New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1441693 | NA (NA) | 68 (1.050) | 53/264 | 0.3 | 100% | intergenic (+37/+395) | PP_1260/ghrB | transposase/2‑ketoaldonate reductase/hydroxypyruvate/glyoxylate reductase |
? | NC_002947 | 1844449 = | 0 (0.000) | coding (345/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
CTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAgag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1441547‑1441693 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCG > NC_002947/1844449‑1844594 CTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGA < 1:317006/149‑1 CTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGA < 7:363277/149‑1 TTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAG < 3:391585/149‑1 TTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAG < 6:177363/147‑1 TTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAG > 5:177363/1‑147 ATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAACACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGA < 1:225254/147‑1 TTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGG < 5:114685/148‑1 TTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAACCCGGAAACATGGGTATCAACAGGTGGCCGCTTGAGTGCATAAAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGTTGACAGTTGGG > 6:114685/1‑149 ctAGGTCTTGCGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGCCCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑G < 3:229988/147‑1 CAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑G > 6:314154/1‑149 CAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑G > 7:302257/1‑149 CAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑G < 2:119325/149‑1 AAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTTCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATAAACTGGTGGCCGCTTGAGTGAGTTGAAA‑AAAAAGGGTTGGATTTTTTTGTTTGAGAGTTGGGTGgagg > 4:98060/1‑145 AAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTGGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GG > 1:110348/1‑149 GTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTAC < 3:201640/149‑1 TGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGGATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGGATTTTGTTTGAGGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCC > 6:373296/1‑149 CGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCG < 3:98060/148‑1 GAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGC < 5:230601/149‑1 CAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCGTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGGCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACATTGGGTTGGCTTTTGTTTGTGGAGAGTTGGGGGGC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGGAGATT > 8:260195/1‑149 CAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGATTTGCTTCGCATAGGCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATT < 8:16791/149‑1 AAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAG < 1:4312/149‑1 AAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTAGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTATAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATTAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAG > 2:252759/1‑149 GCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCA > 5:334568/1‑149 GACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTC < 6:334568/149‑1 GGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGG > 2:212363/1‑149 GGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGG < 2:280794/149‑1 GGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑G < 4:156324/103‑1 GGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑G > 3:156324/1‑103 GGGCTTTGCGAAGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGG > 4:102304/1‑149 CTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGC > 4:304424/1‑147 TGCTTCGCAATGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAG < 6:265339/147‑1 GCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGC < 5:314154/148‑1 GCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAG > 3:231700/1‑84 GCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAG < 4:231700/84‑1 CGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGC > 5:252140/1‑90 CGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGC < 6:252140/90‑1 CAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCG > 3:362798/1‑149 CGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGG < 1:343688/149‑1 CGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTACAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGG < 7:39269/149‑1 GGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCCGGGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGG < 1:88663/129‑1 GGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCACGGGCCGGCGTGGG > 2:88663/1‑128 CTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGA < 3:304424/149‑1 GGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGACA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAAC < 3:214385/149‑1 GTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTG > 8:319947/1‑129 GTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTG < 7:319947/129‑1 TATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGG > 8:40766/1‑138 TATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGG < 7:40766/138‑1 GGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCG > 8:88404/1‑149 CCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACAT < 7:88404/149‑1 CTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGG < 4:362798/149‑1 GCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGG < 6:118128/94‑1 GCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGACTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGG > 5:118128/1‑94 TAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAG > 1:285912/1‑149 TAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAG > 5:209547/1‑149 AGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCC > 8:72586/1‑140 AGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCC < 7:72586/140‑1 GAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGG < 8:302257/148‑1 GAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGG < 3:102304/148‑1 A‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGA > 4:173215/1‑112 A‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGA < 3:173215/112‑1 CAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGT > 6:35506/1‑149 CAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGT < 2:110348/149‑1 AATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTG > 4:334989/1‑149 AATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTG < 5:35506/149‑1 AATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCAGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTG > 5:66105/1‑149 ATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGC < 1:212363/149‑1 GTTGCATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGC > 8:67005/1‑148 ATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCT > 1:367881/1‑149 ATTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCT < 5:377226/149‑1 TTTTGTTTGATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTC > 8:158711/1‑149 GATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGTTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTG > 6:14840/1‑149 GATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTG > 3:337064/1‑149 GATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTG > 5:147575/1‑149 ATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTG < 3:102999/127‑1 ATGAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTG > 4:102999/1‑127 GAGAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCG < 2:367881/148‑1 CTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTTGCTTCGCAAAGCCCGGAAACTGGGGTATCAACTGGTGGCCGCTTGAGTGCTTAGAAA‑ACAATGGGTTGCATTTTGTTTGATGAgag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1441547‑1441693 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGTTGGGTGCC‑GGTACCGCCGCTGGGCGGCAGATTGAGCATGCTCGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCG > NC_002947/1844449‑1844594 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |