| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,267,505:1 | +C | 5.2% | coding (91/1518 nt) | PP_4643 → | xanthine/uracil permease family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,267,505 | 1 | . | C | 5.2% | 313.4 / 10.0 | 77 | coding (91/1518 nt) | PP_4643 | xanthine/uracil permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (40/33); new base C (2/2); total (42/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
AATCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTGGCCTGCC > NC_002947/5267357‑5267650 | aaTCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCAtg > 3:39147/1‑149 (MQ=255) tCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCAtg‑tg < 1:59552/149‑1 (MQ=255) aTTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGc < 2:351161/148‑1 (MQ=255) aTTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCt > 4:28822/1‑149 (MQ=255) tttGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCt > 3:355327/1‑148 (MQ=255) ggAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATg > 5:232198/1‑149 (MQ=255) gAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCAtag < 5:175226/149‑3 (MQ=255) aaGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTa > 1:23620/1‑149 (MQ=255) aGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAt < 3:28822/149‑1 (MQ=255) tCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggtg < 7:107817/149‑1 (MQ=255) tCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggt < 6:279529/148‑1 (MQ=255) tCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggt < 4:244501/148‑1 (MQ=255) gcTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTTCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggtg < 4:268778/148‑1 (MQ=255) aCAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCAAAGCACGTATCCCCCCAAGCGCCCCCAGGTTGAAAACCTCGGGCGTGGTGCCAACCGTGCCTATGGGGTGCAGCGTG‑TGCTGGCCAGGTATGGTgggg > 1:94416/1‑148 (MQ=255) cAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGAcc < 8:330834/135‑1 (MQ=255) cAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGAcc > 7:330834/1‑135 (MQ=255) aGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAtc > 8:117408/1‑149 (MQ=255) tAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAtcgt > 4:185841/1‑149 (MQ=255) 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aaaCAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGAt > 8:293616/1‑149 (MQ=255) cAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCt > 2:225501/1‑149 (MQ=255) agagagCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTg > 1:261147/1‑149 (MQ=255) agagagCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTg > 7:247383/1‑149 (MQ=255) agagagCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTg < 2:23620/149‑1 (MQ=255) cTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAgg > 2:277892/1‑149 (MQ=255) gCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGGACCCCTGATCCTGGGGCAGGcc > 5:277413/1‑149 (MQ=255) ccATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCcgcg > 5:367338/1‑149 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggtg > 3:87312/1‑110 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggtg < 4:87312/110‑1 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCgg > 5:184571/1‑149 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAATACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCgg < 8:315617/149‑1 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGAAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCgg > 6:186349/1‑149 (MQ=255) aTGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCggg > 7:198085/1‑149 (MQ=255) tGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGc < 4:161983/149‑1 (MQ=255) cGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGaa < 3:185841/148‑1 (MQ=255) cGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAAt < 8:69450/149‑1 (MQ=255) tCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATgg > 4:13438/1‑149 (MQ=255) cccTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTg > 4:171399/1‑149 (MQ=255) ccTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGc > 7:296899/1‑149 (MQ=255) cTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGcc > 5:374024/1‑149 (MQ=255) gCACGTCTCCCGCCCAGCGACCCGAGGATGAAACCCTCGGCCTTCGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCg < 6:332882/147‑1 (MQ=255) gCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGa > 2:173159/1‑138 (MQ=255) gCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGa < 1:173159/138‑1 (MQ=255) gCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCg < 7:117408/147‑1 (MQ=255) aCGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAAt < 6:374024/149‑1 (MQ=255) gTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCg < 1:225501/149‑1 (MQ=255) tcCCGCCAAGCGCCCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCAGG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTCCCCCTGATCGTGGGGCCGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCa > 6:370682/1‑149 (MQ=255) tcCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGaaaatgtag > 1:135873/1‑143 (MQ=255) ccGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCgccgcc > 6:291173/1‑149 (MQ=255) cGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCt > 8:64452/1‑149 (MQ=255) gAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGtt > 6:136485/1‑149 (MQ=255) aaaaCCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAGCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTc < 3:25620/149‑1 (MQ=255) aaaCCTCGGCCTTGTTCCCAAACTGGCCTATGGAATGCAGCATG‑AGCTGACCTGGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACACCAGAAACTGGTGCAGTACGCGTGCAAGAATGCTGCAGAAAACGGCATGCTGATCTCAGCCACGATGtgct > 8:352783/1‑146 (MQ=255) aaaCCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAcccc < 8:166124/80‑1 (MQ=255) aaaCCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAcccc > 7:166124/1‑80 (MQ=255) aaCCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCAGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGc > 2:293047/1‑149 (MQ=255) 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caaagcTGGCCTATTTGCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATACTTTGGCATGCCGCGGTCCTGAATGGTGACGAATTCTGCATGCTTATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCAcc < 7:352783/144‑1 (MQ=255) aaCCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCct > 1:1488/1‑149 (MQ=255) catacaTGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCCCCctgctg > 6:262090/6‑148 (MQ=255) catacaTGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCctgctg > 1:237198/6‑148 (MQ=255) tacaTGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAg < 2:237198/146‑1 (MQ=255) tATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGAc > 5:180267/1‑149 (MQ=255) tGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGAccc < 8:247383/149‑1 (MQ=255) gTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCtt < 8:198085/149‑1 (MQ=255) tCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTg < 6:232198/149‑1 (MQ=255) tGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTGGc > 5:281443/1‑149 (MQ=255) cagcaTG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTGGCCt > 3:147925/1‑149 (MQ=255) caTG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTGGCCTGcc < 8:296899/149‑1 (MQ=255) caTG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTGGCCTGcc < 3:171399/149‑1 (MQ=255) | AATCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAACCTCGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGACCCTTGGCCTGCC > NC_002947/5267357‑5267650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |