Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,430,159 | C→T | 7.7% | S126L (TCG→TTG) | PP_3045 → | ATP‑dependent protease ClpP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,430,159 | 0 | C | T | 7.7% | 187.4 / 4.5 | 65 | S126L (TCG→TTG) | PP_3045 | ATP‑dependent protease ClpP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/32); new base T (2/3); total (30/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.16e-01 |
ACAAACGGAGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGA > NC_002947/3430014‑3430306 | acaAACGGAGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGaa > 5:224803/1‑149 (MQ=255) aaCGGAGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGc > 8:326415/1‑149 (MQ=255) aCGGAGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGcc < 7:344324/149‑1 (MQ=255) gAGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATg < 3:187207/149‑1 (MQ=255) aGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATTCGATGCCATga < 7:337062/149‑2 (MQ=255) aGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATTCGATGCCATga < 5:181359/149‑2 (MQ=255) tGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCtga < 4:181848/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTgatgat > 2:346095/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTgatgat > 4:227254/1‑149 (MQ=255) tGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATc > 3:313582/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATc > 1:23868/1‑148 (MQ=255) ttCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATcc < 5:67044/148‑1 (MQ=255) ttCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATc < 1:346095/147‑1 (MQ=255) gAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATaa > 3:177327/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCt > 2:183042/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCtt < 4:284119/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCt > 5:363608/1‑148 (MQ=255) cATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCt > 1:305855/1‑149 (MQ=255) aTCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTg > 2:1085/1‑149 (MQ=255) aTCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCACAACCCTTACACCTg < 7:318858/149‑1 (MQ=255) tCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCTTGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTgg < 1:76169/149‑1 (MQ=255) tCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTgg < 3:300099/149‑1 (MQ=255) cacaACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTggg < 4:174072/148‑1 (MQ=255) acaACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATc < 7:143838/109‑1 (MQ=255) acaACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATc > 8:143838/1‑109 (MQ=255) acaACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCAGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGtt > 6:335297/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGAGGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGGGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGc < 3:227254/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCg < 8:133299/149‑1 (MQ=255) cgcTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGt < 8:4247/149‑1 (MQ=255) tGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATTGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGAt > 6:297829/1‑149 (MQ=255) tGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGAt > 5:99115/1‑149 (MQ=255) cGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGa < 7:326415/149‑1 (MQ=255) cGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGa < 4:313582/149‑1 (MQ=255) gCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGACATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAg > 3:134905/1‑149 (MQ=255) gggTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCTAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGAcc > 1:236533/1‑149 (MQ=255) gggTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGa < 6:99115/147‑1 (MQ=255) gCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGt < 2:305855/148‑1 (MQ=255) ctccGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGTCGGTAATGACGAGGACCTTCGTCGGGTg < 4:177327/146‑1 (MQ=255) cACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTgg > 1:23730/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGAc < 2:104049/135‑1 (MQ=255) aCCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGAc > 1:104049/1‑135 (MQ=255) gTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCt > 3:159109/1‑149 (MQ=255) gTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCt < 3:23514/149‑1 (MQ=255) aTGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGAt > 5:299647/1‑149 (MQ=255) aaGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAgg < 1:148266/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCa < 1:183042/149‑1 (MQ=255) gcagCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGa < 7:119967/91‑1 (MQ=255) gcagCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGa > 8:119967/1‑91 (MQ=255) gcagCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATc < 5:238771/149‑1 (MQ=255) gcagCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATc > 1:271991/1‑149 (MQ=255) gcagCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGAGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATc > 1:29769/1‑149 (MQ=255) gTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCTTCGGGTTGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGc < 2:23868/149‑1 (MQ=255) ggcgCTCACCGTGTGGTCATGGCATTGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCaa < 5:297829/149‑1 (MQ=255) ggcgCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGcc > 3:247160/1‑147 (MQ=255) ggcgCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCaa < 4:247160/149‑1 (MQ=255) ggcgCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCaa < 5:335297/149‑1 (MQ=255) gcTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGc < 6:363608/149‑1 (MQ=255) cTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGc < 2:28658/102‑1 (MQ=255) cTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGc > 1:28658/1‑102 (MQ=255) tCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCta > 3:286250/1‑148 (MQ=255) gTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGa > 3:301550/1‑149 (MQ=255) gTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGa > 2:243611/1‑149 (MQ=255) agcATGGCATTCGATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGa > 1:59841/3‑149 (MQ=255) cATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGAt > 7:137015/1‑148 (MQ=255) gCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGAcgc < 2:23730/149‑1 (MQ=255) cATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACTCCTGGGTTGGCGTTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCATTGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGAcgcg < 4:134905/149‑1 (MQ=255) tCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGa < 1:1085/149‑1 (MQ=255) | ACAAACGGAGGTGACCTGTTCGAGGGGCTTGCCATCCACAACGCGCTGAGCCGCTTGGGTGAACGTTGCACCGGCCGAGTCGATGCCTTGGCCGCAAGTGCAGGCAGCGTGGCAGTCTGCGGCGCTCACCGTGTGGTCATGGCATCGAATGCCATGCTGATGATCCATAACCCTTACACCTGGGTTGGCGGTGATGCCGAGGACCTTCGTCGGGTGGCGGACGTGCTTGATCAGGCCTTCGAGGCAATGATCGCAGCCTATAAGGCCAAGGCTCCGAACATCGATGACGCGGA > NC_002947/3430014‑3430306 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |