| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 98.4% | 198.7 / NA | 61 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (28/32); minor base A (1/0); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATC > NC_002947/6013740‑6014027 | aaTCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGc < 5:201557/148‑1 (MQ=255) ggCCCGGGTGAAGTCGCTGCAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAACCGCGACACCTGCTGCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 3:107023/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATGGAATATACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGGCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGATCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGc < 8:208929/144‑1 (MQ=38) gAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt < 3:140854/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTa > 1:67590/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GTCGCCAGcc < 1:147844/146‑1 (MQ=255) cAGCTTCATCGAATACACGCGACACCTGCTGCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGc < 4:113814/149‑1 (MQ=255) cTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACCCCCGCTCCCACAAGTGCACCACAGGTCTAGAAACCTGTGCCGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCCAATGGCCGCAACCCATTTATATTGTT‑TCCGCCACCCCCCCca‑a > 6:100723/1‑149 (MQ=255) cATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCAACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGAAAAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACAGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATATGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCca‑ac > 1:256730/1‑148 (MQ=38) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCca‑acaac > 5:333535/1‑148 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTATCGAACCCTGTGCCGTAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCATTTATCTGGTT‑TCCGCCAGCCCCCCca‑acaac > 7:195929/1‑148 (MQ=37) aaaCGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGTCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑gcc < 6:80392/124‑1 (MQ=255) aaaCGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGTCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑gcc > 5:80392/1‑124 (MQ=255) gACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTaaa < 2:67590/149‑1 (MQ=255) acCTGCTTCGCGGCC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCACCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGcc < 5:243807/122‑1 (MQ=255) 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gCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTtcttct > 7:78823/1‑137 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTtcttct < 8:78823/137‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGc > 3:37465/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCgg > 3:116367/1‑149 (MQ=255) gCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑gccgcc > 4:111680/1‑97 (MQ=255) gCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑gccgcc < 3:111680/97‑1 (MQ=255) cTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg < 5:100723/149‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc < 8:195929/149‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 7:143686/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc < 2:256730/147‑1 (MQ=255) cacaGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGCTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 7:218241/1‑148 (MQ=21) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCca‑ac > 2:208057/1‑103 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCca‑ac < 1:208057/103‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAc > 3:230970/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 6:333535/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTg > 2:368446/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTg > 5:145915/1‑149 (MQ=255) cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAt > 5:317029/1‑149 (MQ=255) cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAt > 6:343019/1‑149 (MQ=255) gcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATcc < 1:368446/149‑1 (MQ=255) gcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATcc > 4:304898/1‑149 (MQ=255) acaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGc < 5:167323/149‑1 (MQ=255) aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTAAAAGCCACCCCCCCCATCCAACAAGCGCTGGTAAATTTATTATTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAACCGc > 1:123219/1‑149 (MQ=25) gAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTgg > 7:209585/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCAGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc > 1:8498/1‑149 (MQ=255) gaccTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCt > 7:383286/4‑149 (MQ=255) aCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCt < 7:15870/149‑1 (MQ=255) ctgcaCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 8:218241/144‑1 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 5:343019/148‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAccc > 6:253158/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTcc < 3:304898/149‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGccc < 4:37465/149‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGccc < 1:5950/94‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGccc > 2:5950/1‑94 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGcccc > 5:185813/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg < 2:123219/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGt > 6:8581/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCa < 8:143686/149‑1 (MQ=255) cGTGCCCTCGAATGGCAGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCACGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCATGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCAGGTGCATc < 8:383286/149‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATc < 4:116367/149‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATc < 5:253158/149‑1 (MQ=255) | AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGC‑ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTT‑GCCGCCAGCCCCGCCA‑ACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATC > NC_002947/6013740‑6014027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |