| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,736,533 | Δ1 bp | 6.2% | coding (913/1674 nt) | hutU ← | urocanate hydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,736,533 | 0 | C | . | 6.2% | 210.7 / 6.7 | 65 | coding (913/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/28); new base . (2/2); total (35/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
AACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCGGGCGGACG > NC_002947/5736385‑5736681 | aaCAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑tgcacgtgcac > 5:148232/1‑149 (MQ=255) cAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACgg < 7:68335/149‑1 (MQ=255) ccGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTggcg < 5:366619/149‑1 (MQ=255) cGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTg > 1:65052/1‑141 (MQ=255) cGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTg < 2:65052/141‑1 (MQ=255) cGAAGCCTGGGAATTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCtt > 8:167189/1‑148 (MQ=255) cGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTg < 2:157651/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGa > 6:358186/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGTAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGTATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc < 5:334906/148‑1 (MQ=255) gCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCa < 1:240899/149‑1 (MQ=255) gggAATTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGc < 7:167189/149‑1 (MQ=255) gggAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTg > 6:274042/1‑148 (MQ=255) ggAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCa < 4:323649/149‑1 (MQ=255) aGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGcc > 8:25401/1‑149 (MQ=255) aaGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTc < 6:148232/149‑1 (MQ=255) gCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGt > 7:36162/1‑149 (MQ=255) tGGCCACACCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTgc > 4:323284/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTgcgc > 6:39265/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTgcg > 5:40949/1‑148 (MQ=255) ccACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCAAGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCa > 2:318442/1‑149 (MQ=255) ctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATcgcg < 3:329163/147‑1 (MQ=255) ctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCgg < 3:289687/148‑1 (MQ=255) ccATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc < 6:86024/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtgctg < 1:54323/87‑5 (MQ=38) aTCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtgctg > 2:54323/1‑83 (MQ=38) ggCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc > 2:192108/1‑149 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCTGCCTTGACAACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc > 7:7985/1‑148 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAg < 5:274042/145‑1 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc > 5:2398/1‑148 (MQ=255) ggATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAg > 7:274191/1‑149 (MQ=255) ccGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAg < 1:192108/149‑1 (MQ=255) gTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGt < 3:323284/149‑1 (MQ=255) aaTCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAg > 5:251216/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc > 5:230396/1‑129 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc < 6:230396/129‑1 (MQ=255) gAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGt > 5:343901/1‑149 (MQ=255) gAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGt > 3:300175/1‑149 (MQ=255) gTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc < 5:320138/117‑1 (MQ=255) gTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc > 6:320138/1‑117 (MQ=255) gggATGCCCTGCTTCTGGAAGTCTAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGACGGTTCGGTCTGCGCACGATCGAGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCAGTTCAGTgg > 5:297870/1‑149 (MQ=255) gggATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTgg > 3:249372/1‑149 (MQ=255) gggATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTgg < 6:2398/149‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTgg > 5:68944/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTgg > 1:295448/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTgg > 3:341887/1‑149 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCgg > 5:316717/1‑115 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCgg < 6:316717/115‑1 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGt < 6:46499/142‑1 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGt > 5:46499/1‑142 (MQ=255) cTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctg < 5:358186/148‑1 (MQ=255) aaGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctggtctg < 7:80762/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctggtctggt > 2:102168/1‑149 (MQ=255) tCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCtggtctggtc > 5:188777/1‑149 (MQ=255) tCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTGCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCtggtctggtc < 6:273340/149‑1 (MQ=255) ccAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCg > 8:243296/1‑149 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCa < 7:134663/50‑1 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCa > 8:134663/1‑50 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTTGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCgg > 8:161428/1‑149 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCgg > 3:174111/1‑149 (MQ=255) cATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTg < 1:147325/104‑1 (MQ=255) cATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTg > 2:147325/1‑104 (MQ=255) aTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgc < 6:230870/131‑1 (MQ=255) aTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgc > 5:230870/1‑131 (MQ=255) tGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGAcc < 5:39265/149‑1 (MQ=255) tGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGAcc < 8:260484/149‑1 (MQ=255) tGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGAcc < 8:36162/149‑1 (MQ=255) cacgtgcacgGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCg < 7:266951/136‑1 (MQ=255) cacgtgcacgGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCg > 8:266951/1‑136 (MQ=255) acgtgcacgGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGGCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCgg < 7:25401/149‑1 (MQ=255) cgGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCGGGCGGACg > 4:85356/1‑149 (MQ=255) | AACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCGGGCGGACG > NC_002947/5736385‑5736681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |