New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1032212 | 73 (1.210) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.2% | coding (306/1137 nt) | PP_0889 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1032289 | 76 (1.320) | coding (383/1137 nt) | PP_0889 | hypothetical protein |
CAGGCCGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGC > NC_002947/1032066‑1032358 | caggccGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCacctgacctg < 7:80768‑M2/143‑1 (MQ=255) gccGTCGATGCCTACGACTTTCCTGCACGCTCCCGCTCGGAGCGCAACGTCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGAAGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTc < 2:233021‑M2/146‑1 (MQ=255) ccGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTGTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCg < 6:307503‑M2/147‑1 (MQ=255) ccGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCg < 6:174434‑M2/147‑1 (MQ=255) aTGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGc < 8:59015/149‑1 (MQ=255) cTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAagg < 5:150273/149‑2 (MQ=255) cTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAaga < 8:91322/149‑1 (MQ=255) cTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAaga < 5:74962/149‑1 (MQ=255) gCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACCCCGCGCCCCCCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgaagctggaagcg > 3:267301‑M1/1‑129 (MQ=255) tCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACt < 5:232195/147‑1 (MQ=255) ccTGCACGCTCCCCCTCGGAGCTCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTgg < 7:167869/148‑1 (MQ=255) cTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGc > 2:304062/1‑148 (MQ=255) tGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCgg < 3:146957/128‑1 (MQ=255) tGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCgg > 4:146957/1‑128 (MQ=255) tGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCa > 5:328112/1‑149 (MQ=255) tGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCa > 1:192852/1‑149 (MQ=255) tGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCa > 8:200952/1‑149 (MQ=255) cACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACg < 1:59310/149‑1 (MQ=255) tCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTaa < 2:26529/124‑1 (MQ=255) tCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTaa > 1:26529/1‑124 (MQ=255) ccccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATgg < 2:192852/149‑1 (MQ=255) ccccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATgg > 1:110362/1‑149 (MQ=255) ccccTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGG‑CACGGTAATggg > 1:376698/1‑149 (MQ=255) cTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCg > 1:287084/1‑149 (MQ=255) ggAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAg < 6:136845/149‑1 (MQ=255) ggAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAg > 6:180843/1‑149 (MQ=255) cAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGACCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCat > 7:37753/1‑147 (MQ=255) aaCGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAggg > 3:83900/1‑149 (MQ=255) gCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGG‑CACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAg < 2:376698/149‑1 (MQ=255) aTCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAgg < 5:180843/149‑1 (MQ=255) cGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGcc < 3:298725/148‑1 (MQ=255) gCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGc > 4:314161/1‑149 (MQ=255) cACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCt > 7:214527/1‑149 (MQ=255) ggACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTc > 1:261668/1‑148 (MQ=255) tctGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTg > 6:307228/1‑148 (MQ=255) tgctgATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGc < 1:205485/147‑1 (MQ=255) tgctgATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGc > 6:227647/1‑147 (MQ=255) ctgATCATCCTCGACGGGCGTATCCTTCACTAGCGCTAGACCGCGACCACCAGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCaa < 4:315269/147‑1 (MQ=255) ctgATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGa < 1:304062/149‑1 (MQ=255) tgATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTATTGAGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGATTCCAGCTGCAAGAc > 3:247053/1‑149 (MQ=255) gATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGAcc > 5:304602/1‑149 (MQ=255) ctccGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCTGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggg > 2:376560‑M2/2‑146 (MQ=255) atcCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCgg > 3:114824‑M2/1‑146 (MQ=255) tcCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGTGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggt < 2:376986‑M2/148‑4 (MQ=255) tcCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggt < 4:155668‑M2/148‑4 (MQ=255) ccGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggt < 7:89129‑M2/147‑4 (MQ=255) cgcgACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtca > 5:135891‑M2/1‑143 (MQ=255) cgACGTGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCTCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgtccaggtcaggt < 4:267301‑M1/149‑86 (MQ=255) aCGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAAGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGc < 6:119940/149‑1 (MQ=255) gCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTc > 5:122400/1‑148 (MQ=255) cGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTa < 2:287084/149‑1 (MQ=255) cGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTa < 8:63953/149‑1 (MQ=255) ctccACGAGCGCTACACCGCGTCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCcccc > 4:91207/1‑149 (MQ=255) ctccACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCAcc > 6:333135/1‑149 (MQ=255) cACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCAccc < 5:295642/147‑1 (MQ=255) cACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCAt > 5:317827/1‑149 (MQ=255) tACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGccca > 6:78834/1‑149 (MQ=255) cacCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccacc > 7:280106/1‑149 (MQ=255) acCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCAt < 3:313075/137‑1 (MQ=255) acCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCAt > 4:313075/1‑137 (MQ=255) acCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccaccc > 5:14563/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcg < 8:250849‑M1/123‑89 (MQ=255) ccGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcg > 7:250849‑M1/1‑35 (MQ=255) ccGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccaccca < 5:236763/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccacc > 1:223861/1‑147 (MQ=255) cgcgCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAg < 6:328750/149‑1 (MQ=255) tccACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGt < 3:91207/148‑1 (MQ=255) ccACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTg > 7:300484/1‑149 (MQ=255) cACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTgc < 2:251155/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTgcg > 5:235325/1‑149 (MQ=255) cccGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTgcgc > 4:318164/1‑149 (MQ=255) cgccACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCg < 6:142160/149‑1 (MQ=255) cgccACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCg < 2:261668/149‑1 (MQ=255) cACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGAcc > 7:130930/1‑149 (MQ=255) aCCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccaccca < 8:326474/129‑1 (MQ=255) aCCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGcccaccca > 7:326474/1‑129 (MQ=255) ccGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctg < 2:223861/149‑1 (MQ=255) ccGCGCACCGGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGGACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctg < 4:190224/149‑1 (MQ=255) cgcgCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctgc > 1:182242/1‑149 (MQ=255) cgcgCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctgc < 2:182242/149‑1 (MQ=255) gcgcACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctgct < 3:318164/149‑1 (MQ=255) gcgcACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctgct > 4:74133/1‑149 (MQ=255) cgcACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcgg > 7:250849‑M2/1‑88 (MQ=255) cgcACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcgg < 8:250849‑M2/123‑36 (MQ=255) cgcACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACctgctg < 1:220269/149‑1 (MQ=255) acctgacctgGACGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCggtcaggtgcgaggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcacgtcg < 4:267301‑M2/149‑65 (MQ=255) cctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACt > 4:10155/1‑149 (MQ=255) ctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCg > 6:16088/1‑136 (MQ=255) ctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCg < 5:16088/136‑1 (MQ=255) ctgacctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTg < 3:74133/149‑1 (MQ=255) tGACCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcg > 5:135891‑M1/1‑5 (MQ=255) cccgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttacagaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcggag > 2:376560‑M1/2‑3 (MQ=255) aCCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcgga < 4:155668‑M1/148‑146 (MQ=255) aCCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcgg < 7:89129‑M1/147‑145 (MQ=255) aCCgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcacggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcgga < 2:376986‑M1/148‑146 (MQ=255) ccgggtcttgcagctggaagcggccttcgccctgggctacgcccattaccgtggccagtacgctcttgcttaccgaccaggtcaggtgcgcggtggcggcgcgggtgggcgcggtgtagcgctcgtggaggatacgcccgtcgcggat > 3:114824‑M1/1‑2 (MQ=255) ctgGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGc > 3:166224/1‑147 (MQ=255) | CAGGCCGTCGATGCCTACGCCTTTCCTGCACGCTCCCCCTCGGAGCGCAACGGCATCCGCACGGACGCTCTGCTGATCATCCGCGACGGGCGTATCCTCCACGAGCGCTACACCGCGCCCACCCGCGCCGCCACCGCGCACCTGACCTGGTCGGTAAGCAAGAGCGTACTGGCCACGGTAATGGGCGTAGCCCAGGGCGAAGGCCGCTTCCAGCTGCAAGACCCGGTCAGCCGCTTCTATCCACCCATGCGCGCCCACCCAGGCGTGCGCGTTGCCGACCTGCTGCACTGGGC > NC_002947/1032066‑1032358 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |