New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1023424 = | 50 (0.830) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 7.5% | coding (289/1635 nt) | dppA‑I | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 1023456 = | 50 (0.860) | coding (257/1635 nt) | dppA‑I | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
CTGGTCTTGTCATGCCAGGGGTGGTTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTACTGGACGATGTCGAACCCTTCC > NC_002947/1023279‑1023572 | cTGGTCTTGTCATGCCAGGGGGGGTTCGGGGCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCAGGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGcc < 4:149112/149‑1 (MQ=255) gTCATGCCAGGGGTGGTTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCt < 2:185975/148‑1 (MQ=255) aTGCCAGGGGTGGTTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGCCGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGaaa > 8:152173/1‑149 (MQ=255) gggTGGTTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCa < 3:68932/149‑1 (MQ=255) gtggtTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAgc < 7:296729/149‑1 (MQ=255) ggtTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACGTCCCCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCCGCCCGTCGGCTGAAATGTCCCAccg > 6:26258/1‑148 (MQ=38) gggTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGaa < 2:58055/132‑1 (MQ=255) gggTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGaa > 1:58055/1‑132 (MQ=255) gCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCCCTGGCCGAGcgctggga < 7:243257/149‑3 (MQ=37) gATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGgctggctg > 1:58985/1‑148 (MQ=255) gATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGgctggctg > 8:31897/1‑148 (MQ=255) gATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGgctggctg > 3:287685/1‑148 (MQ=255) gATTGAGGCGCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGGCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGctggctgg < 4:99829/149‑1 (MQ=255) atcgtccagtacaccaccgcagtcaccgccgatgcctcggccgagacagtgttcaaccgcctggtcgacttcaaacccggcaccaccgagatccagccagccctGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAggg < 7:246644‑M1/36‑1 (MQ=255) atcgtccagtacaccaccgcagtcaccgccgatgcctcggccgagacagtgttcaaccgcctggtcgacttcaaacccggcaccaccgagatccagccagccctGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAggg > 8:246644‑M1/105‑140 (MQ=255) aTTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGa > 1:192684/1‑149 (MQ=255) ttGAGGCTACACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCAAGGGTGTGCTTGAATTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGAt < 6:218865/149‑1 (MQ=255) tGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGAtc > 1:350510/1‑149 (MQ=255) ggCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCg > 6:121255/1‑149 (MQ=255) cACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCgg > 2:194024/1‑149 (MQ=255) tCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGttt < 1:194024/149‑1 (MQ=255) ggCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAg < 3:256859/148‑1 (MQ=255) gTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAgg < 6:342860/112‑1 (MQ=255) gTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAgg > 5:342860/1‑112 (MQ=255) ttCAAGTCACGGGGGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGGGTGGAACTTCACCCCCTGCCGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGAc < 5:26258/149‑1 (MQ=255) tCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCg > 3:1191/1‑149 (MQ=255) cACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCgg > 1:350031/1‑149 (MQ=255) aCGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAATGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGt < 4:287685/149‑1 (MQ=255) cGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGtt < 2:177198/149‑1 (MQ=255) gAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGtct > 2:230966/1‑149 (MQ=255) tgttcaaccgcctggtcgacttcaaacccggcaccaccgagatccagccagccctGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAgg > 2:319856‑M1/56‑90 (MQ=255) tgttcaaccgcctggtcgacttcaaacccggcaccaccgagatccagccagccctGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAgg < 1:319856‑M1/35‑1 (MQ=255) aaGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGtct < 2:192684/148‑1 (MQ=255) agtagtCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCg < 7:31897/149‑1 (MQ=255) gtCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGAtctc > 6:194203/1‑99 (MQ=255) tCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGcc > 4:51327/1‑147 (MQ=255) ggtggtGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAg < 2:350031/148‑1 (MQ=255) ggAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCCTcggcg > 4:73893/1‑149 (MQ=255) taaCTTCACCAGCTGAAGCATCTGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTAGGCTTAAATGTCCCAGCTCTATTCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCATGCTGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATcggcg < 6:380450/147‑1 (MQ=255) gAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATcggcgg > 5:63227/1‑149 (MQ=255) gAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATcggcg > 5:380450/1‑148 (MQ=255) gAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCACGCAGTACGCAGAAAAGTAAAAACAATCTGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTAGAAGTAGAACAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATcggcgg > 6:137673/1‑149 (MQ=255) cTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGa < 3:348337/149‑1 (MQ=255) cTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGa < 7:152173/149‑1 (MQ=255) cACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTGAAACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGa < 1:230966/147‑1 (MQ=255) cACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCAGCGGCGGTGCCTg > 2:362784/1‑149 (MQ=255) cACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCACCGCCGATGCCTCGGCCGAGAca < 2:58985/148‑2 (MQ=255) aCCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCTGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGc > 1:31860/1‑149 (MQ=255) cccccTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTCCCCGGTTTGAAGTAGACAAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCg > 2:124992/1‑149 (MQ=255) gCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTAc > 6:239401/1‑149 (MQ=255) aTGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGACTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTACTGGa > 5:322154/1‑149 (MQ=255) aTGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATATCGGTGGTGCGGGGTGTGAAGTCGCCCTGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGTGGCAGCGGCGGTGGCGGCGGTGGTGTACTg > 7:310412/1‑147 (MQ=255) tGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACt > 7:200825/1‑105 (MQ=255) tGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACt < 8:200825/105‑1 (MQ=255) gtAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTACTGGACGATGTCg > 5:86734/1‑148 (MQ=255) tCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑Aac < 1:39154/89‑1 (MQ=255) tCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑Aac > 2:39154/1‑89 (MQ=255) GGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTACTGGACGATGTCGAACCCTTcc < 7:212621‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTAGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTACTGGACGATGTCGAACCCTTcc < 2:378906‑M1/149‑1 (MQ=255) | CTGGTCTTGTCATGCCAGGGGTGGTTCGGGTCGAGCTGGCGATTGAGGCTCCACAGCACGTCATCGGCGTTCAAGTCACGGGTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTCACCCCCTGACGCAGATGGAAGGTGTAGGTCAGGCCGTCGGCTGAAATGTCCCAGCGCTCGGCCAGGGCTGGCTGGATCTCGGTGGTGCCGGGTTTGAAGTCGACCAGGCGGTTG‑AACACTGTCTCGGCCGAGGCATCGGCGGTGACTGCGGTGGTGTACTGGACGATGTCGAACCCTTCC > NC_002947/1023279‑1023572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |