| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,303,355 | Δ1 bp | 6.2% | coding (418/3675 nt) | recB ← | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,303,355 | 0 | C | . | 6.2% | 201.4 / 6.8 | 64 | coding (418/3675 nt) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/27); new base . (2/2); total (35/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
CCAGTTGCCGCGCACCCAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGTGGATCGGCG > NC_002947/5303209‑5303500 | ccAGTTGCCGCGCACCCAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTcgc < 2:286776/149‑1 (MQ=255) tGCCGCGCACCCAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCgc‑ag > 1:370543/1‑148 (MQ=255) ccGCGCACCCAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCAt > 2:307506/1‑149 (MQ=255) cACCCAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCT‑GCGCGAGCATgcctt < 2:232712/149‑4 (MQ=255) ccAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTgg > 5:211646/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTgg > 1:252239/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGc < 8:218330/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCa < 7:334063/149‑1 (MQ=255) ccAGTGAGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGCTTTC‑CA‑GTGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTCCCGCAGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCCCTCGCACCAg > 4:269954/1‑149 (MQ=255) ccTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGAGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑AA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCAGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGt > 5:192021/1‑149 (MQ=255) cATCCCATAGCAGAAGGGCCGCCAGTAATCGGGCTTGACCTGGCCCAACTAC‑TCGCTGTGGGCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATa < 2:168510/149‑1 (MQ=255) aTCCCATTGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑TGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTTCCGCTGTCGTAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCATCCATGGATGGTGGATAc < 3:269954/149‑1 (MQ=255) aTCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATAc > 8:325273/1‑149 (MQ=255) aTCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAATAAAAGCGCATTACCTGGCCCAACAAA‑TAGATATGGTCGGTTTC‑AA‑AGGTATGAGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGACGAAGGCATGCACGCGC‑AGAATgc > 7:56911/1‑121 (MQ=255) tCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATAcc < 5:285418/149‑1 (MQ=255) ccATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGc < 4:207495/149‑1 (MQ=255) cATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATAGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCg > 5:169466/1‑147 (MQ=255) aGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGcc > 5:126976/1‑149 (MQ=255) gCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAACGTCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGcc > 1:72860/1‑149 (MQ=255) gagtatcgccgcGAGTTATAGCGCATGTCCTTGCCCAAAAAC‑TCTGTGTGGTGGGTTTCTCATGGTTTTGGCTCCTTACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCa < 1:307506/142‑1 (MQ=255) cAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTc > 6:346358/1‑149 (MQ=255) cAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTc < 1:277831/149‑1 (MQ=255) gatccgcctcCAGTAATCGCGCACGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAATAGGCTTCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGt < 8:347880/145‑1 (MQ=255) gAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGt < 2:252239/149‑1 (MQ=255) ccAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACt < 6:126976/149‑1 (MQ=255) ccAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACt < 7:48086/149‑1 (MQ=255) cAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTc > 2:156445/1‑123 (MQ=255) cAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTc < 1:156445/123‑1 (MQ=255) cAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTg > 3:238609/1‑149 (MQ=255) aGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGc > 5:304443/1‑149 (MQ=255) gACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTcc > 8:46036/1‑148 (MQ=255) ccAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAAccggccg > 6:43854/1‑149 (MQ=255) caacaaC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAAccggccgg > 2:337551/1‑149 (MQ=255) acaac‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGAt < 7:316779/133‑1 (MQ=255) acaac‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGAt > 8:316779/1‑133 (MQ=255) c‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAAc > 6:120594/1‑149 (MQ=255) gCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAAcgcg > 4:248499/1‑149 (MQ=255) tgGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGc < 2:72860/147‑1 (MQ=255) tgGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCa < 6:304443/149‑1 (MQ=255) gTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGt > 1:102772/1‑149 (MQ=255) gTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTc > 5:318529/1‑149 (MQ=255) gTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTc < 7:325273/149‑1 (MQ=255) tttC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCt < 1:205323/149‑1 (MQ=255) tC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGTATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCtt < 6:211646/148‑1 (MQ=255) cA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTtgtg > 8:251831/1‑149 (MQ=255) cA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTtgt < 2:370543/148‑1 (MQ=255) cA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTtgt < 4:238609/148‑1 (MQ=255) ggttCTGTGT‑‑GATCAGGCTGCCTCTGTCTAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGACATGGATTTTCTATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACTTCGATTTCCAACCGGACGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTggg < 6:192021/146‑1 (MQ=255) ggT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAAt < 7:46036/146‑1 (MQ=255) ggT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGt > 3:337617/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCACCCGCCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTg < 6:169466/149‑1 (MQ=255) cGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTg > 1:326339/1‑148 (MQ=255) gTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCaa > 6:383783/1‑147 (MQ=255) tCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAAc < 5:43854/147‑1 (MQ=255) tCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAg < 3:248499/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAg > 5:111960/1‑149 (MQ=255) ccagcgCATGCT‑GCGCGAGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGt > 6:208928/6‑149 (MQ=255) gAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGTg > 8:135297/1‑149 (MQ=255) gAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGTg > 6:319699/1‑149 (MQ=255) agcgCATGCT‑GCGCGAGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGt < 6:256840/144‑1 (MQ=255) agcgCATGCT‑GCGCGAGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGt > 5:256840/4‑147 (MQ=255) aTGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGTGGATCgg > 1:285291/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTgg < 6:34063/112‑1 (MQ=255) gCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTgg > 5:34063/1‑112 (MQ=255) gCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGTGGATcatgg > 8:327834/1‑145 (MQ=255) | CCAGTTGCCGCGCACCCAGGCCAGTGCGTCACCTTGCATCCCATAGCAGAAGCGCCGCCAGTAATCGCGCATGACCTGGCCCAACAAC‑TCGCTGTGGTCGGTTTC‑CA‑GGGTCTGGGT‑‑GAACAGGCTGCCGCTGTCGAAGGCATGCTCGCGC‑AGCATGCGCTGGCACCAGCCATGGATGGTCGATACCGCAGCCTCGTCCATCCACTGCACGGCGATTTCCAACCGGCCGGCGCAACGCGGCCAGTTTTCTTGTGGGTAATCGTCACGCAGTTGGTGCAACAGTGGATCGGCG > NC_002947/5303209‑5303500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |