| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,420,652 | A→T | 5.3% | intergenic (‑42/+67) | PP_3035 ← / ← PP_5554 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,420,652 | 0 | A | T | 5.3% | 229.6 / 2.5 | 76 | intergenic (‑42/+67) | PP_3035/PP_5554 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/35); new base T (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
AGAGACAAAGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCTTAAGTGAC > NC_002947/3420507‑3420797 | agagACAAAGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑g > 7:160046/1‑149 (MQ=255)agagACAAAGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑g > 7:27841/1‑149 (MQ=255) agaCAAAGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑Gcg > 8:323141/1‑148 (MQ=255) aaaGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACTTGT‑GCC‑Tgga < 2:222945/149‑2 (MQ=255) aaaGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑Tggg > 6:313674/1‑149 (MQ=255) aaaGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑Tggg > 2:65387/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGt < 5:287764/149‑1 (MQ=255) ggCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGCCCAGGCACTTGT‑GCC‑Tggaccc < 6:90708/149‑5 (MQ=255) cGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTgccgc < 8:311876/149‑1 (MQ=255) aTAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACAACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCtt > 7:143648/1‑148 (MQ=255) aGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTtct > 5:41397/1‑149 (MQ=255) gAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTtctc < 2:317384/149‑1 (MQ=255) ggCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACcaca < 1:65387/149‑1 (MQ=255) gCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCACGCACAAGA‑GCC‑GGGGTGCCCCCGTtatcaccca > 2:174402/1‑141 (MQ=255) cGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGa < 3:355781/149‑1 (MQ=255) gAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGggc > 8:310492/1‑149 (MQ=255) gTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGgcggcg < 6:363765/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCAGCACAGATAGGGCGGCgggg > 5:197784/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGG‑GCA‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACAACAGATAGGGCGGCgggg > 7:327092/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGt < 5:247638/149‑1 (MQ=255) cTGGATTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTg > 2:103191/1‑149 (MQ=255) tttCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAg > 5:307278/1‑149 (MQ=255) tttCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAg < 6:116031/149‑1 (MQ=255) tCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGTAGCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAg < 1:86525/148‑1 (MQ=255) cccAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGa > 6:185780/1‑147 (MQ=255) ccAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAg > 3:226771/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAg > 4:158744/1‑149 (MQ=255) tagtaCCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCgg < 8:160046/149‑1 (MQ=255) gtaCCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGc < 6:307278/149‑1 (MQ=255) gtaCCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGc < 2:67826/149‑1 (MQ=255) cacaGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCa > 2:161791/1‑149 (MQ=255) cTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTa < 1:161791/148‑1 (MQ=255) ccGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCCCCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAg > 2:2726/1‑149 (MQ=255) gCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGctct < 8:27841/149‑1 (MQ=255) ttCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGa < 1:174402/149‑1 (MQ=255) aaGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGc < 8:233647/148‑1 (MQ=255) aaGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCCGCCGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGc > 2:103794/1‑148 (MQ=255) ggATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCAt > 2:195039/1‑149 (MQ=255) tggtgCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATgcggc < 3:52099/149‑1 (MQ=255) tggtgCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATgcggc < 7:310492/149‑1 (MQ=255) ggtgCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATtcggc > 3:124976/1‑148 (MQ=255) gtgCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATgcggc > 5:283135/1‑147 (MQ=255) gtgCACACCACGAAACTACTGGCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGa < 4:226771/149‑1 (MQ=255) tgCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTACATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGa < 1:195039/149‑1 (MQ=255) acacCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAgtgt < 2:250258/149‑1 (MQ=255) accacGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTaa > 7:247491/1‑149 (MQ=255) cacGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTa‑a < 3:232476/116‑1 (MQ=255) cacGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCCGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTa‑a > 4:232476/1‑116 (MQ=255) cGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATTGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAAcacc < 1:103191/149‑1 (MQ=255) tactGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAac > 8:22707/1‑140 (MQ=255) tactGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAac < 7:22707/140‑1 (MQ=255) tactGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCt > 5:172902/1‑149 (MQ=255) tGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCtcgt > 5:39653/1‑149 (MQ=255) tGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCtcgt > 6:313451/1‑149 (MQ=255) tCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATgcggc < 1:255018/126‑1 (MQ=255) tCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATgcggc > 2:255018/1‑126 (MQ=255) cTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCCGTGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGc > 1:223331/1‑149 (MQ=255) cTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCt > 4:240924/1‑149 (MQ=255) gAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGTTGCCTTTCTCCTGCTCAGATAGGGCGGCGGTGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATATCTCTTAAGGTGCGATGCGGCGAGTGTAACACCACAGCTCGTCGCTg < 4:124976/147‑1 (MQ=255) gAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTgg < 7:223168/148‑1 (MQ=255) gAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTg < 6:172902/147‑1 (MQ=255) gAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTg < 7:205140/147‑1 (MQ=255) gAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTg < 6:41397/147‑1 (MQ=255) aCCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCAGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGa < 8:143648/148‑1 (MQ=255) ccGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTg > 1:175430/1‑149 (MQ=255) gggggTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGc < 3:158744/149‑1 (MQ=255) ggggTCCACGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCa < 4:80210/149‑1 (MQ=255) gggTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGGGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGAA‑ATAGCTCTTACCGAGCCATGAGGCGAGTGTAACACCACCCCGGGTCCCTGGGCCTGGAAg > 4:193606/1‑149 (MQ=255) gggTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAg < 6:197784/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCt > 1:15728/1‑149 (MQ=255) acccAGGCACTTGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCt > 8:56074/3‑149 (MQ=255) ccAGGCACTTGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCAACGCTCGTCGGTGGGACTGGCAGCtt > 6:378830/1‑148 (MQ=255) ccAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCtt > 2:185085/1‑148 (MQ=255) aGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCTTAAg > 4:119910/1‑149 (MQ=255) ggCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCTTAAGt < 5:313674/149‑1 (MQ=255) acaAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCTTAAGTGAc > 3:52037/1‑149 (MQ=255) | AGAGACAAAGGCCGACATAGAAAAAAGGCGACCCGAAGGTCGCCTGGTTTCCCCCAGTAGTACCACCACAGTGCTACCGGGCCGCGTTCAAGGATGTGGTGCACACCACGAAACTACTGTCCTTGAACCCGGGGGTCCAGGCACAAGT‑GCC‑TGGGTGCCGCCTTTCTCCACCACAGATAGGGCGGCGGGGTGCCAGTGATAGTCGGGCGACATCACTGGTA‑ATAGCTCTTAACGAGCCATGCGGCGAGTGTAACACCACCGCTCGTCGCTGGGACTGGCAGCTTAAGTGAC > NC_002947/3420507‑3420797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |