Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,625,537 | T→A | 6.3% | intergenic (‑50/+27) | PP_3195 ← / ← PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,625,537 | 0 | T | A | 6.3% | 177.0 / 3.1 | 64 | intergenic (‑50/+27) | PP_3195/PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/29); new base A (2/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.95e-01 |
TCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATG > NC_002947/3625391‑3625681 | tCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTg < 4:30249/148‑1 (MQ=255) tCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTg < 7:98997/148‑1 (MQ=255) tCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTg < 7:66824/148‑1 (MQ=255) tCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGc < 3:86140/149‑1 (MQ=255) tCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGc > 5:171253/1‑149 (MQ=255) ttCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGgt > 6:175014/1‑149 (MQ=255) ggTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CGCCAGACACCGCAGCGgtgctgg < 4:310353/149‑5 (MQ=255) ggTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgg < 6:96286/149‑1 (MQ=255) ggTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgg > 7:345963/1‑149 (MQ=255) gTCGTGTAGTCCGGCGGCCACTTGAGAGACAGGCTGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGTGTGTTTCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATAGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgtg < 8:302206/149‑3 (MQ=255) gTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCTGGGAGGGCAGGGTGTGGCCAATCGTGTTCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑GACCGCTGCGGTGTCTggg < 5:245914/149‑1 (MQ=255) gTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCgg < 1:341187/138‑1 (MQ=255) gTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCgg > 2:341187/1‑138 (MQ=255) tGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGa < 2:194009/149‑1 (MQ=255) gTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgc > 5:89647/1‑149 (MQ=255) cgccGGCGCCCACCTGATCGCAATGCACGCAGGGCGCGGTTTGCATGCAATGGACCCATGGATGGCAGGGGTGGGCCAATCGTGCTCACCTGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATg < 1:294317/147‑1 (MQ=255) cGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgc > 1:104152/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgc > 5:177543/1‑149 (MQ=255) ggCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgcc > 4:186308/1‑149 (MQ=255) cccACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTc < 6:177543/149‑1 (MQ=255) ccACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCt > 2:166157/1‑147 (MQ=255) cTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGc > 6:271232/1‑149 (MQ=255) gAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCgg < 5:285938/148‑1 (MQ=255) cGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATCGGGTTAGCAC‑CACCGCGGCGGTGTGTGGGGCGATGGCCCCCCCTCACGCgg > 1:125605/1‑149 (MQ=255) caggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgcgcg > 6:372866/1‑149 (MQ=255) caggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgcgcg > 2:190658/1‑149 (MQ=255) caggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCAt < 1:166157/149‑1 (MQ=255) gcgGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCt < 2:104152/149‑1 (MQ=255) ggTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGc > 6:320167/1‑149 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCt < 2:24977/146‑1 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCt > 1:24977/1‑146 (MQ=255) cgtaggcaggGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGaa < 6:89647/145‑1 (MQ=255) cGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAAt < 5:271232/149‑1 (MQ=255) gcagggcaggGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAt > 3:271377/1‑149 (MQ=255) gcagggcaggGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAt > 4:197499/1‑149 (MQ=255) cagggcagggTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATc < 5:320167/149‑1 (MQ=255) agggcagggTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCg < 5:372866/149‑1 (MQ=255) agggTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGAt < 1:326600/149‑1 (MQ=255) gCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgc > 4:67392/1‑149 (MQ=255) gCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgc > 1:179379/1‑149 (MQ=255) aaTCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGaa < 2:125605/149‑1 (MQ=255) a‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCtgtg > 2:23613/1‑149 (MQ=255) tGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATgg < 5:175014/149‑1 (MQ=255) cGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATgggg > 8:330090/1‑149 (MQ=255) gAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGt > 4:296758/1‑149 (MQ=255) gAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGt > 1:171212/1‑149 (MQ=255) ggTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCg < 8:345963/149‑1 (MQ=255) gTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGc > 6:50798/1‑149 (MQ=255) tATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGcc < 6:171253/149‑1 (MQ=255) cgcgAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATTGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTc > 1:280660/1‑149 (MQ=255) gcgAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTc > 8:282295/1‑148 (MQ=255) aaaCGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtg > 8:103895/1‑149 (MQ=255) aaCGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtgc > 2:62282/1‑149 (MQ=255) cgAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCg < 4:271377/149‑1 (MQ=255) gAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCgg > 3:187940/1‑149 (MQ=255) gAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCgg > 7:264476/1‑149 (MQ=255) aT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGGCGCCGTCCATGCTGCGGt < 5:78934/149‑1 (MQ=255) cccagacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCTGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCACTCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGcc > 6:216918/7‑148 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGaa < 6:155124/85‑1 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGaa > 5:155124/1‑85 (MQ=255) ccagacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGt < 3:2228/139‑1 (MQ=255) ccagacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGt > 4:2228/6‑144 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGGCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt < 1:23613/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATg < 3:197499/149‑1 (MQ=255) | TCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCA‑‑GGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGAT‑‑‑G‑CCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATG > NC_002947/3625391‑3625681 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |