| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,171,841 | 1 | . | C | 5.0% | 327.6 / 10.8 | 80 | coding (461/1836 nt) | glmS | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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GTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGT > NC_002947/6171693‑6171988 | gTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCa < 7:17120/149‑1 (MQ=255) aGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑gg < 5:112540/148‑1 (MQ=255) gTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑Ggcg > 2:341668/1‑149 (MQ=255) tAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑Ggcgc < 2:128847/149‑1 (MQ=255) ccTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCC‑TGCACGGCGCtta < 8:55259/149‑2 (MQ=255) cGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACAGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGAA‑GGCGCTCCAccgc > 4:228408/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCTGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCtt > 7:197378/1‑148 (MQ=255) gCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAgg < 7:301280/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAgg > 4:55140/1‑149 (MQ=255) gtGGTCGGACGCCAGGAATTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCATCTCCAGGCCGTAAGCGGCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAggg < 5:349853/148‑1 (MQ=255) ggTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCg > 8:184707/1‑149 (MQ=255) ggTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCg > 8:220229/1‑149 (MQ=255) tCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTc > 3:46571/1‑149 (MQ=255) 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gCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGctc > 8:288191/1‑142 (MQ=255) gCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAgg > 8:70459/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGgtgt > 5:116842/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCC‑TGCACGGCGCttac > 6:96205/1‑99 (MQ=255) cAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCC‑TGCACGGCGCttac < 5:96205/101‑3 (MQ=255) cGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggtg > 5:209578/1‑148 (MQ=255) gATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGa < 4:46571/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAgg < 1:206152/149‑1 (MQ=255) cGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGa < 6:324419/149‑1 (MQ=255) ccACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGAc < 3:29836/149‑1 (MQ=255) ccACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGAc > 5:177974/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |