| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 713303 | 75 (1.250) | 5 (0.090) | 3/252 | NT | 6.5% | coding (292/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| ? | NC_002947 | = 713337 | 72 (1.250) | coding (326/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTC > NC_002947/713159‑713449 | aTTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTggg > 5:376890/1‑149 (MQ=255)aTTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTgg < 2:375497/148‑1 (MQ=255)aTTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTgg < 6:28887/148‑1 (MQ=255) cTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGgcg < 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tCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTgg > 6:341427/1‑135 (MQ=255) tCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGAcc > 7:133326/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGAcc < 5:139499/148‑1 (MQ=255) gACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACctggctg < 6:102459/148‑1 (MQ=255) cccTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGcc > 1:75304/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCg > 1:46112/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCg > 8:109174/1‑149 (MQ=255) tGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGtg > 1:187309/1‑149 (MQ=255) gCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGtgg < 6:338899/148‑1 (MQ=255) gCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGtg < 2:46112/147‑1 (MQ=255) gCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGtg < 2:115043/147‑1 (MQ=255) aacaCCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCagcgccacggccagccaggtctcgttgcgccccaggc > 8:157794‑M1/1‑112 (MQ=255) aacaCCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTggc < 2:27844‑M2/149‑4 (MQ=255) acacCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTggcg > 8:133326‑M2/1‑145 (MQ=255) acacCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGAAGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCATGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGAGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTgtc < 7:44825‑M2/148‑4 (MQ=255) 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cAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGCGACCTGGCTGCCCGTGGCGCTGGCGCTGGAGCTGGGTgggg > 6:94366/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTgggg > 3:334219/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTgggg > 4:30792/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGAt > 6:64929/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGAt < 1:213176/147‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cgcgGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGc < 6:72348/149‑1 (MQ=255) gcgGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTgg > 8:268243/1‑147 (MQ=255) gTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGaa < 5:64929/149‑1 (MQ=255) ggTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGc > 8:87532/1‑148 (MQ=255) gtcgtcTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCa > 2:296946/1‑149 (MQ=255) cgtcTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCAtt < 8:304454/149‑1 (MQ=255) gCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTggcgcttgagcccgacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacacccagcgctgccaacccgctccgtccgccacgaagctcaacccggca < 7:207722‑M2/149‑105 (MQ=255) gCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTc < 1:296946/148‑1 (MQ=255) gCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGAGGCGCTggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagcgcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggca < 5:70673‑M2/149‑105 (MQ=255) cTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggcac < 7:157794‑M2/149‑106 (MQ=255) cTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTccc < 3:15626/149‑1 (MQ=255) tCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCg > 5:244521/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGc < 2:187309/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGGTGGCGCTGGTGGTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCt > 3:322518/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCt > 1:65335/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCt < 4:334219/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCt > 6:124264/1‑149 (MQ=255) cgccagcgccacggccagccaggtctcgttgcgccccaggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggcaccggtgt > 8:133326‑M1/1‑4 (MQ=255) cgcCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCtt < 5:124264/149‑1 (MQ=255) gccagcgccacggccagccaggtctcgttgcgccccaggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggcaccggtgtt < 2:27844‑M1/149‑147 (MQ=255) gcCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccgtcagccaggaagctgaacgcggcaccggtgtt > 8:157794‑M2/1‑37 (MQ=255) gacagcgccacggccagccaggtctcgttgcgccccaggctcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcatggcgaacaaccagcgctgccaacccgctccttcagccaggaagctgaacgcggcaccggtgt < 7:44825‑M1/146‑146 (MQ=255) ccagcgccacggccagccaggtctcgttgcgccccaggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacaaccagcgctg > 5:301239‑M1/1‑2 (MQ=255) ccagcgccacggccagccaggtctcgttgcgccccaggcgcttgagccagacgaccagtaccgcgctgaccaccacggcgatcagggcgaacaaccagcgctg < 6:301239‑M1/103‑102 (MQ=255) | ATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGGTTGTTCGCCCTGATCGCCGTGGTGGTCAGCGCGGTACTGGTCGTCTGGCTCAAGCGCCTGGGGCGCAACGAGACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTC > NC_002947/713159‑713449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |