGAAATGGTGCAAGGGCTCCAGCGCATCTGTGCATGCCGtgtg > 4:99573/1‑148 (MQ=255) cTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGtgtg > 3:364696/1‑147 (MQ=255) ttGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCAAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTgcag > 7:261639/1‑149 (MQ=255) gCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTTGCCAGCCTGgt > 4:311138/1‑87 (MQ=255) gCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGgt < 3:311138/87‑1 (MQ=255) cAACGCCTGCAGGCCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTgcagca < 7:290462/148‑1 (MQ=255) gCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTg < 4:156428/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTG‑CAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGTGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGgccg > 2:242502/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGgccg > 1:267845/1‑149 (MQ=255) tggCAAAGGCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCTGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCt < 8:261639/148‑1 (MQ=255) gggCAAAGCCCTGGTAGGTGACGGTGAATTTCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCt < 8:347101/149‑1 (MQ=255) ggCATAGCGCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCTCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCGAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTTTGAATCAGGCTGGCCGACt < 4:300460/148‑1 (MQ=255) ggCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCagcagc < 8:153564/138‑1 (MQ=255) ggCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCagcagc > 7:153564/1‑138 (MQ=255) gCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTgg < 8:215562/149‑1 (MQ=255) cAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTgg > 8:251479/1‑148 (MQ=255) cccGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGc < 7:310057/149‑1 (MQ=255) gtgtAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGAc > 1:220454/1‑149 (MQ=255) gATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCATGGCCGACCTCGa > 7:191703/1‑149 (MQ=255) gATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGa > 3:285387/1‑149 (MQ=255) gATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGa > 7:149534/1‑149 (MQ=255) tGAATTGTAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCATACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTTGAACGGCAAGGCCGACCTCGACa < 3:99573/149‑1 (MQ=255) tGAATTGTAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACa < 3:99571/149‑1 (MQ=255) tGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACa < 7:251479/149‑1 (MQ=255) aTTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACAGTg < 3:288283/149‑1 (MQ=255) ttGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACAGTgg > 4:262639/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACAGTGGt < 8:337985/148‑1 (MQ=255) | GACCCGGCCTGGATGGCCAACCCGGCGCAGCCGCTGA‑CCGGCTACTCGCCACTGGTCAGCCGCAATGACCAACCACTGGGCATGCGTGGCCGCTTTGCCTTGCAACGCCTGCAGGGCAAAGCCCGGTTAGGTGTAGATGAATTGCAGCGCATGGTCACCGATGAAGAGGTGTACCTGGCCAGCCTGGTGTTGCCAGACCTGCTGCAATGGTGCAAGGGCGCCAGCGCAGATGTGCAGGCCGTGTGCAGCAGCCTGGCCGCCTGGAACGGCAAGGCCGACCTCGACAGTGGT > NC_002947/3299248‑3299538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |