Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 288,016 | T→C | 5.1% | Y31C (TAC→TGC) ‡ | tauA ← | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 288,016 | 0 | T | C | 5.1% | 296.9 / 4.0 | 98 | Y31C (TAC→TGC) ‡ | tauA | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/41); new base C (2/3); total (53/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 |
CAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCT > NC_002947/287868‑288162 | cAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGt < 4:348840/149‑1 (MQ=255) tAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAACTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGc < 2:107345/149‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCa > 2:31804/1‑149 (MQ=255) gCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCa > 3:211051/1‑149 (MQ=255) aTCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGTGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGt > 2:343710/1‑149 (MQ=255) aTCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGt > 6:346375/1‑149 (MQ=255) cTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGAACACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGCCTACCAGACCACTGTcg < 6:196459/149‑2 (MQ=255) gCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGCCCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg > 8:30296/1‑149 (MQ=255) gCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg > 5:187135/1‑149 (MQ=255) gCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg > 8:217233/1‑149 (MQ=255) cACGTCTCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGCCTACCAGACCACTGTc < 3:354810/145‑1 (MQ=255) cACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACt < 4:174540/142‑1 (MQ=255) cgcTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGACGGCTTcc > 6:261844/1‑149 (MQ=255) gCCACGTCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGc > 6:128052/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGc > 5:169925/1‑149 (MQ=255) ccACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGc > 6:33747/1‑148 (MQ=255) cACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGcc > 4:338025/1‑148 (MQ=255) tGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTg < 1:154424/149‑1 (MQ=255) aTCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt > 4:206559/1‑149 (MQ=255) gTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTgg > 6:41367/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGc > 8:118698/1‑147 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCCCTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAgg > 8:192611/1‑149 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGa < 5:139/147‑1 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAgg < 4:273719/149‑1 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAgg > 4:27168/1‑149 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAg < 3:338025/148‑1 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGCCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGa < 1:31804/147‑1 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCAACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGa < 2:247961/147‑1 (MQ=255) ccGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGt > 4:141147/1‑149 (MQ=255) gTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGt > 1:214810/1‑147 (MQ=255) gTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGACTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGt > 5:64824/1‑147 (MQ=255) ttATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAg > 3:242204/1‑149 (MQ=255) ttATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAg < 3:141147/149‑1 (MQ=255) aTCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAgg < 5:128052/148‑1 (MQ=255) tCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggc > 4:37833/1‑149 (MQ=255) tCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggc > 4:243396/1‑149 (MQ=255) aaaTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCCCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcgg > 6:308574/1‑149 (MQ=255) aaaTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCTGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGACACTGTCAGGTCGTCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcgg < 5:261844/149‑1 (MQ=255) aaaTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcgg > 2:152400/1‑149 (MQ=255) tttGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGgcggcg > 7:226410/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAAc < 5:286954/148‑1 (MQ=255) gcCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGTTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAgg > 3:27721/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGc > 5:48639/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCg < 5:41367/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCGACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTg > 1:371757/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCgg > 8:179111/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCggg > 4:71645/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGAt > 6:235621/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGACGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCAt < 4:233979/149‑1 (MQ=255) cTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATg < 1:343710/149‑1 (MQ=255) tttttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg > 2:273056/1‑149 (MQ=255) tttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg < 7:30296/147‑1 (MQ=255) tttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGt < 6:169925/148‑1 (MQ=255) tttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGt < 4:211051/148‑1 (MQ=255) ttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGtt < 3:37833/148‑1 (MQ=255) cGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGa < 3:27168/148‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGaa < 3:71645/148‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc < 1:99143/149‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc < 7:192611/149‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc < 7:217233/149‑1 (MQ=255) gTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACctc > 5:317140/1‑149 (MQ=255) gTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACctc < 7:118698/149‑1 (MQ=255) tCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGACCctct > 3:83545/1‑149 (MQ=255) tCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGCCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACctct > 2:192145/1‑149 (MQ=255) aTCGACCAGCGCCACTGTGGCCGGGTCGACAGGGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGGCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCa < 6:260158/149‑1 (MQ=255) tCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACATTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAg > 1:34337/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCa < 5:33747/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCa < 6:317140/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAg > 6:238020/1‑149 (MQ=255) 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cACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCtctc > 5:96877/1‑133 (MQ=255) cACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCtctc < 6:96877/133‑1 (MQ=255) cACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCgtgt < 4:242204/149‑1 (MQ=255) cACTTTGGCCGGGCCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCgtgt < 1:192145/149‑1 (MQ=255) aCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg < 6:57529/121‑1 (MQ=255) aCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg > 5:57529/1‑121 (MQ=255) aCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGtt < 5:346375/149‑1 (MQ=255) tttGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTg > 7:27164/1‑148 (MQ=255) ggCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGACTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGAt < 6:64824/148‑1 (MQ=255) gCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATaa > 6:100325/1‑149 (MQ=255) cGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCGGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACg > 7:160857/1‑149 (MQ=255) ggggCGACAGTGGGCTGGGAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACga < 8:160857/149‑1 (MQ=255) gTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc < 1:229049/116‑1 (MQ=255) gTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc > 2:229049/1‑116 (MQ=255) ctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa < 4:337315/91‑1 (MQ=38) ctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa > 3:337315/3‑93 (MQ=38) ctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTGTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACgag > 3:78489/3‑147 (MQ=255) cGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAg < 3:206559/149‑1 (MQ=255) aCAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCa > 2:40661/1‑67 (MQ=255) gTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTaa < 5:100325/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAAt > 1:119244/1‑149 (MQ=255) gTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAAt > 3:346311/1‑148 (MQ=255) gTAGGCCACTGTCATGTCGGTTGCCTTGGCCATCCAGCTGGTGCTGTAGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCTTGGTTTAACCTCTCGTGAGGCTAGTCGTGTTGTATTACGAGATGGCTAAATGAt < 2:367343/146‑1 (MQ=255) gTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCt > 8:127889/1‑148 (MQ=255) | CAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGATCT > NC_002947/287868‑288162 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |