Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,355,046 | Δ1 bp | 8.7% | coding (246/681 nt) | modB → | molybdate ABC transporter permease ModB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,355,046 | 0 | G | . | 8.7% | 216.9 / 13.4 | 69 | coding (246/681 nt) | modB | molybdate ABC transporter permease ModB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/30); new base . (3/3); total (36/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.78e-01 |
GTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGA > NC_002947/4354902‑4355190 | gtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAg > 6:82469/1‑149 (MQ=255) gtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAg < 2:28103/149‑1 (MQ=255) gtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGC‑‑CCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTTAGGCCACCCAGGCGCTAg < 2:229393/147‑1 (MQ=255) gCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑Gcc > 3:64205/1‑149 (MQ=255) tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCt > 4:172776/1‑148 (MQ=255) tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTg > 5:336570/1‑149 (MQ=255) cgcgcgCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg < 4:177192/149‑1 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCt < 3:172776/146‑1 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTggg > 5:142090/1‑149 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTggg < 2:337892/149‑1 (MQ=255) cgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt < 3:251824/149‑2 (MQ=255) cgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt < 5:61481/149‑2 (MQ=255) gcgcTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTgtgg < 6:59534/149‑1 (MQ=255) gcgcTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GACTGGGCAGTgtgg > 6:73452/1‑149 (MQ=255) tctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGtt > 5:6696/1‑149 (MQ=255) tctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGtt > 7:232893/1‑149 (MQ=255) tctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGtt > 7:51508/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCt < 8:107666/149‑1 (MQ=255) cTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCtt > 7:95847/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTc < 2:106716/147‑1 (MQ=255) gcgGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTca > 5:265146/1‑147 (MQ=255) ggCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCCGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGc > 2:301447/1‑149 (MQ=255) cGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTg > 2:311617/1‑149 (MQ=255) ggtgggtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTgg < 8:95847/149‑1 (MQ=255) ggtgggtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTgg < 4:276045/149‑1 (MQ=255) gtgggtgCGGTGGTGACACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGt < 1:342450/149‑1 (MQ=255) ggtggtGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgt < 7:167453/115‑1 (MQ=255) ggtggtGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgt > 8:167453/1‑115 (MQ=255) cACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGgtg < 5:82469/149‑1 (MQ=255) gTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGTGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGcc > 5:306979/1‑149 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTc > 1:360785/1‑149 (MQ=255) cACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtg < 6:336570/149‑1 (MQ=255) cACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtg > 8:280335/1‑149 (MQ=255) cACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtg > 4:360864/1‑149 (MQ=255) aCCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGgt > 6:81807/1‑129 (MQ=255) aCCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGgt < 5:81807/129‑1 (MQ=255) aCCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtgg > 5:198814/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAc < 8:51508/149‑1 (MQ=255) gTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAcc > 8:315302/1‑149 (MQ=255) tGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAccc > 1:250304/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTg < 3:285082/149‑1 (MQ=255) ggTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTg > 7:66857/1‑147 (MQ=255) gTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCCCGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCACCCCCTg > 8:203049/1‑146 (MQ=255) ttACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGGTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGGAACCCCTGCAGAAt < 1:301447/148‑1 (MQ=255) aCCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGcc > 7:1433/1‑149 (MQ=255) gTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTg > 3:47184/1‑149 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCTACCCCTGCAGAATGCCTTTg < 4:339125/148‑1 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt < 7:280335/147‑1 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTg < 6:265146/148‑1 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTg < 6:142090/148‑1 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAAGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt < 4:64205/147‑1 (MQ=255) tCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCGTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATAGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTCCAACCCCTGCAGAATGCCTATGgcgc > 2:156833/1‑148 (MQ=255) ccTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCg < 8:66857/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCgg < 7:315302/149‑1 (MQ=255) gggccGCACGGCTGGCTTGGGCATGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGc < 6:6696/144‑1 (MQ=255) ccGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAgcg > 4:258959/1‑149 (MQ=255) gtttGGTCAGGCCTCCCAGGTGGTAG‑GTCTTGGGTGTGTGGTGTTCTTCTTTTCTTGCCTGGTGTTTGGCTCGACGGTTTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaa < 8:232893/146‑1 (MQ=255) gctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaa < 3:258959/148‑1 (MQ=255) gctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaa < 3:312936/148‑1 (MQ=255) ctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGt > 5:317256/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg > 7:128714/1‑149 (MQ=255) cacactgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccgc > 6:214741/8‑149 (MQ=255) cacactgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg > 6:209597/8‑148 (MQ=255) cAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccgc > 5:68547/1‑149 (MQ=255) aGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccgc > 4:92132/1‑148 (MQ=255) ggCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTa > 1:141058/1‑149 (MQ=255) cccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTg > 6:124305/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGc < 6:68547/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGa < 2:250304/149‑1 (MQ=255) | GTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGA > NC_002947/4354902‑4355190 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |