Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 11,569:1 | +G | 6.4% | coding (467/1104 nt) | dnaN → | DNA polymerase III subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 11,569 | 1 | . | G | 6.4% | 308.1 / 12.6 | 78 | coding (467/1104 nt) | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (38/35); new base G (2/3); total (40/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 |
CCCTGTCGACCCTGCCTGCCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTG > NC_002947/11422‑11714 | cccTGTCGACCCTGCCTGCCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑c < 8:345985/149‑1 (MQ=255) tCGACCCTGCCTGCCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCa < 7:229532/148‑1 (MQ=255) gACCCTGCCTGCCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCAtg < 5:188272/148‑1 (MQ=255) cccTGCCTGCCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCAtgctg > 3:262664/1‑149 (MQ=255) ctgcctgcCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAAGCAGCAtgccgt > 1:101956/1‑146 (MQ=255) tgcctgccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCtt > 6:19372/1‑149 (MQ=255) cctgccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGa < 5:19372/149‑1 (MQ=255) ctgccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAg < 3:155036/149‑1 (MQ=255) ctgccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAg > 2:92150/1‑149 (MQ=255) gccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGt > 2:228402/1‑149 (MQ=255) ccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAAGCAGCATGCCG‑TTGAgg < 7:39089/147‑1 (MQ=255) ccAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTAGTACCTCAAGCTGCATGCCG‑TTGAgg < 6:252650/147‑1 (MQ=255) cAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGttt > 3:279700/1‑149 (MQ=255) aaTGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTc < 4:187553/149‑1 (MQ=255) aaTGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTc > 5:30515/1‑149 (MQ=255) cccGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAAGCAGCATGCCG‑TTGAGGtaatagc > 7:325349/1‑138 (MQ=255) cccGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAAGCAGCATGCCG‑TTGAGGtaatagc < 8:325349/144‑7 (MQ=255) cccGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAaca > 2:184794/1‑149 (MQ=255) cccGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAaca > 4:244146/1‑149 (MQ=255) ccGTCTGTGGAAGTAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGGCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAaca < 3:342161/148‑1 (MQ=255) aCTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGtt < 4:27135/149‑1 (MQ=255) tgGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTgcgc > 1:292026/1‑149 (MQ=255) gaagaaGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTgcgcgc > 3:104273/1‑149 (MQ=255) aagaagGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCGGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCt < 5:196096/149‑1 (MQ=255) aagGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGGTCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTa > 2:176380/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCAGGAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATc > 1:45305/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCATAGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCACAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCa > 1:51687/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCAc < 6:45953/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAg < 2:18750/113‑1 (MQ=255) gTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAg > 1:18750/1‑113 (MQ=255) ttCGCTGACCTGCAACATGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACg < 4:305278/149‑1 (MQ=255) gCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGt > 4:159185/1‑148 (MQ=255) tGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCAc > 5:141382/1‑149 (MQ=255) aCCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCAAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCg > 6:152979/1‑149 (MQ=255) cTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCTTGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCTA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTAGCGCAACACGTTGCGCGATGTATCCACCGAGGGTCCCGGcc > 8:297418/1‑149 (MQ=255) cTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGcc > 1:159920/1‑149 (MQ=255) tGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCt > 8:171343/1‑149 (MQ=255) tGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCt > 6:136490/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTg > 5:247567/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCt > 6:183983/1‑149 (MQ=255) agca‑gagca‑AGCTGCGCCGCCTGGTCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGc < 1:176380/149‑1 (MQ=255) agca‑gagca‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGc > 4:165533/1‑149 (MQ=255) agca‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTc < 3:199081/127‑1 (MQ=255) agca‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTc > 4:199081/1‑127 (MQ=255) gca‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGAt < 7:336388/148‑1 (MQ=255) ca‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGa < 4:262664/149‑1 (MQ=255) ca‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGa < 1:184794/149‑1 (MQ=255) cgccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGAt < 1:228402/149‑1 (MQ=255) tGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTg < 8:124782/119‑1 (MQ=255) tGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTg > 7:124782/1‑119 (MQ=255) gATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGc < 3:165533/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAg > 6:178977/1‑147 (MQ=255) aTCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAg < 3:244146/147‑1 (MQ=255) aTCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGc < 8:194687/148‑1 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGACATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCaaa < 6:30515/148‑3 (MQ=255) caGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagg < 5:152979/147‑1 (MQ=255) aGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCaggag > 6:98131/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATc < 7:297418/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCg > 8:254729/1‑149 (MQ=255) gCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGAGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac > 2:156474/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac > 2:295036/1‑148 (MQ=255) cTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACAcc < 3:370351/149‑1 (MQ=255) ttCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac > 6:202908/1‑147 (MQ=255) ttCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac > 2:136398/1‑147 (MQ=255) ttCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac < 5:202908/147‑1 (MQ=255) gCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAgg < 1:92150/148‑1 (MQ=255) cagcagGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTGGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGcc < 6:73274/149‑1 (MQ=255) aTGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTaaa < 3:55526/149‑1 (MQ=255) aTGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTaaa < 5:136490/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCTATTACCACAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTaaa < 2:51687/148‑1 (MQ=255) gtgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTCCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAgg > 4:7215/1‑149 (MQ=255) tgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAgg > 7:118603/1‑148 (MQ=255) tgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGt < 7:171343/149‑1 (MQ=255) tgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGt > 5:107930/1‑149 (MQ=255) ttACCTCAA‑GGGCATGCTGCTTGAGGTTTACCGCAACTCGTTGCGCGCTGTATCCTCCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTg < 4:104273/148‑1 (MQ=255) ttACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCt < 3:159185/147‑1 (MQ=255) aCCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGa < 5:178977/148‑1 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGtt > 1:281631/1‑149 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGtt > 5:75058/1‑149 (MQ=255) aa‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTg < 2:292026/147‑1 (MQ=255) a‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAgg > 8:126123/1‑114 (MQ=255) | CCCTGTCGACCCTGCCTGCCAATGACTTCCCGACTGTGGAAGAAGGCCCGGGTTCGCTGACCTGCAACCTGGAGCA‑GAGCA‑AGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTG > NC_002947/11422‑11714 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |