New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5864727 | 142 (2.920) | 4 (0.090) | 4/268 | 1.5 | 2.7% | coding (1424/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
? | NC_002947 | = 5864760 | 152 (3.310) | coding (1391/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
CAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTG > NC_002947/5864615‑5864903 | cAGCGCATCGAAGTCACTGAGCTCGCTCAAGGCCAGGGCTTGCTGCTTGCCGACCTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCTCCCAGGCTGGCCGCGAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCAc > 2:41097‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCAc > 1:248823‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgcAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCAcct > 5:105442‑M2/1‑144 (MQ=255) cGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGt > 6:145371/1‑147 (MQ=255) aGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCgg < 3:215109/147‑1 (MQ=255) aGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCgg < 3:164594/147‑1 (MQ=255) cACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCt > 7:205513/1‑147 (MQ=255) cTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGc < 7:127483/147‑1 (MQ=255) ccTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCg > 3:117297/1‑147 (MQ=255) ccTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCg > 2:30336/1‑147 (MQ=255) cTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCgg > 3:204878/1‑147 (MQ=255) cTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCgg > 2:126965/1‑147 (MQ=255) tCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCGCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCCGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGc > 2:6010/1‑147 (MQ=255) tCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGc > 5:57884/1‑147 (MQ=255) gCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCg > 1:158908/1‑143 (MQ=255) gCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCg < 2:158908/143‑1 (MQ=255) gCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCtt > 7:191900/1‑147 (MQ=255) gCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCtt > 7:250044/1‑147 (MQ=255) cTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCAccttggcg > 3:125919‑M2/1‑121 (MQ=255) cTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTg < 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aggccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTg > 8:229549/1‑147 (MQ=255) gccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGAt < 3:99344/147‑1 (MQ=255) ccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGTACACCGGGTGGTACGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGATTGCGAACGGTCTTCGAACAGCGGCGACAGCACCTTGGCGTCGGTCTGAACCGGCTTGCCATGGGTGATg > 6:126334/1‑147 (MQ=255) ccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATg > 4:224718/1‑147 (MQ=255) tgctgcTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTg > 6:246763/1‑147 (MQ=255) 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ccAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTa < 4:79776/130‑1 (MQ=255) aaGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAgg > 5:136423/1‑147 (MQ=255) tGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCt > 8:238587/1‑147 (MQ=255) gcACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCAccttggcggccagcctgggcgagcgttcggaccacccggtgtcccgcgccattgccgagttcggcaagcagcaaggcctggccttgagcgaggtcagtgacttcgttgcgctggccggg > 4:255837‑M2/1‑28 (MQ=255) cACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgc < 1:47738/147‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGTACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgcg < 6:40611/147‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgcg > 3:264698/1‑147 (MQ=255) aCGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgcg > 4:215433/1‑147 (MQ=255) ggTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgcgcg < 1:149918/147‑1 (MQ=255) gTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCtt > 5:154377/1‑140 (MQ=255) gTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCtt < 6:154377/140‑1 (MQ=255) gTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgcgcgc > 4:85658/1‑147 (MQ=255) cTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTc > 3:249339/1‑106 (MQ=255) gAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCgcggcggc > 8:103679/1‑147 (MQ=255) caccggcgCCACCACCTTGGCGTCCGTCTGCACCGCCTTGCCCTGGCAGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCggcggcggc < 7:100992/144‑1 (MQ=255) cAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCgcggc > 5:164782/1‑141 (MQ=255) cAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCgcggc < 6:164782/141‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGcggcggcgg > 2:239364/1‑145 (MQ=255) gcggcgCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGTTTGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGGGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCggcca < 2:59467/147‑1 (MQ=255) cggcgCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGGACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTGTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCggccag < 6:68354/147‑1 (MQ=255) ggcgCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCggccagg > 6:28548/1‑147 (MQ=255) cgcCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTgc > 6:74569/1‑128 (MQ=255) ccAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCAc < 4:264698/147‑1 (MQ=255) cAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACt < 3:215433/147‑1 (MQ=255) aGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCCGGCCACTg > 7:234807/1‑147 (MQ=255) aGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTg < 6:102965/147‑1 (MQ=255) | CAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCAGGATGCCTTTGCGCGCGGCGGCGGCCAGGCCACTG > NC_002947/5864615‑5864903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |