| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,552,399:1 | +G | 9.0% | coding (56/978 nt) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,552,399 | 1 | . | G | 9.0% | 248.3 / 17.7 | 67 | coding (56/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (34/27); new base G (3/3); total (37/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.95e-01 | |||||||||||
GTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCC > NC_002947/3552252‑3552547 | gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGa < 1:149997/148‑1 (MQ=255)gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGa < 8:2762/148‑1 (MQ=255) gtgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGc > 5:270484/1‑149 (MQ=255) gtgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGc > 2:145683/1‑149 (MQ=255) tgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCTggc < 1:153644/149‑3 (MQ=255) tgCCTAACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGAGCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGcc > 8:78398/1‑149 (MQ=255) cTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTg > 7:129649/1‑149 (MQ=255) tGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGcc > 3:210042/1‑145 (MQ=255) tGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGcc < 4:210042/145‑1 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGCCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCg > 3:8228/1‑149 (MQ=255) aTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGc < 2:302336/149‑1 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCt < 5:371354/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGgc > 2:68716/1‑149 (MQ=255) aCTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGgc < 6:42893/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGgcg > 7:276765/1‑149 (MQ=255) aGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACgg < 5:263404/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa > 3:177156/1‑149 (MQ=255) ggCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGt > 2:73881/1‑149 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt < 8:78403/149‑1 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt < 8:276765/149‑1 (MQ=255) atcatcAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATg > 2:101860/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCg > 6:135912/1‑149 (MQ=255) ggCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg < 4:177156/149‑1 (MQ=255) gCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCggg < 8:129649/149‑1 (MQ=255) cGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt > 2:43959/1‑129 (MQ=255) cgccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGa < 1:73881/149‑1 (MQ=255) gccgTGGCATCAGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGAt < 5:169415/149‑1 (MQ=255) cgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCTGGGGGGTGGTAATCGGCCGCAATCAAGGCCAGCGCCACGA‑GCGCTGACTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATgg > 1:360787/1‑149 (MQ=255) tGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGtt < 3:363565/149‑1 (MQ=255) gCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCg > 5:289180/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCa > 5:161359/1‑149 (MQ=255) gTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCGGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAg > 2:50896/1‑149 (MQ=255) gTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAg > 6:300131/1‑149 (MQ=255) gTGAGGCCTATGGCAACGGTGGTCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgc > 5:336728/1‑149 (MQ=255) gTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGTCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgc > 2:146342/1‑149 (MQ=255) gCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgccgcc > 1:111189/1‑148 (MQ=255) tGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCtt < 3:88677/149‑1 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg > 3:84938/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg > 2:203724/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTg < 6:270484/148‑1 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTATCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTg < 6:190922/148‑1 (MQ=255) cAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGc < 1:68716/149‑1 (MQ=255) cAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGc < 6:289180/149‑1 (MQ=255) ggTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTgg < 4:84938/149‑1 (MQ=255) gtgggAAGCGGCCGCACTCCAGCCCAGCTCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTCCGTCGACTCGCGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGGTGGCCGCCAACCTTGGTGTGGCAGTACTGGCGCt < 6:112237/149‑1 (MQ=255) gtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTgg < 5:300131/148‑1 (MQ=255) gtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGa < 3:227477/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 7:78398/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGTCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt > 3:40292/1‑148 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTTGCAGTACTGGCGCTGGACATGAg < 1:145683/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 2:111189/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 1:101860/148‑1 (MQ=255) cAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATcc < 1:203724/149‑1 (MQ=255) aTGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCg > 6:382879/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGt > 4:194699/1‑149 (MQ=255) acaaggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGGCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGtt > 6:42568/7‑149 (MQ=255) aaggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa > 6:282818/5‑137 (MQ=255) aaggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 5:282818/133‑1 (MQ=255) aggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAc > 1:184690/4‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTCGA‑GCGCTTCCTTGATTCGCTGGCGCACGGGGCCGACTAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCAGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccg > 8:163263/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTAGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTTGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccg > 8:349500/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTTGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa > 5:83223/1‑133 (MQ=255) cAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 6:83223/133‑1 (MQ=255) cAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccgc > 7:334961/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccgc > 3:174803/1‑149 (MQ=255) agcgcTCGAGGCGCTGGCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccgcc < 5:42568/145‑1 (MQ=255) gcCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCa > 5:55185/1‑149 (MQ=255) cTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCAcg > 3:289500/1‑149 (MQ=255) tCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCAcgc > 6:128605/1‑149 (MQ=255) a‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGcc > 1:223789/1‑149 (MQ=255) | GTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCC > NC_002947/3552252‑3552547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |