Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 287,068 | G→C | 5.6% | P19A (CCG→GCG) ‡ | tauB‑II ← | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 287,068 | 0 | G | C | 5.6% | 228.7 / 3.7 | 71 | P19A (CCG→GCG) ‡ | tauB‑II | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/32); new base C (2/2); total (37/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.85e-01 |
GCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGAA > NC_002947/286921‑287216 | gCACTCCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg < 1:108335/149‑1 (MQ=255) gCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg > 4:86670/1‑149 (MQ=255) acacCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGt > 7:276482/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTg > 8:38595/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTg > 4:95636/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTg > 7:294313/1‑149 (MQ=255) cATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGCCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTg < 5:324549/149‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGgc > 5:346262/1‑149 (MQ=255) tCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgc < 2:213356/149‑1 (MQ=255) cGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGgcg > 8:317032/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGgcgc < 6:346262/149‑1 (MQ=255) gAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgcc < 6:160958/148‑2 (MQ=255) gAGGGTGATGTGACCGCCACTGCGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGACTTGCCGCTGCCGGAACGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTCGTCCAAGGCTCAGGTTCATATCGCCCAGCACCGGGGTGCTGgcgc > 4:48447/1‑149 (MQ=255) gggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCt < 3:95636/149‑1 (MQ=255) aTGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGt > 3:287111/1‑148 (MQ=255) gACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGTCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACtgt < 1:43675/149‑1 (MQ=255) gACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACtgt > 7:57701/1‑149 (MQ=255) aCCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACtgtg > 2:124198/1‑149 (MQ=255) aCCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACtgtg > 6:208369/1‑149 (MQ=255) ccGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTgc < 3:133232/149‑1 (MQ=255) cGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGCGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTgcg < 6:208662/149‑1 (MQ=255) cGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTgcg < 6:377454/149‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGAt < 8:276482/149‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGAt < 6:14634/149‑1 (MQ=255) ggggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATgc < 2:40/148‑1 (MQ=255) ggggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATg < 1:329063/147‑1 (MQ=255) ggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCt > 1:222832/1‑149 (MQ=255) gacgaAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTc > 5:145675/1‑147 (MQ=255) gacgaAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCa < 7:317032/149‑1 (MQ=255) acgaAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAg > 4:309729/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGa < 3:301307/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGa < 2:283544/149‑1 (MQ=255) cGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAg > 2:321390/1‑149 (MQ=255) gATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCgccgcgg > 8:99512/1‑142 (MQ=255) gAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGcga > 8:257089/1‑147 (MQ=255) ggTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCAt > 4:281191/1‑148 (MQ=255) gTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGa > 4:70730/1‑149 (MQ=255) gTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTcc < 3:70730/149‑1 (MQ=255) gAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCg > 4:216413/1‑148 (MQ=255) tCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCa < 3:86670/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAg < 8:297767/126‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAg > 7:297767/1‑126 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGt > 6:209808/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGt > 3:357661/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGttt < 8:57701/148‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGttt < 1:321390/148‑1 (MQ=255) cTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa < 3:277371/149‑1 (MQ=255) cGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaaggaa < 2:222832/149‑1 (MQ=255) ccccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgcg < 1:124198/149‑1 (MQ=255) ccccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgcg > 4:149671/1‑149 (MQ=255) cccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgcgc > 6:167902/1‑149 (MQ=255) cccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgcgc > 1:310966/1‑149 (MQ=255) caccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTAc < 5:60824/149‑1 (MQ=255) cagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGag < 6:145675/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGagta < 4:357661/149‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGagtag > 7:43761/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCAc > 5:144688/1‑149 (MQ=255) ggCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGc < 3:309729/149‑1 (MQ=255) aGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGa > 4:222826/1‑116 (MQ=255) aGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGa > 7:58372/1‑149 (MQ=255) gATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACttt < 7:128193/148‑1 (MQ=255) ccaggcgCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGc > 4:67374/7‑149 (MQ=255) atatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTg < 5:208369/148‑1 (MQ=255) atatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGc < 8:294313/149‑1 (MQ=255) atCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACttt > 1:85950/1‑145 (MQ=255) atCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACttt < 2:85950/145‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGAGTTTGCCtt > 2:188737/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctg > 2:335590/1‑149 (MQ=255) cAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctgc > 1:154564/1‑149 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGGTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCtt > 1:262727/1‑148 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCtt > 8:256077/1‑148 (MQ=255) ccGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAg < 2:310966/149‑1 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAgg < 3:281191/149‑1 (MQ=255) gggTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGaa < 4:287111/149‑1 (MQ=255) gggTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCAGGATAAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAgg > 8:14632/1‑147 (MQ=255) | GCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGAGGAA > NC_002947/286921‑287216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |